Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TK90

Protein Details
Accession A0A1V8TK90    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MENGTEKKSKKRRREEASVIGDSQHydrophilic
26-50TTIETAPAKKHKKSKKDHAAVLVKQHydrophilic
61-88IQPTLPPVKEKSKKRKLKPQDHVTTTDEHydrophilic
110-134SPELATTKKKSKKVKAERRDSAEEVHydrophilic
153-172NGTSEQTKEKKKKRSESEAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14KKSKKRRR
33-41AKKHKKSKK
69-78KEKSKKRKLK
117-127KKKSKKVKAER
162-165KKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto 10, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MENGTEKKSKKRRREEASVIGDSQDTTIETAPAKKHKKSKKDHAAVLVKQESPLDEHAGPIQPTLPPVKEKSKKRKLKPQDHVTTTDEAAVAAVAAPAPDATLGMLPRASPELATTKKKSKKVKAERRDSAEEVAAVPNGVPRTELDEPIVPNGTSEQTKEKKKKRSESEAVLPEANGVVHVDEPPAPSATIEAPVEEVSTTITAIDEKLLESKSPFRQQTASFYLALSPIAHHFPVEGLCAEHISPLLLTYYPPLKGIVLSFSNPRMSETPEQGQQTNGTGPRPVVLGESIDEYAVIFVWLTVDVLLFRPQKNTVLEGFVNLQNESMLGLICYNYFNAGIERSRLPKDWRWVEDESAADDAGAMARRGRRSAAGYYVDGNGKKVEGRVVFRVKDFEASPGSETGGGSINIYGTALSTQEDDKIDEDLRSKALVKDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.9
3 0.89
4 0.87
5 0.8
6 0.7
7 0.6
8 0.51
9 0.4
10 0.31
11 0.21
12 0.13
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.17
18 0.23
19 0.32
20 0.39
21 0.46
22 0.55
23 0.63
24 0.72
25 0.78
26 0.83
27 0.85
28 0.87
29 0.86
30 0.87
31 0.86
32 0.79
33 0.77
34 0.7
35 0.59
36 0.5
37 0.44
38 0.34
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.19
43 0.19
44 0.22
45 0.25
46 0.24
47 0.21
48 0.2
49 0.16
50 0.18
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.26
55 0.37
56 0.44
57 0.54
58 0.63
59 0.7
60 0.78
61 0.83
62 0.89
63 0.9
64 0.92
65 0.92
66 0.92
67 0.91
68 0.86
69 0.81
70 0.73
71 0.65
72 0.54
73 0.45
74 0.33
75 0.23
76 0.18
77 0.12
78 0.09
79 0.06
80 0.05
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.1
99 0.17
100 0.22
101 0.29
102 0.33
103 0.41
104 0.49
105 0.57
106 0.64
107 0.67
108 0.73
109 0.78
110 0.84
111 0.85
112 0.88
113 0.88
114 0.86
115 0.82
116 0.73
117 0.64
118 0.54
119 0.43
120 0.34
121 0.26
122 0.19
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.19
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.15
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.11
143 0.12
144 0.19
145 0.24
146 0.34
147 0.44
148 0.51
149 0.59
150 0.68
151 0.76
152 0.77
153 0.81
154 0.79
155 0.77
156 0.77
157 0.72
158 0.64
159 0.55
160 0.45
161 0.35
162 0.27
163 0.19
164 0.1
165 0.06
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.04
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.13
201 0.18
202 0.24
203 0.25
204 0.24
205 0.28
206 0.28
207 0.34
208 0.33
209 0.3
210 0.24
211 0.23
212 0.22
213 0.19
214 0.18
215 0.12
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.16
255 0.2
256 0.22
257 0.25
258 0.26
259 0.29
260 0.3
261 0.28
262 0.28
263 0.23
264 0.21
265 0.21
266 0.19
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.05
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.12
295 0.15
296 0.15
297 0.18
298 0.2
299 0.24
300 0.25
301 0.27
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.23
306 0.24
307 0.22
308 0.21
309 0.18
310 0.17
311 0.12
312 0.12
313 0.1
314 0.07
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.17
330 0.21
331 0.24
332 0.27
333 0.33
334 0.37
335 0.46
336 0.51
337 0.51
338 0.53
339 0.53
340 0.51
341 0.48
342 0.42
343 0.34
344 0.27
345 0.23
346 0.17
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.1
353 0.15
354 0.18
355 0.19
356 0.21
357 0.23
358 0.26
359 0.3
360 0.34
361 0.33
362 0.33
363 0.33
364 0.35
365 0.36
366 0.32
367 0.29
368 0.23
369 0.2
370 0.2
371 0.19
372 0.22
373 0.22
374 0.27
375 0.34
376 0.41
377 0.42
378 0.43
379 0.46
380 0.4
381 0.39
382 0.35
383 0.31
384 0.27
385 0.26
386 0.27
387 0.23
388 0.23
389 0.2
390 0.19
391 0.16
392 0.16
393 0.14
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.08
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.16
410 0.19
411 0.2
412 0.2
413 0.22
414 0.2
415 0.21
416 0.21
417 0.23