Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SZK0

Protein Details
Accession A0A1V8SZK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-54VAPPPKLSPPRPKRAPSPPHEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-48FAKAKKATKLVAPPPKLSPPRPKRAP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSDSDSGLSSAPEEEIKKLAPIFAKAKKATKLVAPPPKLSPPRPKRAPSPPHEDTIADSHVIAFIVMFRSRFSSAFSTKLAHIGPQDLETGVAGEAPTREVESLLCAVLGLVMNRKKPVEHGHYGRALDEAVLSHKSQWPHRWQGANPLHGGKNFNNMPPEDRLYLIRTLIMWSLNSSELISAIIKDSYKQTRHSDDENQPLSVQPWGRDGDKRRYFLIEGQDDTTFRVYREANRYTKNFQWYNMAGNIDELRVLAEKLEKEDGSQVARTLGQRMLNAIPRFEASVEKRYRREYRQARRAAFTRPEPGFSSYEGRTRGKRMRYTYDDEEDSDATSTRRSNRHSERNTPAATGPQYTSSGRQVRPRQANGEYGTSGLANEVTSADELGQDGDSEDLGRGVARTTRGAMNGYAKRKRVLDDDDDDADLSEEDDLPQSGDEWNSDANAAEDEERVPAAANRPDDEDEDEDESEEGEQSLIVKLRIGPPQATKVDDEVVPKHLPEANGIATKPVVPDHASLDLRPYPSPLSMVEPATKHMLQPQQRSSAAIGLTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.19
4 0.21
5 0.2
6 0.24
7 0.23
8 0.28
9 0.34
10 0.39
11 0.47
12 0.49
13 0.56
14 0.57
15 0.58
16 0.55
17 0.55
18 0.57
19 0.59
20 0.64
21 0.62
22 0.59
23 0.61
24 0.68
25 0.67
26 0.66
27 0.67
28 0.67
29 0.73
30 0.78
31 0.79
32 0.78
33 0.82
34 0.84
35 0.8
36 0.8
37 0.73
38 0.68
39 0.63
40 0.54
41 0.47
42 0.41
43 0.35
44 0.26
45 0.22
46 0.18
47 0.17
48 0.16
49 0.12
50 0.07
51 0.07
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.15
57 0.18
58 0.18
59 0.21
60 0.24
61 0.26
62 0.29
63 0.3
64 0.29
65 0.28
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.12
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.07
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.22
103 0.21
104 0.26
105 0.34
106 0.36
107 0.41
108 0.45
109 0.49
110 0.53
111 0.53
112 0.48
113 0.4
114 0.31
115 0.23
116 0.17
117 0.11
118 0.09
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.16
123 0.19
124 0.25
125 0.32
126 0.38
127 0.45
128 0.51
129 0.55
130 0.52
131 0.6
132 0.61
133 0.56
134 0.5
135 0.45
136 0.41
137 0.37
138 0.41
139 0.3
140 0.32
141 0.31
142 0.31
143 0.3
144 0.29
145 0.3
146 0.3
147 0.33
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.23
152 0.24
153 0.21
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.1
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.13
175 0.2
176 0.22
177 0.27
178 0.31
179 0.36
180 0.4
181 0.44
182 0.48
183 0.48
184 0.54
185 0.51
186 0.46
187 0.4
188 0.36
189 0.32
190 0.27
191 0.21
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.23
197 0.28
198 0.36
199 0.41
200 0.42
201 0.4
202 0.41
203 0.4
204 0.39
205 0.41
206 0.33
207 0.28
208 0.28
209 0.27
210 0.25
211 0.25
212 0.22
213 0.15
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.19
218 0.26
219 0.32
220 0.35
221 0.39
222 0.42
223 0.43
224 0.47
225 0.48
226 0.42
227 0.36
228 0.37
229 0.33
230 0.33
231 0.31
232 0.27
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.12
237 0.11
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.2
264 0.2
265 0.18
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.16
271 0.13
272 0.22
273 0.27
274 0.3
275 0.33
276 0.39
277 0.45
278 0.45
279 0.53
280 0.55
281 0.61
282 0.67
283 0.72
284 0.68
285 0.66
286 0.63
287 0.59
288 0.53
289 0.45
290 0.43
291 0.35
292 0.35
293 0.33
294 0.34
295 0.29
296 0.26
297 0.27
298 0.21
299 0.24
300 0.25
301 0.26
302 0.24
303 0.3
304 0.35
305 0.38
306 0.43
307 0.45
308 0.49
309 0.53
310 0.58
311 0.57
312 0.54
313 0.48
314 0.42
315 0.39
316 0.31
317 0.25
318 0.18
319 0.14
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.2
325 0.24
326 0.33
327 0.42
328 0.52
329 0.57
330 0.63
331 0.64
332 0.65
333 0.63
334 0.55
335 0.46
336 0.4
337 0.34
338 0.28
339 0.22
340 0.17
341 0.19
342 0.18
343 0.2
344 0.23
345 0.28
346 0.29
347 0.37
348 0.42
349 0.49
350 0.57
351 0.58
352 0.56
353 0.52
354 0.55
355 0.49
356 0.45
357 0.35
358 0.28
359 0.24
360 0.19
361 0.16
362 0.1
363 0.08
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.19
394 0.25
395 0.3
396 0.38
397 0.41
398 0.41
399 0.43
400 0.43
401 0.44
402 0.42
403 0.41
404 0.4
405 0.38
406 0.41
407 0.39
408 0.38
409 0.35
410 0.28
411 0.22
412 0.15
413 0.11
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.14
442 0.19
443 0.2
444 0.21
445 0.24
446 0.26
447 0.27
448 0.29
449 0.26
450 0.24
451 0.26
452 0.24
453 0.21
454 0.2
455 0.18
456 0.14
457 0.12
458 0.09
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.19
468 0.24
469 0.26
470 0.28
471 0.31
472 0.39
473 0.4
474 0.4
475 0.36
476 0.33
477 0.33
478 0.32
479 0.31
480 0.25
481 0.28
482 0.26
483 0.24
484 0.25
485 0.25
486 0.23
487 0.22
488 0.24
489 0.24
490 0.27
491 0.27
492 0.25
493 0.23
494 0.23
495 0.21
496 0.18
497 0.17
498 0.15
499 0.17
500 0.19
501 0.26
502 0.26
503 0.26
504 0.3
505 0.31
506 0.31
507 0.3
508 0.29
509 0.24
510 0.24
511 0.26
512 0.22
513 0.24
514 0.26
515 0.28
516 0.3
517 0.28
518 0.3
519 0.35
520 0.34
521 0.28
522 0.32
523 0.38
524 0.41
525 0.5
526 0.54
527 0.55
528 0.55
529 0.57
530 0.51
531 0.47