Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SS68

Protein Details
Accession A0A1V8SS68    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
483-505KAEKHQQRPAKLAKRRRKEELALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
489-500QRPAKLAKRRRK
565-580PRAARRKMKSLLPERR
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF14555  UBA_4  
Amino Acid Sequences MRGNAPQVKVHYKGQEDDFIVFVDSAEAVKKWKTDKTIPMAQVVSGFKVFVTHKHGTQGVHDAASKGTMETEFGTSKDDDVIAAILEKGDIVETESQARNGDRNINSGPSGTRQRIWASIIFKIPSCALLPAELRAKIVHFLLGTRWVVVHPHHTVLNPGERKTPRIPPGSGSCPFLKLPTEIRRAIFAGSLPHRNIVIEPTCGPTDTDGEFDENRWRRNRTADLMRICKGVKEEVTEAVYEERTFAVHVHEGFLDGGIEFVNSGRQPLQYATDRNLDTRFSTKIHDCNEFGFSRLKRINVAIFPGDGSKHLAINTYFMNYALADALSTDRGDKKRITKLRIHIREHLPPHNLKHRGATIARGSTYWWDAEKGKPRETSIHGLSNVQLVLLPFARLTDVHNVEVVLPQQVFNHAPTRAFVERLESHMTFPGGRYPDLINDRVEYQIQSAREALEEYVDDLLRGGHAATSKVVPLTDAELEEEKAEKHQQRPAKLAKRRRKEELALTLESSSLAELMDILGNITFQDARQILMEHDGNVQAAVNDYLDKGGMIVDSDSDDWVVEKPRAARRKMKSLLPERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.46
4 0.43
5 0.37
6 0.3
7 0.27
8 0.22
9 0.17
10 0.11
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.13
17 0.17
18 0.21
19 0.27
20 0.34
21 0.41
22 0.5
23 0.56
24 0.63
25 0.61
26 0.61
27 0.56
28 0.49
29 0.46
30 0.38
31 0.33
32 0.23
33 0.21
34 0.16
35 0.19
36 0.2
37 0.19
38 0.26
39 0.27
40 0.28
41 0.34
42 0.37
43 0.34
44 0.36
45 0.39
46 0.33
47 0.31
48 0.3
49 0.26
50 0.23
51 0.23
52 0.2
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.21
88 0.28
89 0.24
90 0.28
91 0.29
92 0.29
93 0.29
94 0.28
95 0.27
96 0.24
97 0.3
98 0.28
99 0.28
100 0.29
101 0.31
102 0.32
103 0.33
104 0.33
105 0.28
106 0.3
107 0.32
108 0.3
109 0.28
110 0.27
111 0.24
112 0.2
113 0.18
114 0.16
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.15
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.15
136 0.16
137 0.2
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.22
143 0.23
144 0.31
145 0.29
146 0.28
147 0.34
148 0.34
149 0.4
150 0.42
151 0.47
152 0.45
153 0.47
154 0.47
155 0.44
156 0.49
157 0.51
158 0.47
159 0.42
160 0.36
161 0.33
162 0.32
163 0.28
164 0.23
165 0.19
166 0.25
167 0.3
168 0.35
169 0.35
170 0.35
171 0.36
172 0.35
173 0.33
174 0.26
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.24
179 0.22
180 0.23
181 0.22
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.22
201 0.23
202 0.27
203 0.3
204 0.33
205 0.33
206 0.39
207 0.43
208 0.42
209 0.47
210 0.5
211 0.52
212 0.54
213 0.52
214 0.48
215 0.43
216 0.36
217 0.29
218 0.24
219 0.19
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.13
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.23
261 0.23
262 0.23
263 0.24
264 0.2
265 0.18
266 0.19
267 0.18
268 0.13
269 0.16
270 0.18
271 0.22
272 0.24
273 0.26
274 0.24
275 0.24
276 0.26
277 0.23
278 0.22
279 0.23
280 0.2
281 0.23
282 0.24
283 0.24
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.19
288 0.21
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.09
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.1
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.11
318 0.12
319 0.15
320 0.19
321 0.25
322 0.34
323 0.41
324 0.45
325 0.47
326 0.55
327 0.64
328 0.69
329 0.67
330 0.66
331 0.64
332 0.66
333 0.63
334 0.59
335 0.53
336 0.47
337 0.48
338 0.49
339 0.48
340 0.41
341 0.4
342 0.37
343 0.37
344 0.34
345 0.34
346 0.29
347 0.27
348 0.27
349 0.23
350 0.22
351 0.18
352 0.19
353 0.15
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.2
358 0.29
359 0.32
360 0.35
361 0.36
362 0.38
363 0.41
364 0.43
365 0.44
366 0.38
367 0.39
368 0.35
369 0.33
370 0.32
371 0.29
372 0.24
373 0.17
374 0.13
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.18
388 0.18
389 0.18
390 0.19
391 0.17
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.22
404 0.21
405 0.21
406 0.19
407 0.22
408 0.22
409 0.25
410 0.31
411 0.25
412 0.25
413 0.26
414 0.26
415 0.2
416 0.19
417 0.22
418 0.18
419 0.18
420 0.19
421 0.17
422 0.23
423 0.27
424 0.29
425 0.24
426 0.23
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.17
431 0.16
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.16
437 0.15
438 0.16
439 0.13
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.15
469 0.12
470 0.14
471 0.22
472 0.25
473 0.29
474 0.36
475 0.41
476 0.46
477 0.54
478 0.62
479 0.64
480 0.68
481 0.74
482 0.78
483 0.82
484 0.84
485 0.84
486 0.82
487 0.79
488 0.79
489 0.78
490 0.74
491 0.65
492 0.59
493 0.51
494 0.42
495 0.35
496 0.25
497 0.15
498 0.09
499 0.06
500 0.05
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.13
513 0.12
514 0.13
515 0.15
516 0.16
517 0.16
518 0.21
519 0.23
520 0.17
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.1
527 0.11
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.12
548 0.16
549 0.15
550 0.19
551 0.25
552 0.35
553 0.44
554 0.5
555 0.57
556 0.61
557 0.71
558 0.73
559 0.74
560 0.75