Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SGQ5

Protein Details
Accession A0A1V8SGQ5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-40PTYWQHPSPRPTKPVPKPPVDKCAFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, extr 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR039279  QRT3-like  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MLDKYNKYTKYPGPSPTYWQHPSPRPTKPVPKPPVDKCAFWMENIKHQGVAAFNPSPSTYQVFRNVKDFGAQGDGVTDDTAAINNAISSGGRCGPQTCGPGTTTTSPAVVYFPSGTYMVNASIIDYYYTQIIGNPNCLPVIRAFATFTGGLGVIDGNQYGAHGLGWGSTNTFWRQIRNFVIDMTLVPASSAITGIHWPTAQATSLQNIVFNMSQEGGTQHQGFFIEEGSGGFMNDLTFYGGLNAITFGNQQFTVRNLTFYNAVTAINQIWDWGMTYYGISINNCSVGLNMAAGGPTAQSVGSMTFFDSSITNTPIGIITAHDATSQPLTAGSLIVENVALNNVPIAIQGPGATTALSGTTGQTTITGWGEGHSYTPNGPVNFEGPIVPNNRPANLLAGNRYYTRSKPQYQTYPVSSFVSARTSGATGNGHTDDTAALQRAIYAARAQSKVLYVDHGDYLVTSTIYVPSGSKIVGESYSVILSSGSFFNNVNKPQPVVQIGKNGESGSIEWSDMIVSTQGQQRGAVLFEYNLRASSSSPSGIWDVHSRIGGFAGSNLGLAECPKTPTVNVTSANLNQNCIAAFMHFHVTKQSSGLYLENVWLWTADHDVEDPALTQITVYTGRGMLVESSGPVWLVGTAVEHNVLYEYQFVKASNVFGGQMQIETAYYQPNPPAPIPFPYVASLNDPQFTVATITADGYVIPASEGWGLRIIDSSNLLFYGVGLYSFFNNYSTACSNQGAGETCQNHIFSLEGRNSGISLYNLNTVGTHYQITIDGKEVAYYADNANGFISTVALFRNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.63
4 0.65
5 0.59
6 0.59
7 0.6
8 0.61
9 0.67
10 0.68
11 0.7
12 0.69
13 0.74
14 0.78
15 0.79
16 0.81
17 0.82
18 0.84
19 0.84
20 0.83
21 0.85
22 0.78
23 0.69
24 0.62
25 0.64
26 0.54
27 0.47
28 0.49
29 0.42
30 0.47
31 0.5
32 0.47
33 0.37
34 0.36
35 0.36
36 0.28
37 0.28
38 0.24
39 0.21
40 0.2
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.25
46 0.21
47 0.24
48 0.35
49 0.39
50 0.4
51 0.43
52 0.42
53 0.38
54 0.39
55 0.34
56 0.25
57 0.24
58 0.22
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.19
82 0.25
83 0.28
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.28
88 0.31
89 0.29
90 0.26
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.1
118 0.16
119 0.16
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.2
125 0.19
126 0.14
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.2
133 0.18
134 0.17
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.12
157 0.13
158 0.2
159 0.2
160 0.25
161 0.27
162 0.32
163 0.36
164 0.38
165 0.36
166 0.31
167 0.31
168 0.25
169 0.22
170 0.19
171 0.14
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.08
372 0.11
373 0.13
374 0.13
375 0.19
376 0.19
377 0.19
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.2
382 0.2
383 0.15
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.18
389 0.16
390 0.22
391 0.27
392 0.31
393 0.35
394 0.4
395 0.45
396 0.49
397 0.51
398 0.48
399 0.44
400 0.4
401 0.36
402 0.31
403 0.24
404 0.2
405 0.18
406 0.13
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.12
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.15
437 0.14
438 0.14
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.07
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.12
475 0.17
476 0.19
477 0.21
478 0.21
479 0.22
480 0.22
481 0.25
482 0.25
483 0.24
484 0.24
485 0.28
486 0.28
487 0.29
488 0.28
489 0.25
490 0.21
491 0.18
492 0.17
493 0.12
494 0.11
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.05
502 0.04
503 0.07
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.14
511 0.12
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.13
522 0.13
523 0.12
524 0.12
525 0.13
526 0.14
527 0.14
528 0.15
529 0.16
530 0.16
531 0.16
532 0.17
533 0.16
534 0.14
535 0.15
536 0.13
537 0.09
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.14
553 0.18
554 0.21
555 0.22
556 0.22
557 0.24
558 0.28
559 0.35
560 0.31
561 0.28
562 0.24
563 0.23
564 0.21
565 0.19
566 0.15
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.15
571 0.14
572 0.15
573 0.18
574 0.19
575 0.19
576 0.2
577 0.19
578 0.14
579 0.15
580 0.16
581 0.13
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.12
586 0.11
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.05
602 0.05
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.1
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.05
622 0.04
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.07
632 0.1
633 0.1
634 0.11
635 0.13
636 0.13
637 0.14
638 0.15
639 0.16
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.12
644 0.13
645 0.12
646 0.11
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.1
654 0.12
655 0.14
656 0.17
657 0.2
658 0.21
659 0.25
660 0.24
661 0.27
662 0.31
663 0.29
664 0.28
665 0.26
666 0.27
667 0.24
668 0.27
669 0.27
670 0.24
671 0.24
672 0.22
673 0.21
674 0.19
675 0.19
676 0.15
677 0.12
678 0.11
679 0.1
680 0.11
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.06
690 0.09
691 0.09
692 0.1
693 0.14
694 0.14
695 0.14
696 0.16
697 0.15
698 0.14
699 0.16
700 0.16
701 0.12
702 0.12
703 0.12
704 0.1
705 0.09
706 0.1
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.16
718 0.18
719 0.19
720 0.21
721 0.21
722 0.21
723 0.22
724 0.25
725 0.22
726 0.21
727 0.27
728 0.25
729 0.27
730 0.29
731 0.29
732 0.25
733 0.23
734 0.21
735 0.16
736 0.22
737 0.23
738 0.22
739 0.22
740 0.22
741 0.22
742 0.22
743 0.22
744 0.15
745 0.15
746 0.15
747 0.18
748 0.18
749 0.18
750 0.17
751 0.17
752 0.18
753 0.18
754 0.17
755 0.13
756 0.14
757 0.17
758 0.2
759 0.18
760 0.19
761 0.19
762 0.18
763 0.18
764 0.17
765 0.15
766 0.14
767 0.15
768 0.13
769 0.16
770 0.16
771 0.16
772 0.17
773 0.15
774 0.14
775 0.12
776 0.12
777 0.07
778 0.08