Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SIX2

Protein Details
Accession A0A1V8SIX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-405KVPNGPHLKETRKKEKGKEKEEGKSERKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-409VPNGPHLKETRKKEKGKEKEEGKSERKAAKA
Subcellular Location(s) nucl 22, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKTKVQDARIALPGGKEKTAPKASQTARAQPSTLSADVVVESGSESDSGSEGGSGDSESEQEKRQNTTKPDIRRVKVTEPTIPAVPDDTSSEEENEGMGEEAELGSSSDDELPDVAAKATSKPQKSTVTTNGAKRKADDSSSSEDEAADDPKVLPDAPPQKKSRTEAQTTAPPSLPTQPLLAPPGYTRVPTLPTSSIPRSSLAGKQIWHITAPSHLPISALTEASFEVIEKGTPVLTHKSARYSLTALPSAAATTVLLPTSEGYTPVSQPISRTLQMREVVELPELSGKQASQVTGSEKAAEIKLPAISRVREQPRGLKMRYRPPGFGKGEAGRIGSGSESEDDEAEGPMADTGKGFRKAKGGDNAIPGVNGKSEVKVPNGPHLKETRKKEKGKEKEEGKSERKAAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.35
4 0.32
5 0.3
6 0.38
7 0.44
8 0.42
9 0.39
10 0.46
11 0.47
12 0.54
13 0.57
14 0.57
15 0.56
16 0.57
17 0.53
18 0.44
19 0.45
20 0.41
21 0.35
22 0.26
23 0.2
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.12
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.09
47 0.11
48 0.15
49 0.19
50 0.22
51 0.27
52 0.33
53 0.4
54 0.44
55 0.52
56 0.56
57 0.61
58 0.69
59 0.72
60 0.7
61 0.7
62 0.7
63 0.68
64 0.68
65 0.63
66 0.59
67 0.53
68 0.53
69 0.46
70 0.41
71 0.33
72 0.27
73 0.23
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.12
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.16
108 0.23
109 0.25
110 0.27
111 0.33
112 0.39
113 0.42
114 0.47
115 0.47
116 0.49
117 0.51
118 0.56
119 0.59
120 0.56
121 0.53
122 0.49
123 0.44
124 0.38
125 0.36
126 0.32
127 0.29
128 0.31
129 0.33
130 0.32
131 0.29
132 0.26
133 0.24
134 0.21
135 0.17
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.13
144 0.24
145 0.29
146 0.35
147 0.38
148 0.43
149 0.48
150 0.51
151 0.53
152 0.5
153 0.49
154 0.46
155 0.47
156 0.49
157 0.46
158 0.45
159 0.36
160 0.29
161 0.25
162 0.26
163 0.23
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.12
171 0.12
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.15
181 0.16
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.21
186 0.2
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.19
194 0.2
195 0.19
196 0.17
197 0.15
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.1
224 0.12
225 0.15
226 0.16
227 0.19
228 0.22
229 0.23
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.23
234 0.23
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.14
239 0.11
240 0.09
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.13
255 0.14
256 0.12
257 0.13
258 0.18
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.23
263 0.28
264 0.3
265 0.3
266 0.27
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.19
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.13
282 0.16
283 0.19
284 0.19
285 0.17
286 0.16
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.13
291 0.11
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.18
296 0.19
297 0.22
298 0.31
299 0.35
300 0.39
301 0.41
302 0.46
303 0.52
304 0.59
305 0.58
306 0.57
307 0.58
308 0.62
309 0.69
310 0.65
311 0.61
312 0.59
313 0.67
314 0.62
315 0.58
316 0.53
317 0.47
318 0.47
319 0.42
320 0.37
321 0.27
322 0.23
323 0.21
324 0.15
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.16
343 0.24
344 0.26
345 0.27
346 0.34
347 0.38
348 0.46
349 0.52
350 0.52
351 0.49
352 0.52
353 0.53
354 0.46
355 0.43
356 0.35
357 0.27
358 0.21
359 0.19
360 0.15
361 0.14
362 0.19
363 0.21
364 0.25
365 0.3
366 0.32
367 0.39
368 0.47
369 0.46
370 0.47
371 0.53
372 0.58
373 0.61
374 0.69
375 0.7
376 0.72
377 0.79
378 0.83
379 0.85
380 0.86
381 0.87
382 0.87
383 0.85
384 0.84
385 0.85
386 0.85
387 0.79
388 0.77
389 0.76