Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TNN1

Protein Details
Accession A0A1V8TNN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-198GKVRTGLKRKLPKKLRNPAADEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-190GLKRKLPKKL
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019364  Mediatior_Med8_fun/met  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10232  Med8  
Amino Acid Sequences MSLTQADIRSFEQVRQRLVTTQQSLDLLRSKLINPQNREELDPLPPWPSLQESANSFVRNMDDLQKIMESSQELFKTAHAYPHATFPGTTFEGNLILARLLRKRVEPDVEAWIKEHTEDTKVQQWDQHRETGLQQDEQQRLLTYAGEENARVLEELVTKGAMDFDYTLAEYEEGVGKVRTGLKRKLPKKLRNPAADEDEDDEDDEDEEDSEDEDEEMEDVMPEAPVKLSALNDVKGLIPGAYAMRLDDVLKFVTMGARPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.4
4 0.38
5 0.43
6 0.46
7 0.42
8 0.39
9 0.37
10 0.36
11 0.35
12 0.34
13 0.33
14 0.25
15 0.23
16 0.23
17 0.21
18 0.27
19 0.35
20 0.4
21 0.4
22 0.46
23 0.52
24 0.52
25 0.55
26 0.49
27 0.43
28 0.39
29 0.35
30 0.3
31 0.25
32 0.23
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.2
40 0.25
41 0.28
42 0.28
43 0.24
44 0.23
45 0.22
46 0.2
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.11
57 0.11
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.19
64 0.18
65 0.2
66 0.17
67 0.2
68 0.19
69 0.24
70 0.25
71 0.21
72 0.2
73 0.17
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.22
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.29
96 0.29
97 0.28
98 0.25
99 0.22
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.23
111 0.26
112 0.31
113 0.32
114 0.32
115 0.26
116 0.26
117 0.27
118 0.29
119 0.26
120 0.2
121 0.22
122 0.25
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.18
127 0.17
128 0.17
129 0.13
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.15
166 0.2
167 0.24
168 0.3
169 0.38
170 0.49
171 0.55
172 0.64
173 0.69
174 0.74
175 0.79
176 0.83
177 0.83
178 0.81
179 0.81
180 0.76
181 0.72
182 0.64
183 0.54
184 0.47
185 0.39
186 0.32
187 0.26
188 0.2
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.15
217 0.18
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.15