Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SSC9

Protein Details
Accession A0A1V8SSC9    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-123AEDTDGKKKKKRAYKARDPNAPKRPLTBasic
322-343DGEEGTKKKRGRKTNAAKAEEABasic
360-384SSDGSGDLKKEKKKKRKSVVAGSDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-120KKKKKRAYKARDPNAPKR
259-271SPVKKTPKSALKK
327-337TKKKRGRKTNA
368-376KKEKKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 11.332, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAHATPGEKRPVSIDVGEFVRTRDALSTAYMSLSTSIDHAVKAYIAHTNVVLAGDAALDVSYLTQPFNTITSAQIAQLALSHGTNGAIAFPAATAGAEDTDGKKKKKRAYKARDPNAPKRPLTAYFRFLQEQRPGLTIEMAKARDGAASKPGDLSKEATERWHKMAKEDQEPYKEAYRDALKDYEKEVEAYKASTGLPVEDAASPADEETLIPGITAAAAETEDEETSSDESSSDDDDDEEEEDAKPVMPPPPPPKAVSPVKKTPKSALKKTEKSAPVAASPAPQTPRFSSINPGGASQSVAKSSSPEIERKRKATSDAVADGEEGTKKKRGRKTNAAKAEEAAAAAAAAAAPPAAVLPSSDGSGDLKKEKKKKRKSVVAGSDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.25
3 0.27
4 0.29
5 0.26
6 0.23
7 0.23
8 0.2
9 0.19
10 0.17
11 0.17
12 0.15
13 0.17
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.11
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.04
45 0.03
46 0.03
47 0.04
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.06
86 0.09
87 0.17
88 0.23
89 0.27
90 0.33
91 0.41
92 0.49
93 0.58
94 0.66
95 0.69
96 0.74
97 0.81
98 0.86
99 0.88
100 0.9
101 0.88
102 0.88
103 0.86
104 0.81
105 0.7
106 0.63
107 0.58
108 0.54
109 0.53
110 0.48
111 0.42
112 0.38
113 0.41
114 0.39
115 0.36
116 0.37
117 0.34
118 0.32
119 0.29
120 0.28
121 0.26
122 0.23
123 0.25
124 0.19
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.25
147 0.27
148 0.3
149 0.33
150 0.3
151 0.3
152 0.36
153 0.37
154 0.39
155 0.41
156 0.41
157 0.4
158 0.41
159 0.4
160 0.38
161 0.33
162 0.26
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.23
167 0.25
168 0.21
169 0.21
170 0.23
171 0.21
172 0.18
173 0.18
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.11
236 0.12
237 0.18
238 0.24
239 0.3
240 0.33
241 0.34
242 0.36
243 0.41
244 0.48
245 0.5
246 0.52
247 0.55
248 0.63
249 0.65
250 0.65
251 0.65
252 0.66
253 0.66
254 0.68
255 0.68
256 0.69
257 0.71
258 0.72
259 0.73
260 0.66
261 0.61
262 0.57
263 0.48
264 0.39
265 0.34
266 0.32
267 0.25
268 0.23
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.24
273 0.25
274 0.29
275 0.29
276 0.29
277 0.31
278 0.33
279 0.37
280 0.34
281 0.32
282 0.28
283 0.26
284 0.26
285 0.22
286 0.18
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.2
293 0.21
294 0.28
295 0.36
296 0.45
297 0.52
298 0.54
299 0.59
300 0.56
301 0.57
302 0.56
303 0.52
304 0.49
305 0.45
306 0.42
307 0.37
308 0.34
309 0.29
310 0.24
311 0.22
312 0.16
313 0.16
314 0.21
315 0.26
316 0.34
317 0.43
318 0.52
319 0.59
320 0.69
321 0.77
322 0.82
323 0.87
324 0.84
325 0.76
326 0.67
327 0.6
328 0.49
329 0.38
330 0.26
331 0.16
332 0.11
333 0.09
334 0.07
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.02
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.17
352 0.2
353 0.25
354 0.31
355 0.4
356 0.5
357 0.6
358 0.69
359 0.77
360 0.84
361 0.88
362 0.92
363 0.93
364 0.94