Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SHN2

Protein Details
Accession A0A1V8SHN2    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-140KEVREGVKARKARKRAKLGLSPRPRPRVABasic
167-188DANQPRKRVKLAPPPKKKGIARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-138REGVKARKARKRAKLGLSPRPRPR
171-193PRKRVKLAPPPKKKGIARAKVKE
274-278RKPGR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MATNRTAPFQTVDSSDDSISIRTLTASESEQDYYVEKILAEEEFILGTGVIVKYLIKWKKWPIQASTFEPEGNLHDDGQMLETWAGEKQRIEAGEREPFDVDAWEIEHERWKEVREGVKARKARKRAKLGLSPRPRPRVAAPAASDGDDSDAADGLFVDDGQRDELDANQPRKRVKLAPPPKKKGIARAKVKEVKHEESSESGDDESSDDVPLQSRVAPKKATAVRAPAVPTMNRQEAMNGDSARSNNIRTGSAELTTRPKATTDAQTEQPVRRKPGRPKLAGLSKQPQATKTPTSIFANWNVEASNTRKARTKSSTDPREMRFTNLSEQSRFHKSAAMEKAPDPSKLQMLDLSRPAPRAVMISNGKSAPQSVSEALPPFTAPIPTATTVPLDGLTRNAEAVLGTAATSNNRSSAQRQASLNGADLPVSATTDTPAVTTRRSSTQRERTSLPSADEPASATTEIPAVFGRRSPPRGERARSITPPETDRQDSIVLRDNFKTHTCRDWKKTGSCPHGSKCYFAHYDVPNSAPGRSMSTTSAGQGPAISLPPDPSKYRTQRCSRWAAGFCEFGDNCHFRHEDHSAPIRKVSAPPGATLPREVSGVPGRHEKQRIECLFWRKGHCNRSDAACEYAHAKTGFYLDHPNDKEVQADLSHACVSEAVYIDADRDGFPAQPYSRDVQQSNATSPVSRQSPPEQLPAPAPPANPPMPALTLSSTIPPHYTDGKQIECHYWRGPGECHYVESTCRYAHHRTGWYTEWAGSRQVLRDENTVVQVARGYDGDILMQDGSVHETPITSTANEQLAGDLHSALQGSTLEDMYAFTNPINLAISSSGKTAYVAIMLASTSQHDYDRVRHILGRQGELTMSSMVSAAQFRVHFADILKRSASQHHPSGPVVMGPEDGETVSKFAKACELHASAGIITSSDFTMLLFPSVSNDWQFVSKTSGTSHAALSFKLLPPLPDPIDAGIDHIEPTLSIKPDLKHSLAVSKELLDLNVEVLRKVAKGNLRRMFIMLPPSRNVENDVLRRIFLTPLKESDTPKVFTLLDGDEVWEKFLANYFKIGPFDAPCLLLIHPEIQLQDIAQLGLLLANTNTPMHYIGTQHSLHDDSEAPPIYQSQLIFPHGDLLLLTDETFTYDPFSTTQILKQATLINAGKVATHADYTTEVYIATSPNIRETLSDLARGGNPLHGELFRAFEAFAPIAWDTAVASHLVEATDLHSYAELSPTERTIHLVSWFGHYASGHARDHRRFSICGIESAEVEGRAMEWQKENGHCVVYTAGEFLVKLNRMKEAGEKAARV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.15
8 0.12
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.12
13 0.13
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.18
22 0.16
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.06
34 0.06
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.11
41 0.21
42 0.27
43 0.28
44 0.35
45 0.45
46 0.54
47 0.62
48 0.66
49 0.65
50 0.68
51 0.71
52 0.71
53 0.67
54 0.6
55 0.52
56 0.45
57 0.38
58 0.31
59 0.29
60 0.23
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.19
77 0.21
78 0.23
79 0.25
80 0.29
81 0.35
82 0.36
83 0.36
84 0.32
85 0.31
86 0.28
87 0.25
88 0.2
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.21
95 0.21
96 0.25
97 0.26
98 0.27
99 0.3
100 0.35
101 0.41
102 0.42
103 0.5
104 0.55
105 0.62
106 0.66
107 0.7
108 0.73
109 0.76
110 0.77
111 0.79
112 0.81
113 0.81
114 0.85
115 0.86
116 0.86
117 0.87
118 0.87
119 0.87
120 0.85
121 0.84
122 0.75
123 0.69
124 0.64
125 0.63
126 0.58
127 0.56
128 0.5
129 0.49
130 0.48
131 0.45
132 0.4
133 0.3
134 0.27
135 0.19
136 0.16
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.19
154 0.27
155 0.33
156 0.36
157 0.4
158 0.43
159 0.46
160 0.49
161 0.48
162 0.5
163 0.55
164 0.62
165 0.69
166 0.77
167 0.82
168 0.84
169 0.85
170 0.78
171 0.77
172 0.77
173 0.77
174 0.76
175 0.76
176 0.79
177 0.77
178 0.76
179 0.75
180 0.72
181 0.67
182 0.62
183 0.57
184 0.49
185 0.44
186 0.46
187 0.37
188 0.31
189 0.25
190 0.19
191 0.17
192 0.15
193 0.14
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.18
203 0.23
204 0.28
205 0.29
206 0.29
207 0.37
208 0.42
209 0.45
210 0.42
211 0.43
212 0.41
213 0.43
214 0.44
215 0.38
216 0.37
217 0.32
218 0.32
219 0.32
220 0.33
221 0.3
222 0.28
223 0.26
224 0.25
225 0.26
226 0.26
227 0.2
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.24
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.25
244 0.27
245 0.26
246 0.22
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.32
251 0.33
252 0.35
253 0.37
254 0.44
255 0.47
256 0.5
257 0.53
258 0.5
259 0.5
260 0.54
261 0.6
262 0.64
263 0.71
264 0.75
265 0.72
266 0.72
267 0.74
268 0.76
269 0.73
270 0.69
271 0.65
272 0.6
273 0.6
274 0.56
275 0.49
276 0.43
277 0.43
278 0.39
279 0.36
280 0.35
281 0.34
282 0.37
283 0.38
284 0.36
285 0.37
286 0.37
287 0.33
288 0.31
289 0.26
290 0.23
291 0.23
292 0.23
293 0.26
294 0.23
295 0.25
296 0.31
297 0.33
298 0.41
299 0.44
300 0.49
301 0.5
302 0.6
303 0.67
304 0.68
305 0.73
306 0.68
307 0.69
308 0.63
309 0.57
310 0.5
311 0.43
312 0.42
313 0.43
314 0.43
315 0.36
316 0.37
317 0.38
318 0.4
319 0.4
320 0.33
321 0.3
322 0.28
323 0.35
324 0.4
325 0.4
326 0.35
327 0.34
328 0.41
329 0.38
330 0.39
331 0.33
332 0.27
333 0.26
334 0.25
335 0.24
336 0.21
337 0.22
338 0.25
339 0.25
340 0.26
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.2
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.19
349 0.21
350 0.21
351 0.24
352 0.24
353 0.24
354 0.22
355 0.22
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.16
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.13
400 0.15
401 0.23
402 0.27
403 0.3
404 0.31
405 0.31
406 0.32
407 0.32
408 0.3
409 0.22
410 0.18
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.05
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.13
426 0.14
427 0.22
428 0.26
429 0.33
430 0.4
431 0.5
432 0.55
433 0.57
434 0.58
435 0.55
436 0.57
437 0.52
438 0.44
439 0.36
440 0.32
441 0.3
442 0.26
443 0.22
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.1
456 0.14
457 0.18
458 0.21
459 0.25
460 0.29
461 0.37
462 0.45
463 0.48
464 0.49
465 0.51
466 0.55
467 0.54
468 0.55
469 0.5
470 0.44
471 0.43
472 0.39
473 0.37
474 0.32
475 0.3
476 0.26
477 0.26
478 0.23
479 0.22
480 0.29
481 0.25
482 0.26
483 0.26
484 0.25
485 0.24
486 0.27
487 0.28
488 0.21
489 0.29
490 0.35
491 0.41
492 0.46
493 0.52
494 0.55
495 0.57
496 0.64
497 0.64
498 0.63
499 0.63
500 0.62
501 0.58
502 0.61
503 0.55
504 0.49
505 0.41
506 0.4
507 0.34
508 0.3
509 0.33
510 0.25
511 0.28
512 0.27
513 0.27
514 0.24
515 0.23
516 0.22
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.14
523 0.16
524 0.16
525 0.15
526 0.17
527 0.13
528 0.12
529 0.11
530 0.1
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.12
538 0.14
539 0.17
540 0.26
541 0.33
542 0.41
543 0.48
544 0.54
545 0.58
546 0.63
547 0.67
548 0.61
549 0.6
550 0.57
551 0.52
552 0.47
553 0.4
554 0.35
555 0.32
556 0.28
557 0.22
558 0.23
559 0.2
560 0.17
561 0.19
562 0.19
563 0.15
564 0.19
565 0.21
566 0.19
567 0.23
568 0.3
569 0.31
570 0.31
571 0.31
572 0.29
573 0.27
574 0.26
575 0.25
576 0.22
577 0.19
578 0.19
579 0.22
580 0.23
581 0.23
582 0.22
583 0.19
584 0.14
585 0.14
586 0.13
587 0.12
588 0.15
589 0.16
590 0.17
591 0.23
592 0.24
593 0.28
594 0.32
595 0.31
596 0.31
597 0.39
598 0.39
599 0.38
600 0.41
601 0.43
602 0.46
603 0.48
604 0.47
605 0.45
606 0.5
607 0.52
608 0.5
609 0.45
610 0.41
611 0.4
612 0.39
613 0.34
614 0.3
615 0.22
616 0.19
617 0.2
618 0.18
619 0.17
620 0.14
621 0.12
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.15
627 0.13
628 0.2
629 0.2
630 0.21
631 0.21
632 0.21
633 0.21
634 0.16
635 0.16
636 0.09
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.09
659 0.09
660 0.1
661 0.12
662 0.14
663 0.17
664 0.19
665 0.19
666 0.19
667 0.24
668 0.24
669 0.23
670 0.23
671 0.2
672 0.17
673 0.17
674 0.18
675 0.16
676 0.16
677 0.17
678 0.19
679 0.26
680 0.27
681 0.31
682 0.28
683 0.26
684 0.27
685 0.25
686 0.26
687 0.2
688 0.19
689 0.17
690 0.2
691 0.2
692 0.19
693 0.19
694 0.16
695 0.15
696 0.15
697 0.14
698 0.11
699 0.11
700 0.11
701 0.12
702 0.12
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.12
707 0.14
708 0.14
709 0.18
710 0.21
711 0.22
712 0.23
713 0.24
714 0.27
715 0.25
716 0.28
717 0.23
718 0.23
719 0.22
720 0.23
721 0.23
722 0.21
723 0.25
724 0.22
725 0.23
726 0.2
727 0.2
728 0.19
729 0.21
730 0.19
731 0.13
732 0.15
733 0.18
734 0.21
735 0.24
736 0.29
737 0.31
738 0.31
739 0.35
740 0.35
741 0.33
742 0.3
743 0.29
744 0.24
745 0.21
746 0.2
747 0.17
748 0.16
749 0.15
750 0.17
751 0.17
752 0.17
753 0.18
754 0.19
755 0.18
756 0.18
757 0.18
758 0.14
759 0.12
760 0.11
761 0.1
762 0.08
763 0.08
764 0.07
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.05
771 0.05
772 0.04
773 0.04
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.09
781 0.1
782 0.07
783 0.08
784 0.1
785 0.11
786 0.12
787 0.11
788 0.09
789 0.09
790 0.1
791 0.1
792 0.07
793 0.06
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.06
805 0.06
806 0.07
807 0.07
808 0.05
809 0.07
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.1
817 0.09
818 0.1
819 0.09
820 0.08
821 0.09
822 0.08
823 0.07
824 0.06
825 0.06
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.04
831 0.05
832 0.06
833 0.06
834 0.07
835 0.09
836 0.11
837 0.15
838 0.21
839 0.22
840 0.22
841 0.23
842 0.25
843 0.3
844 0.3
845 0.29
846 0.23
847 0.21
848 0.2
849 0.19
850 0.19
851 0.12
852 0.1
853 0.07
854 0.06
855 0.06
856 0.07
857 0.07
858 0.06
859 0.08
860 0.08
861 0.09
862 0.11
863 0.12
864 0.12
865 0.12
866 0.2
867 0.19
868 0.22
869 0.21
870 0.21
871 0.21
872 0.27
873 0.33
874 0.3
875 0.33
876 0.35
877 0.37
878 0.36
879 0.37
880 0.3
881 0.24
882 0.2
883 0.16
884 0.12
885 0.09
886 0.09
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.06
891 0.07
892 0.07
893 0.09
894 0.09
895 0.08
896 0.14
897 0.14
898 0.16
899 0.21
900 0.23
901 0.21
902 0.22
903 0.22
904 0.16
905 0.16
906 0.14
907 0.08
908 0.06
909 0.06
910 0.05
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.06
915 0.06
916 0.07
917 0.06
918 0.06
919 0.08
920 0.09
921 0.1
922 0.1
923 0.1
924 0.11
925 0.12
926 0.13
927 0.12
928 0.15
929 0.15
930 0.16
931 0.16
932 0.2
933 0.21
934 0.21
935 0.21
936 0.21
937 0.21
938 0.2
939 0.21
940 0.2
941 0.18
942 0.2
943 0.2
944 0.16
945 0.18
946 0.23
947 0.22
948 0.2
949 0.2
950 0.17
951 0.19
952 0.17
953 0.17
954 0.13
955 0.11
956 0.1
957 0.1
958 0.09
959 0.07
960 0.1
961 0.12
962 0.12
963 0.13
964 0.17
965 0.18
966 0.24
967 0.29
968 0.28
969 0.27
970 0.27
971 0.32
972 0.29
973 0.31
974 0.25
975 0.21
976 0.22
977 0.2
978 0.19
979 0.13
980 0.12
981 0.11
982 0.13
983 0.12
984 0.1
985 0.1
986 0.11
987 0.1
988 0.11
989 0.14
990 0.19
991 0.26
992 0.37
993 0.43
994 0.44
995 0.44
996 0.46
997 0.43
998 0.38
999 0.4
1000 0.35
1001 0.32
1002 0.31
1003 0.34
1004 0.33
1005 0.32
1006 0.34
1007 0.29
1008 0.32
1009 0.33
1010 0.38
1011 0.35
1012 0.33
1013 0.34
1014 0.31
1015 0.29
1016 0.25
1017 0.26
1018 0.23
1019 0.25
1020 0.3
1021 0.33
1022 0.35
1023 0.38
1024 0.4
1025 0.37
1026 0.34
1027 0.34
1028 0.29
1029 0.26
1030 0.26
1031 0.2
1032 0.17
1033 0.15
1034 0.16
1035 0.16
1036 0.16
1037 0.16
1038 0.13
1039 0.12
1040 0.1
1041 0.15
1042 0.17
1043 0.14
1044 0.17
1045 0.18
1046 0.21
1047 0.22
1048 0.23
1049 0.2
1050 0.19
1051 0.21
1052 0.2
1053 0.18
1054 0.16
1055 0.17
1056 0.16
1057 0.15
1058 0.14
1059 0.13
1060 0.12
1061 0.13
1062 0.13
1063 0.12
1064 0.12
1065 0.11
1066 0.11
1067 0.1
1068 0.08
1069 0.07
1070 0.07
1071 0.06
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.05
1075 0.05
1076 0.05
1077 0.06
1078 0.07
1079 0.07
1080 0.07
1081 0.09
1082 0.1
1083 0.11
1084 0.13
1085 0.14
1086 0.2
1087 0.21
1088 0.2
1089 0.21
1090 0.22
1091 0.2
1092 0.2
1093 0.19
1094 0.15
1095 0.21
1096 0.22
1097 0.19
1098 0.18
1099 0.19
1100 0.19
1101 0.19
1102 0.18
1103 0.15
1104 0.18
1105 0.2
1106 0.21
1107 0.2
1108 0.21
1109 0.19
1110 0.19
1111 0.15
1112 0.13
1113 0.12
1114 0.11
1115 0.12
1116 0.08
1117 0.08
1118 0.11
1119 0.11
1120 0.09
1121 0.11
1122 0.11
1123 0.12
1124 0.13
1125 0.15
1126 0.16
1127 0.17
1128 0.2
1129 0.23
1130 0.24
1131 0.23
1132 0.25
1133 0.27
1134 0.25
1135 0.31
1136 0.3
1137 0.24
1138 0.24
1139 0.23
1140 0.21
1141 0.17
1142 0.18
1143 0.12
1144 0.12
1145 0.11
1146 0.11
1147 0.13
1148 0.15
1149 0.16
1150 0.13
1151 0.12
1152 0.12
1153 0.13
1154 0.12
1155 0.12
1156 0.13
1157 0.13
1158 0.16
1159 0.18
1160 0.17
1161 0.16
1162 0.19
1163 0.25
1164 0.23
1165 0.25
1166 0.22
1167 0.23
1168 0.24
1169 0.25
1170 0.23
1171 0.18
1172 0.17
1173 0.16
1174 0.18
1175 0.16
1176 0.18
1177 0.17
1178 0.19
1179 0.16
1180 0.16
1181 0.15
1182 0.13
1183 0.17
1184 0.15
1185 0.14
1186 0.14
1187 0.14
1188 0.13
1189 0.13
1190 0.12
1191 0.08
1192 0.09
1193 0.09
1194 0.06
1195 0.06
1196 0.06
1197 0.07
1198 0.07
1199 0.07
1200 0.07
1201 0.08
1202 0.1
1203 0.1
1204 0.1
1205 0.1
1206 0.11
1207 0.11
1208 0.14
1209 0.13
1210 0.13
1211 0.15
1212 0.16
1213 0.18
1214 0.18
1215 0.2
1216 0.19
1217 0.21
1218 0.21
1219 0.23
1220 0.23
1221 0.26
1222 0.27
1223 0.24
1224 0.24
1225 0.21
1226 0.21
1227 0.24
1228 0.29
1229 0.26
1230 0.32
1231 0.41
1232 0.45
1233 0.52
1234 0.57
1235 0.55
1236 0.5
1237 0.5
1238 0.53
1239 0.46
1240 0.44
1241 0.41
1242 0.35
1243 0.31
1244 0.33
1245 0.32
1246 0.21
1247 0.19
1248 0.15
1249 0.12
1250 0.15
1251 0.17
1252 0.17
1253 0.18
1254 0.22
1255 0.29
1256 0.32
1257 0.35
1258 0.33
1259 0.33
1260 0.3
1261 0.28
1262 0.25
1263 0.21
1264 0.18
1265 0.16
1266 0.14
1267 0.12
1268 0.12
1269 0.12
1270 0.18
1271 0.2
1272 0.22
1273 0.23
1274 0.27
1275 0.27
1276 0.29
1277 0.35
1278 0.35
1279 0.41