FuNGI

C4R6X9

Protein Details

Accession

C4R6X9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-37	MSDEEGKRKRQKTDKASGEEKKSKKKTKISLVQCLET	Hydrophilic
121-145	LESKYNKKKSDNKSGKKDINKPSNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-28	KRKRQKTDKASGEEKKSKKKTK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.166, mito_nucl 12.833, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014720 dsRBD_dom IPR040540 RNase_3_N IPR011907 RNase_III IPR000999 RNase_III_dom IPR036389 RNase_III_sf
Gene Ontology	GO:0004525 F:ribonuclease III activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	ppa:PAS_chr4_0127 -
Pfam	View protein in Pfam PF00035 dsrm PF00636 Ribonuclease_3 PF18497 RNase_3_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50137 DS_RBD PS00517 RNASE_3_1 PS50142 RNASE_3_2
CDD	cd00593 RIBOc

Amino Acid Sequences

MSDEEGKRKRQKTDKASGEEKKSKKKTKISLVQCLETEYAVNKLTSSLKEVLEVSPSYREVAKALDNLGDYEAAVVLALTRGPKLVHASKLKTLYKHGKLDFLNLILNFNDPKVFAEFEDLESKYNKKKSDNKSGKKDINKPSNEDEEGKEVRPKGVEQYPPPLLPLTDPVLRSKVFTHKSAVTQAEEDSIEAANSSYERLEYLGDAVLELAVTSIVMKEFPASSEGHLSVCRQQIVSNSNLENYSKLYGFPEKLSSLMSKEETDKNNGKIYADIFEAYIGALYVQNNNDLTMIQEWLGKLARPVIEAMKMKRDKSYLNKSAKEKLYALIGSAKSAPKYVTLDNGPARDEWLVQVEMEGEIIGKGIGGSVKDARTRAAMAALENHNAIRKYNTMRSTTLREESLVKAPEDSELQKEVDDLIEKIKMSKNVKNVSFPLRVPENSGVIPEHKGLIMFLFSKWNLQTELKCVKLNDQFETTFVVEGKSILTSYSQHKKRSNLLCYTYFYKNLHILKLLMKEYVKEQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.82
3	0.86
4	0.84
5	0.84
6	0.83
7	0.81
8	0.81
9	0.82
10	0.84
11	0.84
12	0.85
13	0.85
14	0.87
15	0.89
16	0.87
17	0.87
18	0.83
19	0.77
20	0.68
21	0.61
22	0.5
23	0.4
24	0.32
25	0.22
26	0.19
27	0.17
28	0.16
29	0.13
30	0.15
31	0.19
32	0.19
33	0.23
34	0.24
35	0.23
36	0.25
37	0.27
38	0.25
39	0.25
40	0.24
41	0.21
42	0.2
43	0.21
44	0.2
45	0.2
46	0.19
47	0.16
48	0.19
49	0.2
50	0.19
51	0.19
52	0.2
53	0.2
54	0.2
55	0.2
56	0.17
57	0.13
58	0.11
59	0.09
60	0.07
61	0.06
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.07
69	0.07
70	0.1
71	0.17
72	0.22
73	0.29
74	0.36
75	0.41
76	0.46
77	0.54
78	0.56
79	0.52
80	0.55
81	0.58
82	0.58
83	0.62
84	0.57
85	0.56
86	0.52
87	0.55
88	0.49
89	0.4
90	0.36
91	0.28
92	0.28
93	0.2
94	0.21
95	0.16
96	0.14
97	0.13
98	0.1
99	0.12
100	0.13
101	0.13
102	0.12
103	0.17
104	0.17
105	0.19
106	0.24
107	0.22
108	0.21
109	0.23
110	0.26
111	0.28
112	0.32
113	0.33
114	0.37
115	0.47
116	0.54
117	0.64
118	0.72
119	0.74
120	0.8
121	0.85
122	0.85
123	0.84
124	0.84
125	0.83
126	0.82
127	0.76
128	0.7
129	0.66
130	0.64
131	0.58
132	0.51
133	0.43
134	0.39
135	0.38
136	0.34
137	0.32
138	0.27
139	0.26
140	0.25
141	0.24
142	0.23
143	0.28
144	0.32
145	0.3
146	0.36
147	0.38
148	0.37
149	0.37
150	0.31
151	0.24
152	0.19
153	0.2
154	0.17
155	0.17
156	0.18
157	0.19
158	0.21
159	0.21
160	0.22
161	0.22
162	0.27
163	0.27
164	0.28
165	0.3
166	0.3
167	0.32
168	0.37
169	0.36
170	0.28
171	0.26
172	0.24
173	0.21
174	0.19
175	0.16
176	0.11
177	0.09
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.02
200	0.02
201	0.02
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.12
217	0.15
218	0.16
219	0.16
220	0.14
221	0.14
222	0.18
223	0.2
224	0.21
225	0.19
226	0.18
227	0.18
228	0.19
229	0.18
230	0.14
231	0.13
232	0.12
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.13
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.15
243	0.13
244	0.12
245	0.13
246	0.13
247	0.11
248	0.14
249	0.19
250	0.19
251	0.25
252	0.27
253	0.27
254	0.29
255	0.29
256	0.26
257	0.22
258	0.21
259	0.17
260	0.14
261	0.12
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.06
266	0.05
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.08
283	0.07
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.16
294	0.19
295	0.21
296	0.27
297	0.3
298	0.3
299	0.32
300	0.32
301	0.32
302	0.38
303	0.48
304	0.47
305	0.52
306	0.58
307	0.58
308	0.65
309	0.62
310	0.56
311	0.46
312	0.38
313	0.34
314	0.28
315	0.25
316	0.22
317	0.2
318	0.17
319	0.19
320	0.19
321	0.16
322	0.17
323	0.16
324	0.13
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.18
329	0.23
330	0.25
331	0.26
332	0.24
333	0.21
334	0.22
335	0.17
336	0.16
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.07
356	0.1
357	0.12
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.17
362	0.18
363	0.16
364	0.16
365	0.15
366	0.13
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.18
371	0.18
372	0.18
373	0.18
374	0.18
375	0.15
376	0.18
377	0.23
378	0.3
379	0.35
380	0.35
381	0.38
382	0.42
383	0.46
384	0.46
385	0.43
386	0.37
387	0.33
388	0.32
389	0.32
390	0.34
391	0.3
392	0.25
393	0.23
394	0.22
395	0.23
396	0.23
397	0.21
398	0.18
399	0.18
400	0.18
401	0.17
402	0.17
403	0.16
404	0.14
405	0.14
406	0.12
407	0.11
408	0.13
409	0.13
410	0.16
411	0.2
412	0.26
413	0.3
414	0.35
415	0.42
416	0.48
417	0.51
418	0.54
419	0.54
420	0.54
421	0.53
422	0.48
423	0.46
424	0.43
425	0.4
426	0.4
427	0.38
428	0.34
429	0.29
430	0.31
431	0.26
432	0.23
433	0.24
434	0.19
435	0.17
436	0.14
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.16
444	0.16
445	0.2
446	0.2
447	0.22
448	0.23
449	0.27
450	0.28
451	0.31
452	0.38
453	0.37
454	0.4
455	0.38
456	0.42
457	0.46
458	0.47
459	0.43
460	0.41
461	0.38
462	0.36
463	0.4
464	0.32
465	0.26
466	0.23
467	0.19
468	0.15
469	0.14
470	0.14
471	0.1
472	0.1
473	0.08
474	0.1
475	0.12
476	0.2
477	0.31
478	0.37
479	0.44
480	0.51
481	0.56
482	0.64
483	0.71
484	0.72
485	0.7
486	0.7
487	0.67
488	0.66
489	0.66
490	0.61
491	0.57
492	0.49
493	0.45
494	0.47
495	0.46
496	0.43
497	0.4
498	0.38
499	0.38
500	0.43
501	0.4
502	0.37
503	0.34
504	0.32

C4R6X9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer