Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SSD3

Protein Details
Accession A0A1V8SSD3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
696-718AAEDRRRTDKAKREHNKSTKVVVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MASSRIFVKGLPPSLTDVEFRKHFSSQGREITDARLFANRRIGYVGYRTPEDAVKAVKYFNKTFMRMSRIGVEVARPVAEAKTGALTAVVPANGIDAATRQVEQVLEGAASTEKDAKLQEFLEVMKPKSKKRTLDQGEAPGLNAPLVNGDTMVVDGTAASDDEYEKVPTRAKRARIDSPSPPDPPQAPLVVSEESGLPKPDAHAMGDEGAAEAAPGIVITDDDWARSRTRRLLGLLDDEEEKDRAIQPQNKSGQGDDEDEDADELAKGGRKATEEPATQTLTPPADHDASTLLQTDDVVPGASVQDEASSSMRLFVRNLPYDVRKDALQDHFAEFGHITEIHVPLDHKSGAAKGFAYLKFDDASAADAALAAKDGQPFQGRLMHILPAAAKRESKLNDFEVSKLPLKQQQQIKRRREAASSTFNWNALYMNADAVVSSVADRLGLAKSEVLDPTSSDAAVKQAHAETHIIQETKSYFKSQGVDLDAFKRSQRGDTAILVKNIPYDCSKDELKRLFEEHGEIKRFLMPPSGTLAVLEFVNAAQAKTAFGALAYRKIKGSVLFLEKAPKDLFKAIPIGKDDVAQNGVSKISTNDLKTADADMVVADGAGTATLFVRNLNFDTTNTQLTELFQPLSGFLSGKVKTRTDPKKPGKILSMGFGFLEFRTAPDAQAALQAMDGYALQGHKLQLRASHKGVDAAEDRRRTDKAKREHNKSTKVVVKNLPFEATKKDVRALFGAYGQLRSVRVPKKMDNGARGFAFAEFATPKDAENAIEALKDTHLLGRRLVLDFASEDPDDAEAEIERMQKRVEGQVNKVALQKLTSGGRKRFTTQGEDEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.34
4 0.31
5 0.32
6 0.33
7 0.36
8 0.34
9 0.33
10 0.36
11 0.41
12 0.46
13 0.47
14 0.53
15 0.53
16 0.52
17 0.52
18 0.53
19 0.47
20 0.4
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.31
25 0.4
26 0.35
27 0.33
28 0.35
29 0.35
30 0.31
31 0.36
32 0.37
33 0.32
34 0.33
35 0.33
36 0.32
37 0.32
38 0.31
39 0.27
40 0.25
41 0.24
42 0.24
43 0.27
44 0.3
45 0.35
46 0.35
47 0.41
48 0.45
49 0.44
50 0.49
51 0.52
52 0.55
53 0.51
54 0.51
55 0.47
56 0.41
57 0.4
58 0.34
59 0.29
60 0.24
61 0.24
62 0.21
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.16
108 0.17
109 0.24
110 0.26
111 0.27
112 0.31
113 0.35
114 0.4
115 0.5
116 0.56
117 0.56
118 0.59
119 0.69
120 0.69
121 0.75
122 0.74
123 0.71
124 0.69
125 0.61
126 0.54
127 0.44
128 0.36
129 0.27
130 0.2
131 0.12
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.2
155 0.23
156 0.32
157 0.38
158 0.44
159 0.51
160 0.56
161 0.63
162 0.65
163 0.68
164 0.68
165 0.69
166 0.67
167 0.62
168 0.57
169 0.51
170 0.44
171 0.41
172 0.35
173 0.28
174 0.23
175 0.21
176 0.22
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.13
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.14
213 0.17
214 0.21
215 0.24
216 0.28
217 0.31
218 0.32
219 0.34
220 0.34
221 0.37
222 0.34
223 0.29
224 0.26
225 0.24
226 0.23
227 0.18
228 0.16
229 0.11
230 0.12
231 0.15
232 0.23
233 0.28
234 0.3
235 0.39
236 0.43
237 0.45
238 0.45
239 0.4
240 0.36
241 0.32
242 0.31
243 0.23
244 0.2
245 0.17
246 0.16
247 0.16
248 0.12
249 0.09
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.12
258 0.14
259 0.19
260 0.25
261 0.24
262 0.27
263 0.29
264 0.3
265 0.29
266 0.27
267 0.25
268 0.19
269 0.18
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.17
303 0.22
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.28
308 0.3
309 0.3
310 0.26
311 0.2
312 0.19
313 0.23
314 0.23
315 0.23
316 0.22
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.15
322 0.12
323 0.11
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.14
342 0.14
343 0.17
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.09
350 0.1
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.03
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.15
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.17
380 0.18
381 0.2
382 0.21
383 0.21
384 0.24
385 0.24
386 0.25
387 0.23
388 0.24
389 0.23
390 0.21
391 0.2
392 0.22
393 0.24
394 0.29
395 0.34
396 0.4
397 0.48
398 0.57
399 0.62
400 0.63
401 0.67
402 0.63
403 0.58
404 0.54
405 0.5
406 0.48
407 0.43
408 0.41
409 0.35
410 0.33
411 0.3
412 0.25
413 0.19
414 0.12
415 0.11
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.09
454 0.12
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.17
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.19
471 0.21
472 0.2
473 0.19
474 0.18
475 0.17
476 0.15
477 0.15
478 0.16
479 0.17
480 0.18
481 0.2
482 0.27
483 0.27
484 0.28
485 0.26
486 0.24
487 0.24
488 0.21
489 0.2
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.18
494 0.21
495 0.2
496 0.27
497 0.3
498 0.31
499 0.3
500 0.31
501 0.29
502 0.27
503 0.28
504 0.26
505 0.28
506 0.28
507 0.26
508 0.25
509 0.28
510 0.28
511 0.25
512 0.25
513 0.19
514 0.17
515 0.21
516 0.22
517 0.17
518 0.16
519 0.16
520 0.11
521 0.11
522 0.09
523 0.05
524 0.04
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.05
534 0.05
535 0.08
536 0.09
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.18
541 0.19
542 0.21
543 0.19
544 0.21
545 0.19
546 0.23
547 0.23
548 0.24
549 0.3
550 0.29
551 0.31
552 0.28
553 0.23
554 0.2
555 0.23
556 0.23
557 0.18
558 0.25
559 0.23
560 0.26
561 0.27
562 0.27
563 0.23
564 0.25
565 0.23
566 0.18
567 0.18
568 0.15
569 0.14
570 0.12
571 0.12
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.11
576 0.14
577 0.15
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.19
582 0.2
583 0.16
584 0.12
585 0.11
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.02
595 0.02
596 0.03
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.06
601 0.08
602 0.09
603 0.12
604 0.12
605 0.13
606 0.17
607 0.19
608 0.2
609 0.19
610 0.19
611 0.16
612 0.17
613 0.19
614 0.17
615 0.15
616 0.14
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.13
621 0.1
622 0.09
623 0.15
624 0.16
625 0.21
626 0.25
627 0.24
628 0.27
629 0.37
630 0.46
631 0.5
632 0.6
633 0.64
634 0.71
635 0.74
636 0.75
637 0.7
638 0.67
639 0.58
640 0.52
641 0.44
642 0.34
643 0.3
644 0.25
645 0.21
646 0.14
647 0.16
648 0.1
649 0.09
650 0.13
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.14
655 0.11
656 0.14
657 0.14
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.08
669 0.1
670 0.13
671 0.15
672 0.16
673 0.22
674 0.28
675 0.34
676 0.35
677 0.38
678 0.35
679 0.38
680 0.37
681 0.34
682 0.32
683 0.33
684 0.37
685 0.36
686 0.38
687 0.37
688 0.4
689 0.39
690 0.45
691 0.48
692 0.51
693 0.58
694 0.66
695 0.72
696 0.8
697 0.85
698 0.85
699 0.8
700 0.79
701 0.77
702 0.72
703 0.7
704 0.67
705 0.64
706 0.6
707 0.57
708 0.52
709 0.44
710 0.41
711 0.4
712 0.38
713 0.36
714 0.33
715 0.36
716 0.35
717 0.36
718 0.36
719 0.33
720 0.28
721 0.26
722 0.29
723 0.24
724 0.23
725 0.21
726 0.21
727 0.19
728 0.2
729 0.27
730 0.28
731 0.34
732 0.39
733 0.44
734 0.51
735 0.59
736 0.63
737 0.63
738 0.62
739 0.59
740 0.54
741 0.49
742 0.41
743 0.32
744 0.27
745 0.18
746 0.16
747 0.13
748 0.13
749 0.16
750 0.15
751 0.15
752 0.17
753 0.18
754 0.15
755 0.16
756 0.18
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.13
761 0.13
762 0.13
763 0.11
764 0.15
765 0.21
766 0.22
767 0.22
768 0.25
769 0.28
770 0.29
771 0.29
772 0.24
773 0.19
774 0.19
775 0.2
776 0.2
777 0.17
778 0.15
779 0.15
780 0.15
781 0.14
782 0.12
783 0.11
784 0.08
785 0.09
786 0.12
787 0.17
788 0.17
789 0.18
790 0.19
791 0.2
792 0.23
793 0.31
794 0.38
795 0.38
796 0.43
797 0.5
798 0.52
799 0.52
800 0.54
801 0.47
802 0.39
803 0.34
804 0.3
805 0.27
806 0.32
807 0.38
808 0.42
809 0.46
810 0.52
811 0.54
812 0.57
813 0.6
814 0.58
815 0.58
816 0.55