Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SWN1

Protein Details
Accession A0A1V8SWN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-74NLPERRKAERAERPRKKSSFWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-70RRKAERAERPRKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018306  Phage_T5_Orf172_DNA-bd  
Pfam View protein in Pfam  
PF10544  T5orf172  
Amino Acid Sequences METLKERGSVDTFLVRLGVEGRPPEQSAPRRPRAPLDRDQTRSSLSAQRPEQYNLPERRKAERAERPRKKSSFWSTLCCMGGSGDNDNYVEVVRHKRRKDGARWPDTPPQGRLDRPSGISRPSFQPNEPSRTSNATRRPRSNPPTRPSPQHVSSTASQTTSLLALIPKDLSPQTTSTLLSELSKPPNPLDEEGYIYIFWLTPSTTTTPPESTARDLLSTPARPSQGRRISDVLSAYSDAGDTPTSENMVLLKIGRANNVYRRMTEWQRQCGYALTLLRWYPHVPSSSHPSSPAASPPPSASRMPPNRQSPQPQLYPDLSRPIPRRDSSAVRKVPQVKKVERLVHLELADRQVKQKCTVCGRDHKEWFSIAATEKGVRGVDEVVRRWVGWAEDQGQDQRQEVYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.14
7 0.17
8 0.18
9 0.21
10 0.23
11 0.26
12 0.33
13 0.39
14 0.47
15 0.54
16 0.61
17 0.63
18 0.65
19 0.71
20 0.72
21 0.71
22 0.7
23 0.7
24 0.71
25 0.71
26 0.72
27 0.64
28 0.57
29 0.51
30 0.45
31 0.45
32 0.4
33 0.43
34 0.43
35 0.47
36 0.48
37 0.49
38 0.5
39 0.48
40 0.53
41 0.54
42 0.58
43 0.58
44 0.58
45 0.61
46 0.62
47 0.61
48 0.62
49 0.63
50 0.66
51 0.71
52 0.79
53 0.8
54 0.84
55 0.82
56 0.76
57 0.76
58 0.74
59 0.73
60 0.67
61 0.65
62 0.58
63 0.6
64 0.56
65 0.45
66 0.36
67 0.26
68 0.26
69 0.21
70 0.21
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.21
80 0.3
81 0.38
82 0.4
83 0.48
84 0.57
85 0.65
86 0.7
87 0.72
88 0.73
89 0.74
90 0.76
91 0.74
92 0.73
93 0.71
94 0.65
95 0.56
96 0.52
97 0.47
98 0.46
99 0.45
100 0.41
101 0.37
102 0.36
103 0.39
104 0.35
105 0.35
106 0.34
107 0.33
108 0.33
109 0.37
110 0.36
111 0.32
112 0.39
113 0.41
114 0.46
115 0.45
116 0.43
117 0.38
118 0.42
119 0.45
120 0.43
121 0.48
122 0.51
123 0.56
124 0.6
125 0.64
126 0.68
127 0.73
128 0.75
129 0.75
130 0.7
131 0.73
132 0.71
133 0.71
134 0.68
135 0.66
136 0.59
137 0.54
138 0.5
139 0.44
140 0.42
141 0.4
142 0.34
143 0.27
144 0.23
145 0.19
146 0.18
147 0.13
148 0.11
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.06
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.19
209 0.19
210 0.22
211 0.3
212 0.34
213 0.34
214 0.36
215 0.36
216 0.36
217 0.37
218 0.34
219 0.25
220 0.18
221 0.17
222 0.13
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.17
244 0.24
245 0.32
246 0.32
247 0.29
248 0.32
249 0.37
250 0.41
251 0.46
252 0.46
253 0.46
254 0.47
255 0.47
256 0.44
257 0.39
258 0.34
259 0.3
260 0.25
261 0.17
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.18
269 0.19
270 0.17
271 0.2
272 0.28
273 0.31
274 0.3
275 0.3
276 0.28
277 0.27
278 0.27
279 0.29
280 0.25
281 0.22
282 0.23
283 0.24
284 0.26
285 0.28
286 0.28
287 0.26
288 0.32
289 0.4
290 0.46
291 0.52
292 0.56
293 0.59
294 0.64
295 0.69
296 0.67
297 0.65
298 0.63
299 0.57
300 0.54
301 0.52
302 0.5
303 0.45
304 0.43
305 0.37
306 0.39
307 0.42
308 0.44
309 0.48
310 0.44
311 0.48
312 0.47
313 0.55
314 0.57
315 0.62
316 0.62
317 0.57
318 0.63
319 0.67
320 0.69
321 0.67
322 0.67
323 0.62
324 0.63
325 0.7
326 0.69
327 0.64
328 0.63
329 0.6
330 0.55
331 0.5
332 0.45
333 0.39
334 0.37
335 0.37
336 0.31
337 0.33
338 0.34
339 0.37
340 0.41
341 0.44
342 0.46
343 0.51
344 0.59
345 0.61
346 0.65
347 0.7
348 0.73
349 0.75
350 0.7
351 0.64
352 0.56
353 0.5
354 0.41
355 0.37
356 0.3
357 0.26
358 0.24
359 0.23
360 0.22
361 0.23
362 0.21
363 0.18
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.25
368 0.27
369 0.3
370 0.31
371 0.3
372 0.3
373 0.29
374 0.26
375 0.24
376 0.28
377 0.26
378 0.28
379 0.31
380 0.35
381 0.36
382 0.36
383 0.32