Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SNF3

Protein Details
Accession A0A1V8SNF3    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-53DDATQSRKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRKLGDEGDAPBasic
76-99ETEGTASKSKKRKREQPTTEINAPHydrophilic
102-126EDGATTKAPKKKRKKTRTDPGATDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-45RKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRK
84-89SKKRKR
108-118KAPKKKRKKTR
261-303RKEKIKVKNVRLEEQRSRRAELERKERAKKEGKEGVKPKVVEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSHSEEAIADTGAVEGDDATQSRKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRKLGDEGDAPALPEGEPHDELKDDFIALPATNETEGTASKSKKRKREQPTTEINAPPAEDGATTKAPKKKRKKTRTDPGATDAATDTTTAKPANQRFIVFLGNLPYTTTDASLNLHFKSLQPFTLRHRTDPATKKSKGFAFLEFENYDRMKTCLKLYHHSYFDPENPEKSKLVVEGEPEPEPQAAVYGGKRGKAEKETGRKINVELTVGGGGNGSTVRKEKIKVKNVRLEEQRSRRAELERKERAKKEGKEGVKPKVVEKVPATKGAEGMHPSRMAMMAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.05
4 0.07
5 0.07
6 0.1
7 0.14
8 0.18
9 0.24
10 0.31
11 0.38
12 0.46
13 0.56
14 0.64
15 0.7
16 0.75
17 0.81
18 0.83
19 0.84
20 0.82
21 0.77
22 0.72
23 0.71
24 0.71
25 0.69
26 0.71
27 0.73
28 0.76
29 0.8
30 0.86
31 0.87
32 0.88
33 0.85
34 0.81
35 0.77
36 0.71
37 0.65
38 0.54
39 0.44
40 0.33
41 0.27
42 0.2
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.16
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.12
67 0.17
68 0.19
69 0.27
70 0.36
71 0.43
72 0.52
73 0.62
74 0.68
75 0.73
76 0.81
77 0.83
78 0.83
79 0.86
80 0.83
81 0.79
82 0.7
83 0.61
84 0.5
85 0.41
86 0.32
87 0.22
88 0.14
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.13
93 0.14
94 0.2
95 0.25
96 0.34
97 0.44
98 0.54
99 0.61
100 0.69
101 0.79
102 0.85
103 0.9
104 0.93
105 0.94
106 0.9
107 0.83
108 0.76
109 0.69
110 0.57
111 0.47
112 0.36
113 0.25
114 0.18
115 0.14
116 0.11
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.16
122 0.18
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.24
127 0.25
128 0.25
129 0.19
130 0.17
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.17
153 0.22
154 0.32
155 0.32
156 0.29
157 0.33
158 0.33
159 0.4
160 0.46
161 0.49
162 0.47
163 0.49
164 0.49
165 0.49
166 0.49
167 0.44
168 0.38
169 0.32
170 0.28
171 0.26
172 0.29
173 0.25
174 0.23
175 0.21
176 0.2
177 0.17
178 0.14
179 0.15
180 0.13
181 0.13
182 0.16
183 0.2
184 0.23
185 0.29
186 0.35
187 0.4
188 0.4
189 0.39
190 0.39
191 0.36
192 0.36
193 0.37
194 0.32
195 0.3
196 0.3
197 0.32
198 0.3
199 0.28
200 0.25
201 0.19
202 0.21
203 0.18
204 0.17
205 0.18
206 0.2
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.09
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.14
218 0.15
219 0.18
220 0.19
221 0.2
222 0.24
223 0.26
224 0.33
225 0.36
226 0.45
227 0.51
228 0.55
229 0.57
230 0.53
231 0.5
232 0.49
233 0.41
234 0.33
235 0.24
236 0.21
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.12
248 0.16
249 0.2
250 0.29
251 0.39
252 0.49
253 0.57
254 0.65
255 0.71
256 0.73
257 0.78
258 0.77
259 0.75
260 0.75
261 0.75
262 0.74
263 0.69
264 0.67
265 0.62
266 0.63
267 0.62
268 0.62
269 0.63
270 0.64
271 0.7
272 0.75
273 0.75
274 0.76
275 0.78
276 0.74
277 0.74
278 0.73
279 0.71
280 0.72
281 0.75
282 0.74
283 0.72
284 0.67
285 0.59
286 0.59
287 0.54
288 0.5
289 0.49
290 0.5
291 0.46
292 0.52
293 0.53
294 0.45
295 0.45
296 0.4
297 0.4
298 0.35
299 0.33
300 0.3
301 0.28
302 0.27
303 0.25