FuNGI

C4R7G5

Protein Details

Accession

C4R7G5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-106	LNGSNRAKSKKQKSTSKGDIAM	Hydrophilic
398-420	VFGATNRYKRNNKKLFKGHNTAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.833, cyto 6, cyto_mito 3.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0034399 C:nuclear periphery GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0000386 F:second spliceosomal transesterification activity GO:0000350 P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step GO:0000389 P:mRNA 3'-splice site recognition GO:0000348 P:mRNA branch site recognition
KEGG	ppa:PAS_chr4_0942 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MDIGYSSEDSHDGPEESKTEVIIPKDVITDVLTELDEPSTAFTVSTVKPLYEVPEETNRKFNPFQREAVDAVTFKLQKRSFNSQLNGSNRAKSKKQKSTSKGDIAMVEGPNRYKGSWGSSSDESEPYSYSEPEEINSKPDYEKTVQLTAKPLEDESSVIYSKEPFMHIPRGVGVDLTNEPGTRECFVPKKRIFQWEGHKRGTNKLQFFPNSGHLLLSGGNDSSVLLWDVYHNRSLLQGYYGHTKPVKDISFNNNGTQFVSCSYDKTVKLWDTETGKCSNKIKLASFPNVIKLNPNSDKQNELLIGLTDRKIQHYDLRSNEIIQTYDHHLGGINSITFVNENRNFMTSSDDKTVLVWDFQINAPIRFISDPHQHSMPQIALHPAGKFVAAQSMNNTIVVFGATNRYKRNNKKLFKGHNTAGYSIGLAFSPDGKILGSGDTYGNAYFWDWKTSRLVTKLKLDSKPLSCIDIHPQETSKVAIAGLSGKIHYLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.19
4	0.19
5	0.17
6	0.19
7	0.22
8	0.23
9	0.24
10	0.24
11	0.22
12	0.24
13	0.23
14	0.2
15	0.16
16	0.16
17	0.13
18	0.13
19	0.12
20	0.11
21	0.11
22	0.11
23	0.1
24	0.08
25	0.1
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.13
31	0.14
32	0.2
33	0.19
34	0.17
35	0.19
36	0.2
37	0.24
38	0.23
39	0.24
40	0.23
41	0.33
42	0.39
43	0.4
44	0.48
45	0.45
46	0.47
47	0.5
48	0.52
49	0.52
50	0.51
51	0.53
52	0.48
53	0.5
54	0.45
55	0.42
56	0.39
57	0.28
58	0.25
59	0.27
60	0.26
61	0.24
62	0.32
63	0.32
64	0.35
65	0.42
66	0.5
67	0.53
68	0.59
69	0.61
70	0.59
71	0.65
72	0.63
73	0.64
74	0.56
75	0.54
76	0.51
77	0.54
78	0.55
79	0.57
80	0.63
81	0.65
82	0.73
83	0.77
84	0.78
85	0.82
86	0.84
87	0.81
88	0.74
89	0.66
90	0.57
91	0.49
92	0.46
93	0.37
94	0.3
95	0.23
96	0.2
97	0.21
98	0.21
99	0.19
100	0.16
101	0.17
102	0.21
103	0.25
104	0.28
105	0.3
106	0.31
107	0.34
108	0.34
109	0.33
110	0.28
111	0.23
112	0.21
113	0.18
114	0.18
115	0.15
116	0.14
117	0.15
118	0.14
119	0.14
120	0.17
121	0.15
122	0.16
123	0.17
124	0.17
125	0.16
126	0.17
127	0.22
128	0.21
129	0.26
130	0.26
131	0.33
132	0.33
133	0.33
134	0.36
135	0.32
136	0.31
137	0.27
138	0.23
139	0.17
140	0.17
141	0.16
142	0.12
143	0.14
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.14
150	0.13
151	0.13
152	0.16
153	0.22
154	0.22
155	0.22
156	0.22
157	0.22
158	0.2
159	0.18
160	0.14
161	0.11
162	0.11
163	0.13
164	0.12
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.13
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.2
173	0.24
174	0.34
175	0.36
176	0.42
177	0.46
178	0.53
179	0.53
180	0.53
181	0.6
182	0.61
183	0.64
184	0.6
185	0.6
186	0.53
187	0.56
188	0.58
189	0.54
190	0.47
191	0.45
192	0.47
193	0.44
194	0.44
195	0.4
196	0.35
197	0.31
198	0.27
199	0.22
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.12
204	0.08
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.06
215	0.08
216	0.1
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.16
227	0.16
228	0.17
229	0.18
230	0.18
231	0.18
232	0.22
233	0.22
234	0.18
235	0.22
236	0.26
237	0.34
238	0.35
239	0.35
240	0.3
241	0.29
242	0.28
243	0.24
244	0.18
245	0.11
246	0.14
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.18
251	0.18
252	0.19
253	0.22
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.22
258	0.22
259	0.24
260	0.25
261	0.25
262	0.26
263	0.28
264	0.29
265	0.28
266	0.28
267	0.3
268	0.29
269	0.31
270	0.35
271	0.36
272	0.37
273	0.34
274	0.35
275	0.33
276	0.32
277	0.28
278	0.25
279	0.28
280	0.28
281	0.3
282	0.29
283	0.29
284	0.31
285	0.28
286	0.29
287	0.22
288	0.18
289	0.16
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.11
294	0.12
295	0.13
296	0.14
297	0.15
298	0.16
299	0.21
300	0.26
301	0.32
302	0.31
303	0.37
304	0.36
305	0.35
306	0.35
307	0.3
308	0.25
309	0.18
310	0.18
311	0.17
312	0.19
313	0.18
314	0.16
315	0.15
316	0.15
317	0.16
318	0.14
319	0.09
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.15
326	0.16
327	0.18
328	0.18
329	0.2
330	0.21
331	0.2
332	0.26
333	0.2
334	0.22
335	0.24
336	0.23
337	0.22
338	0.22
339	0.24
340	0.18
341	0.16
342	0.13
343	0.1
344	0.12
345	0.12
346	0.18
347	0.17
348	0.16
349	0.17
350	0.16
351	0.17
352	0.15
353	0.16
354	0.16
355	0.24
356	0.26
357	0.29
358	0.31
359	0.3
360	0.3
361	0.32
362	0.27
363	0.2
364	0.18
365	0.17
366	0.18
367	0.19
368	0.19
369	0.16
370	0.15
371	0.13
372	0.12
373	0.1
374	0.15
375	0.15
376	0.15
377	0.17
378	0.21
379	0.21
380	0.21
381	0.21
382	0.13
383	0.12
384	0.12
385	0.1
386	0.06
387	0.14
388	0.17
389	0.21
390	0.26
391	0.34
392	0.44
393	0.54
394	0.64
395	0.67
396	0.71
397	0.78
398	0.84
399	0.87
400	0.87
401	0.85
402	0.78
403	0.76
404	0.71
405	0.62
406	0.53
407	0.43
408	0.34
409	0.25
410	0.21
411	0.12
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.1
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.09
430	0.1
431	0.15
432	0.16
433	0.23
434	0.22
435	0.25
436	0.3
437	0.35
438	0.4
439	0.42
440	0.48
441	0.45
442	0.55
443	0.61
444	0.64
445	0.64
446	0.64
447	0.64
448	0.62
449	0.63
450	0.55
451	0.49
452	0.42
453	0.4
454	0.43
455	0.43
456	0.42
457	0.38
458	0.38
459	0.37
460	0.37
461	0.36
462	0.28
463	0.2
464	0.17
465	0.14
466	0.13
467	0.15
468	0.16
469	0.15
470	0.14

C4R7G5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer