Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SMX3

Protein Details
Accession A0A1V8SMX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-180LGKPDRRDKRRLSPGRLSVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-172KHKEKEDLLGKPDRRDKRRL
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
Amino Acid Sequences MSAVLMTNVDKKLLRTTKFPPEFDKKVDMEKVNVPVIKKWVADEIARILNSDDDIVAELVYNVLEESRYPKIKELQILITGFLDKDAPKFSKDLWKLLLSAQNGAKGVPQELLEAKKQELEQQQAEEEKAKQEAVKRQQAEQERERELARMEKHKEKEDLLGKPDRRDKRRLSPGRLSVASSRSETPQQKAGSSVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.44
4 0.53
5 0.59
6 0.6
7 0.58
8 0.59
9 0.61
10 0.6
11 0.6
12 0.5
13 0.5
14 0.54
15 0.48
16 0.42
17 0.42
18 0.42
19 0.4
20 0.4
21 0.35
22 0.31
23 0.33
24 0.33
25 0.28
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.18
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.09
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.04
48 0.04
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.04
53 0.08
54 0.13
55 0.16
56 0.17
57 0.2
58 0.26
59 0.29
60 0.32
61 0.31
62 0.28
63 0.29
64 0.29
65 0.26
66 0.21
67 0.18
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.06
72 0.07
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.22
79 0.23
80 0.25
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.28
86 0.19
87 0.21
88 0.19
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.11
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.1
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.14
105 0.19
106 0.22
107 0.24
108 0.24
109 0.24
110 0.25
111 0.24
112 0.25
113 0.21
114 0.17
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.18
120 0.26
121 0.32
122 0.4
123 0.4
124 0.41
125 0.48
126 0.54
127 0.56
128 0.54
129 0.52
130 0.46
131 0.46
132 0.44
133 0.39
134 0.33
135 0.33
136 0.31
137 0.33
138 0.37
139 0.43
140 0.48
141 0.52
142 0.53
143 0.48
144 0.51
145 0.5
146 0.49
147 0.46
148 0.5
149 0.48
150 0.52
151 0.6
152 0.61
153 0.6
154 0.64
155 0.66
156 0.68
157 0.77
158 0.79
159 0.79
160 0.79
161 0.81
162 0.8
163 0.73
164 0.65
165 0.59
166 0.52
167 0.46
168 0.39
169 0.34
170 0.3
171 0.37
172 0.39
173 0.38
174 0.42
175 0.41
176 0.39
177 0.4
178 0.38