Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SL98

Protein Details
Accession A0A1V8SL98    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-209VEANRVRCRRCSRKVKGVVESKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 16, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015712  DNA-dir_RNA_pol_su2  
IPR007120  DNA-dir_RNAP_su2_dom  
IPR037033  DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf  
IPR007641  RNA_pol_Rpb2_7  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0032549  F:ribonucleoside binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00562  RNA_pol_Rpb2_6  
PF04560  RNA_pol_Rpb2_7  
Amino Acid Sequences MQPDIIINPHAFPSRMTIGMFVESLAGKSGALHGMAQDSTPFKFKDHEGETAVEYFGHQLKRAGYNFYGNEPMYSGITGQELGADIYVGVVYYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVTPLTGQPIKGRSKGGGIRVGEMERDALLAHGTAFLLQDRLLNCSDYTKAWICKSCGSFLSTQPSYAGQYTRSRGVEANRVRCRRCSRKVKGVVESKSEAWEDRSGQKWLGGEDVTVVAVPGVLRYLDVELAAMGIRLEFKVGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.22
7 0.21
8 0.15
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.18
31 0.2
32 0.27
33 0.29
34 0.32
35 0.31
36 0.32
37 0.33
38 0.31
39 0.29
40 0.19
41 0.16
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.25
49 0.26
50 0.28
51 0.25
52 0.3
53 0.3
54 0.31
55 0.32
56 0.25
57 0.24
58 0.21
59 0.2
60 0.15
61 0.14
62 0.11
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.17
85 0.25
86 0.29
87 0.32
88 0.39
89 0.39
90 0.39
91 0.39
92 0.36
93 0.29
94 0.28
95 0.25
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.2
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.16
105 0.17
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.2
111 0.24
112 0.26
113 0.27
114 0.27
115 0.24
116 0.24
117 0.24
118 0.23
119 0.18
120 0.15
121 0.12
122 0.07
123 0.07
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.15
146 0.16
147 0.19
148 0.21
149 0.24
150 0.25
151 0.29
152 0.3
153 0.29
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.25
158 0.31
159 0.26
160 0.24
161 0.23
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.19
166 0.15
167 0.2
168 0.22
169 0.27
170 0.26
171 0.26
172 0.27
173 0.3
174 0.36
175 0.38
176 0.46
177 0.5
178 0.55
179 0.56
180 0.62
181 0.68
182 0.68
183 0.71
184 0.72
185 0.72
186 0.77
187 0.85
188 0.85
189 0.84
190 0.83
191 0.76
192 0.71
193 0.65
194 0.55
195 0.47
196 0.41
197 0.33
198 0.27
199 0.26
200 0.24
201 0.27
202 0.29
203 0.29
204 0.28
205 0.3
206 0.27
207 0.25
208 0.25
209 0.19
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06