Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SWN4

Protein Details
Accession A0A1V8SWN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-179AYSKAKYSLRKAKKYLKRFTVHydrophilic
363-391QTYKSGKKGTYYKKRRRWARCKAIVDNARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-379KKRRR
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 11, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MAPSYGRTLPNTYVFLRLPSDIVKLIELKPNTIIEVGKYGTFSSNLLIGRPYYTTFEILDKREGEAHVRLRYVPAKELNAEVVAEYDAEVKDGDVGSETVDLDEERVAAVEKDNRLTMDNATRQNLSHLEIEELKQTASGREIIDTIMANHNALDEKTAYSKAKYSLRKAKKYLKRFTVLPMEIGTLQDYVREKEPGRILEMREESLALITAWSNAHFSEALTGASADAQSGRWLAVDDSGGLIVAALAERMGILRKDEAEANVVSGSQDGDHSMPDAPAPTEDGPSHRDFPLPAASNTITNLHSMVQQNVSLLKFFGYDSNTPDTDHPLHDRLLPISWLQLLHPDQDPTYREPEVVNEGTLQTYKSGKKGTYYKKRRRWARCKAIVDNARAGGFEGLVMASHMDPANTLAHLIPLIRGGGHVVIYSPVIEPLVSLMDLYSRERRAAYISALSQRPDEVPSTEDFPLDPRLLLAPTLQTSRIREWQVLPGRTHPLMTSKGGSEGFVFTARRVIPLEGGVEARGNFGRKRKAPGDTGGTVGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.29
5 0.25
6 0.24
7 0.25
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.24
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.27
19 0.25
20 0.23
21 0.17
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.13
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.34
47 0.3
48 0.3
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.32
53 0.35
54 0.34
55 0.34
56 0.33
57 0.35
58 0.4
59 0.38
60 0.37
61 0.36
62 0.35
63 0.35
64 0.36
65 0.33
66 0.28
67 0.25
68 0.19
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.1
97 0.14
98 0.16
99 0.18
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.26
106 0.3
107 0.32
108 0.33
109 0.33
110 0.32
111 0.34
112 0.31
113 0.26
114 0.22
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.19
149 0.23
150 0.3
151 0.35
152 0.42
153 0.5
154 0.58
155 0.66
156 0.71
157 0.76
158 0.77
159 0.81
160 0.82
161 0.79
162 0.73
163 0.66
164 0.65
165 0.64
166 0.55
167 0.46
168 0.37
169 0.3
170 0.26
171 0.25
172 0.19
173 0.1
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.16
181 0.21
182 0.26
183 0.24
184 0.27
185 0.29
186 0.28
187 0.31
188 0.32
189 0.27
190 0.23
191 0.22
192 0.18
193 0.14
194 0.14
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.14
273 0.16
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.17
279 0.22
280 0.21
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.19
285 0.2
286 0.2
287 0.13
288 0.11
289 0.12
290 0.09
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.15
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.22
313 0.2
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.21
320 0.17
321 0.16
322 0.15
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.13
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.19
335 0.21
336 0.18
337 0.22
338 0.2
339 0.19
340 0.19
341 0.2
342 0.22
343 0.2
344 0.18
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.13
350 0.09
351 0.13
352 0.14
353 0.17
354 0.2
355 0.2
356 0.27
357 0.36
358 0.45
359 0.52
360 0.62
361 0.69
362 0.76
363 0.85
364 0.89
365 0.9
366 0.9
367 0.9
368 0.9
369 0.9
370 0.87
371 0.83
372 0.83
373 0.78
374 0.7
375 0.62
376 0.52
377 0.42
378 0.35
379 0.3
380 0.2
381 0.13
382 0.09
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.09
426 0.13
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.2
431 0.21
432 0.23
433 0.25
434 0.24
435 0.23
436 0.26
437 0.31
438 0.33
439 0.33
440 0.29
441 0.28
442 0.26
443 0.24
444 0.22
445 0.17
446 0.17
447 0.18
448 0.22
449 0.21
450 0.2
451 0.18
452 0.18
453 0.21
454 0.2
455 0.18
456 0.14
457 0.15
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.18
464 0.2
465 0.22
466 0.25
467 0.3
468 0.37
469 0.36
470 0.37
471 0.38
472 0.45
473 0.51
474 0.52
475 0.49
476 0.46
477 0.5
478 0.47
479 0.45
480 0.37
481 0.33
482 0.32
483 0.32
484 0.3
485 0.25
486 0.29
487 0.28
488 0.27
489 0.23
490 0.21
491 0.19
492 0.2
493 0.2
494 0.16
495 0.22
496 0.21
497 0.22
498 0.23
499 0.22
500 0.2
501 0.22
502 0.23
503 0.18
504 0.19
505 0.17
506 0.17
507 0.16
508 0.17
509 0.17
510 0.2
511 0.23
512 0.3
513 0.4
514 0.43
515 0.52
516 0.56
517 0.6
518 0.62
519 0.65
520 0.65
521 0.57