FuNGI

A0A1V8TSY4

Protein Details

Accession

A0A1V8TSY4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
66-88	RAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
62-136	RGRGRAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEKEEADRKREESDRKAKEARAKFGGSRGRGDGRGRGRLRGGYMGEGERRK
329-337	RRRGKGKQR

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRRPPPRPPVVPSPPSTSAPTPATSPPPQVDLTSQPSTSHPSTPAPPTTSTPTTASASTRGRGRAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEKEEADRKREESDRKAKEARAKFGGSRGRGDGRGRGRLRGGYMGEGERRKGEGAAVMSGPFSLGETVAEVKGKGRGWVSGSGGGGVGTSSGGGGGGGSGGGSGGGGSTGGGSGGGGGGNRGASGSRSGVKQEPGANGSSHRDVQMMDSRTVIKTEDGGYISSGDDEDDKAAGGRRNIDDLALIDLTADDDTSGAAPGGFAPVRIQRVEHRDRALGLKEDAAKVADTSALVVEANDIPASPTLRRRGKGKQRAKDIEIVSEQHAYQGVYSDSSSDGERRPRIKPEPTDDDDDRPATPPGQAPTASMLPPQSPPSSPEARKKAKDRVKQPSFSTQERPEFETNEDALEWELKEKDLRILRDELGTPAPSTSTQPPGEDAEMPDASATDPRQDKVYLFQFPPILPDLKPITVKPDPDGPAVTSTGSAPPPIKPAGFVGKLNIHASGRATLDWGGVPMEIGMGIEASFLQDVIIAELEKKRHDAAEGEEGADVKEKVVGGRAMGMGQVKGKFVVVPSWEGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.72
3	0.66
4	0.61
5	0.59
6	0.5
7	0.46
8	0.42
9	0.39
10	0.35
11	0.34
12	0.38
13	0.37
14	0.4
15	0.36
16	0.36
17	0.36
18	0.34
19	0.34
20	0.33
21	0.36
22	0.35
23	0.34
24	0.31
25	0.32
26	0.37
27	0.36
28	0.33
29	0.29
30	0.3
31	0.35
32	0.4
33	0.44
34	0.4
35	0.41
36	0.41
37	0.46
38	0.44
39	0.42
40	0.38
41	0.36
42	0.34
43	0.33
44	0.31
45	0.3
46	0.31
47	0.32
48	0.34
49	0.34
50	0.33
51	0.35
52	0.39
53	0.41
54	0.45
55	0.52
56	0.54
57	0.57
58	0.57
59	0.63
60	0.67
61	0.64
62	0.68
63	0.67
64	0.71
65	0.74
66	0.82
67	0.81
68	0.79
69	0.8
70	0.78
71	0.77
72	0.7
73	0.66
74	0.63
75	0.59
76	0.59
77	0.55
78	0.51
79	0.45
80	0.42
81	0.44
82	0.43
83	0.47
84	0.5
85	0.56
86	0.59
87	0.64
88	0.68
89	0.67
90	0.69
91	0.69
92	0.65
93	0.61
94	0.58
95	0.52
96	0.54
97	0.57
98	0.5
99	0.46
100	0.44
101	0.41
102	0.42
103	0.43
104	0.43
105	0.41
106	0.48
107	0.46
108	0.45
109	0.44
110	0.42
111	0.42
112	0.4
113	0.35
114	0.27
115	0.28
116	0.28
117	0.31
118	0.3
119	0.29
120	0.25
121	0.25
122	0.23
123	0.2
124	0.18
125	0.16
126	0.16
127	0.16
128	0.15
129	0.14
130	0.14
131	0.13
132	0.12
133	0.08
134	0.07
135	0.05
136	0.04
137	0.04
138	0.06
139	0.07
140	0.08
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.13
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.16
149	0.19
150	0.22
151	0.24
152	0.22
153	0.22
154	0.2
155	0.19
156	0.16
157	0.13
158	0.09
159	0.07
160	0.03
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.02
166	0.02
167	0.02
168	0.02
169	0.02
170	0.02
171	0.02
172	0.02
173	0.02
174	0.02
175	0.02
176	0.02
177	0.02
178	0.02
179	0.02
180	0.02
181	0.02
182	0.02
183	0.02
184	0.02
185	0.02
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.06
197	0.08
198	0.1
199	0.11
200	0.14
201	0.17
202	0.18
203	0.2
204	0.22
205	0.23
206	0.22
207	0.23
208	0.21
209	0.2
210	0.22
211	0.21
212	0.18
213	0.16
214	0.15
215	0.14
216	0.17
217	0.23
218	0.22
219	0.2
220	0.2
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.18
225	0.11
226	0.1
227	0.11
228	0.12
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.08
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.13
247	0.14
248	0.16
249	0.16
250	0.15
251	0.13
252	0.11
253	0.12
254	0.09
255	0.08
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.09
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.15
279	0.23
280	0.28
281	0.31
282	0.3
283	0.29
284	0.3
285	0.32
286	0.29
287	0.23
288	0.18
289	0.17
290	0.16
291	0.16
292	0.15
293	0.13
294	0.11
295	0.09
296	0.09
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.12
314	0.2
315	0.25
316	0.27
317	0.31
318	0.41
319	0.51
320	0.6
321	0.66
322	0.65
323	0.71
324	0.74
325	0.72
326	0.69
327	0.59
328	0.52
329	0.44
330	0.38
331	0.29
332	0.25
333	0.22
334	0.15
335	0.15
336	0.11
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.12
348	0.17
349	0.23
350	0.26
351	0.28
352	0.35
353	0.41
354	0.47
355	0.5
356	0.52
357	0.55
358	0.55
359	0.59
360	0.53
361	0.5
362	0.44
363	0.39
364	0.32
365	0.25
366	0.22
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.17
375	0.18
376	0.17
377	0.15
378	0.15
379	0.13
380	0.15
381	0.17
382	0.15
383	0.14
384	0.17
385	0.22
386	0.29
387	0.33
388	0.4
389	0.47
390	0.53
391	0.59
392	0.63
393	0.68
394	0.69
395	0.73
396	0.74
397	0.76
398	0.76
399	0.75
400	0.72
401	0.72
402	0.68
403	0.64
404	0.61
405	0.56
406	0.55
407	0.52
408	0.54
409	0.45
410	0.42
411	0.4
412	0.37
413	0.3
414	0.24
415	0.21
416	0.16
417	0.14
418	0.14
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.18
426	0.21
427	0.23
428	0.25
429	0.28
430	0.29
431	0.3
432	0.3
433	0.26
434	0.23
435	0.22
436	0.19
437	0.15
438	0.15
439	0.13
440	0.16
441	0.17
442	0.21
443	0.21
444	0.22
445	0.23
446	0.25
447	0.26
448	0.24
449	0.22
450	0.21
451	0.2
452	0.19
453	0.16
454	0.14
455	0.12
456	0.14
457	0.13
458	0.15
459	0.17
460	0.17
461	0.2
462	0.21
463	0.21
464	0.26
465	0.31
466	0.31
467	0.29
468	0.32
469	0.32
470	0.31
471	0.33
472	0.29
473	0.25
474	0.19
475	0.23
476	0.24
477	0.25
478	0.27
479	0.24
480	0.29
481	0.31
482	0.33
483	0.3
484	0.34
485	0.34
486	0.34
487	0.35
488	0.29
489	0.27
490	0.27
491	0.24
492	0.17
493	0.15
494	0.17
495	0.15
496	0.16
497	0.15
498	0.16
499	0.19
500	0.21
501	0.2
502	0.18
503	0.22
504	0.28
505	0.29
506	0.29
507	0.29
508	0.31
509	0.34
510	0.33
511	0.32
512	0.24
513	0.23
514	0.24
515	0.22
516	0.2
517	0.17
518	0.18
519	0.15
520	0.16
521	0.14
522	0.13
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.07
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.06
541	0.08
542	0.09
543	0.08
544	0.11
545	0.15
546	0.18
547	0.18
548	0.2
549	0.21
550	0.21
551	0.23
552	0.24
553	0.26
554	0.33
555	0.33
556	0.31
557	0.3
558	0.29
559	0.27
560	0.27
561	0.21
562	0.11
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.17
567	0.17
568	0.15
569	0.18
570	0.18
571	0.16
572	0.18
573	0.19
574	0.16
575	0.19
576	0.2
577	0.18
578	0.18
579	0.18
580	0.17
581	0.17
582	0.21
583	0.19

A0A1V8TSY4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer