FuNGI

A0A1V8SM35

Protein Details

Accession

A0A1V8SM35

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
146-168	MLAPTGKRAKKGKKTGSRPTSSG	Hydrophilic
675-697	EDQRRLARKATQYRDKIKNLKSE	Hydrophilic
706-728	LYPAEEKEKQKERVKRRGSMGSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
151-162	GKRAKKGKKTGS
714-723	KQKERVKRRG
737-745	AGDRKKRSA

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 8.333, cyto 8, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MRQQAEVSISEPFPIFSLAHKYILYDVNVVSYIRAKYNITGVLIGTLPQAPQQNVFSGIPLELMPEEARLLVEKGIAYLVDDVKVHKHAFMDNGLSAEEKKAFQSALRRQGLAAARDVAKRGDDRKKVALEKKFGMGDWNDIPEEMLAPTGKRAKKGKKTGSRPTSSGGTGTNTPAGEASGAVTPTVEEDESLFSAPAESVTNPRPPGPRRSESRASSAAGSLMLTPYPQTPTTSAPLLQSTPPRSDEVPPLPEVPPSYPLYKHLHDKSYFMAPGLRFGCQYMAYPGDPLRFHSHFLCNGMDWDQEFDLLDIVGGGRLGTGVKKGFLIGGQETSFTINKADSDATNGKTGLQGSEVVSPSGPPPSQRAPSPPEIPARNPARVRSIDRNIPFPIGSARRVSTSRSVSFDLSTRAYQGSPATPQQNHTASQYSNITGRSPALVNPITSNDLFPSHSHRRPPSTPSRNISSPCIPENLAEDNVTPKPLKIQRRAMSDGSEHPNARFPPGTPARVHTVADRARSDARRTVTVPTHMNRDRFSFNPNESDELEVARPPCGYNSQHATESDDAVSPLAAELSTDGAIPSSASAEKGREITHQKQRRPTISSPDNEETLCPRPCKACKSTQKALAINPACCKGSKEQFCVGCWNEGMAMGLRKKSPEEWLACLLCGRNLLSEDQRRLARKATQYRDKIKNLKSELGSFRNRVLYPAEEKEKQKERVKRRGSMGSELTLLGGRSAGDRKKRSAWEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.13
4	0.22
5	0.23
6	0.26
7	0.25
8	0.25
9	0.27
10	0.32
11	0.3
12	0.24
13	0.21
14	0.2
15	0.21
16	0.2
17	0.17
18	0.18
19	0.18
20	0.18
21	0.21
22	0.21
23	0.21
24	0.27
25	0.29
26	0.25
27	0.24
28	0.22
29	0.21
30	0.2
31	0.18
32	0.14
33	0.12
34	0.11
35	0.14
36	0.18
37	0.17
38	0.2
39	0.22
40	0.22
41	0.26
42	0.26
43	0.23
44	0.2
45	0.19
46	0.17
47	0.14
48	0.14
49	0.09
50	0.11
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.1
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.1
64	0.1
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.16
71	0.21
72	0.2
73	0.19
74	0.19
75	0.2
76	0.23
77	0.25
78	0.25
79	0.22
80	0.22
81	0.21
82	0.2
83	0.19
84	0.18
85	0.17
86	0.14
87	0.14
88	0.15
89	0.15
90	0.17
91	0.27
92	0.33
93	0.42
94	0.44
95	0.43
96	0.41
97	0.48
98	0.5
99	0.42
100	0.35
101	0.29
102	0.29
103	0.3
104	0.32
105	0.26
106	0.24
107	0.26
108	0.32
109	0.38
110	0.41
111	0.45
112	0.51
113	0.57
114	0.63
115	0.67
116	0.67
117	0.63
118	0.6
119	0.59
120	0.53
121	0.46
122	0.42
123	0.34
124	0.31
125	0.27
126	0.26
127	0.22
128	0.2
129	0.21
130	0.16
131	0.15
132	0.1
133	0.1
134	0.08
135	0.08
136	0.12
137	0.2
138	0.22
139	0.28
140	0.37
141	0.46
142	0.56
143	0.67
144	0.73
145	0.76
146	0.84
147	0.88
148	0.89
149	0.84
150	0.76
151	0.69
152	0.62
153	0.52
154	0.44
155	0.34
156	0.27
157	0.23
158	0.23
159	0.21
160	0.17
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.11
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.09
174	0.07
175	0.05
176	0.06
177	0.08
178	0.09
179	0.1
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.11
188	0.15
189	0.19
190	0.2
191	0.24
192	0.3
193	0.33
194	0.42
195	0.46
196	0.5
197	0.53
198	0.6
199	0.65
200	0.61
201	0.63
202	0.57
203	0.49
204	0.43
205	0.37
206	0.29
207	0.2
208	0.17
209	0.11
210	0.09
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.1
216	0.1
217	0.12
218	0.13
219	0.16
220	0.19
221	0.2
222	0.2
223	0.18
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.23
228	0.23
229	0.25
230	0.25
231	0.26
232	0.26
233	0.28
234	0.32
235	0.31
236	0.31
237	0.3
238	0.3
239	0.28
240	0.28
241	0.26
242	0.21
243	0.2
244	0.19
245	0.2
246	0.18
247	0.23
248	0.27
249	0.29
250	0.35
251	0.35
252	0.4
253	0.39
254	0.4
255	0.37
256	0.37
257	0.34
258	0.27
259	0.27
260	0.19
261	0.25
262	0.24
263	0.22
264	0.17
265	0.17
266	0.18
267	0.14
268	0.15
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.13
273	0.13
274	0.16
275	0.15
276	0.17
277	0.22
278	0.21
279	0.23
280	0.25
281	0.27
282	0.25
283	0.27
284	0.25
285	0.18
286	0.18
287	0.18
288	0.15
289	0.12
290	0.12
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.02
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.09
315	0.08
316	0.1
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.12
321	0.11
322	0.09
323	0.09
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.07
329	0.12
330	0.15
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.11
338	0.09
339	0.08
340	0.08
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.1
347	0.12
348	0.11
349	0.08
350	0.12
351	0.16
352	0.18
353	0.19
354	0.23
355	0.25
356	0.3
357	0.32
358	0.31
359	0.32
360	0.32
361	0.32
362	0.36
363	0.35
364	0.36
365	0.34
366	0.32
367	0.33
368	0.34
369	0.37
370	0.37
371	0.38
372	0.39
373	0.39
374	0.41
375	0.36
376	0.35
377	0.29
378	0.22
379	0.22
380	0.18
381	0.18
382	0.17
383	0.16
384	0.18
385	0.19
386	0.21
387	0.22
388	0.24
389	0.25
390	0.26
391	0.27
392	0.26
393	0.26
394	0.25
395	0.21
396	0.18
397	0.16
398	0.14
399	0.13
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.11
404	0.12
405	0.15
406	0.18
407	0.18
408	0.2
409	0.25
410	0.25
411	0.25
412	0.24
413	0.24
414	0.2
415	0.22
416	0.21
417	0.17
418	0.17
419	0.17
420	0.15
421	0.13
422	0.13
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.14
430	0.16
431	0.16
432	0.16
433	0.15
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.19
439	0.24
440	0.28
441	0.34
442	0.37
443	0.43
444	0.45
445	0.52
446	0.55
447	0.56
448	0.6
449	0.58
450	0.6
451	0.57
452	0.56
453	0.53
454	0.47
455	0.41
456	0.35
457	0.32
458	0.27
459	0.23
460	0.24
461	0.22
462	0.18
463	0.15
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.17
468	0.14
469	0.11
470	0.18
471	0.25
472	0.33
473	0.38
474	0.48
475	0.52
476	0.58
477	0.63
478	0.57
479	0.53
480	0.47
481	0.45
482	0.4
483	0.38
484	0.32
485	0.28
486	0.31
487	0.29
488	0.3
489	0.25
490	0.2
491	0.26
492	0.31
493	0.34
494	0.29
495	0.32
496	0.35
497	0.35
498	0.35
499	0.27
500	0.3
501	0.29
502	0.32
503	0.3
504	0.27
505	0.32
506	0.34
507	0.36
508	0.34
509	0.33
510	0.33
511	0.33
512	0.36
513	0.34
514	0.36
515	0.38
516	0.34
517	0.41
518	0.42
519	0.43
520	0.39
521	0.39
522	0.38
523	0.34
524	0.36
525	0.33
526	0.31
527	0.34
528	0.34
529	0.33
530	0.29
531	0.31
532	0.26
533	0.22
534	0.2
535	0.17
536	0.16
537	0.14
538	0.13
539	0.11
540	0.13
541	0.16
542	0.17
543	0.21
544	0.26
545	0.29
546	0.31
547	0.31
548	0.34
549	0.3
550	0.3
551	0.25
552	0.19
553	0.16
554	0.14
555	0.13
556	0.09
557	0.07
558	0.06
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.08
573	0.1
574	0.11
575	0.13
576	0.15
577	0.16
578	0.21
579	0.28
580	0.35
581	0.45
582	0.52
583	0.57
584	0.64
585	0.72
586	0.72
587	0.71
588	0.68
589	0.68
590	0.67
591	0.65
592	0.64
593	0.58
594	0.53
595	0.46
596	0.42
597	0.36
598	0.35
599	0.35
600	0.28
601	0.28
602	0.34
603	0.39
604	0.46
605	0.48
606	0.51
607	0.57
608	0.65
609	0.71
610	0.71
611	0.73
612	0.68
613	0.65
614	0.65
615	0.59
616	0.53
617	0.48
618	0.44
619	0.37
620	0.34
621	0.34
622	0.32
623	0.38
624	0.42
625	0.44
626	0.49
627	0.51
628	0.52
629	0.56
630	0.5
631	0.43
632	0.35
633	0.3
634	0.23
635	0.2
636	0.2
637	0.15
638	0.19
639	0.19
640	0.22
641	0.22
642	0.23
643	0.26
644	0.27
645	0.31
646	0.34
647	0.35
648	0.37
649	0.42
650	0.42
651	0.4
652	0.39
653	0.33
654	0.26
655	0.24
656	0.2
657	0.15
658	0.16
659	0.2
660	0.27
661	0.34
662	0.37
663	0.4
664	0.46
665	0.47
666	0.48
667	0.49
668	0.49
669	0.51
670	0.57
671	0.62
672	0.66
673	0.72
674	0.79
675	0.83
676	0.84
677	0.84
678	0.8
679	0.8
680	0.75
681	0.74
682	0.68
683	0.66
684	0.65
685	0.63
686	0.63
687	0.55
688	0.53
689	0.52
690	0.49
691	0.43
692	0.39
693	0.37
694	0.37
695	0.43
696	0.46
697	0.46
698	0.5
699	0.57
700	0.62
701	0.66
702	0.68
703	0.7
704	0.73
705	0.78
706	0.83
707	0.82
708	0.81
709	0.81
710	0.77
711	0.76
712	0.7
713	0.61
714	0.54
715	0.46
716	0.38
717	0.3
718	0.25
719	0.16
720	0.12
721	0.1
722	0.12
723	0.19
724	0.25
725	0.34
726	0.39
727	0.45
728	0.53

A0A1V8SM35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer