Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SS70

Protein Details
Accession A0A1V8SS70    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MENGIEKKSKKRRREEASVIGDSQHydrophilic
26-50PIGDTAPAKKHKKSKKDYAVEAVKQHydrophilic
61-87MQPSLPPVKEKSKKRKLKPQEHATATEHydrophilic
113-134LDATTKKQSKKVKAERRDSAGEHydrophilic
152-173VPNGTFEQTKKKKKRTELEAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14KKSKKRRR
34-41KKHKKSKK
69-78KEKSKKRKLK
162-165KKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MENGIEKKSKKRRREEASVIGDSQDPIGDTAPAKKHKKSKKDYAVEAVKQESPFEEHAGSMQPSLPPVKEKSKKRKLKPQEHATATEEAAVAAVAAPAPDATLGMLPRASPELDATTKKQSKKVKAERRDSAGETTAVPNGVPRTELKEPIVPNGTFEQTKKKKKRTELEAAPPEPHEIVHVDEPPAPSATIEAETEVISTTITAIDEKLLDSKSPFKQQTASFYLALSPIAHHFPVEGLCAEHMSPLLLTYYPPLKGIVLSFSNPRMSETPEQGQQIDGTGPRSVVLGESIDEYAVIFVWLTVDILLFRPRKNTVLEGFVNLQNESMLGLICYNYFNAGVERSRLPKDWRWVEDESAADDAGAMARRGRRSAAGYYVDGKGKKVEGRVVFSVKDFEASPGAETGGGTINIYGTALSPQEDEKMDEDVRSKALVKDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.88
4 0.86
5 0.8
6 0.7
7 0.6
8 0.52
9 0.41
10 0.32
11 0.22
12 0.14
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.19
18 0.26
19 0.35
20 0.4
21 0.47
22 0.56
23 0.64
24 0.74
25 0.77
26 0.81
27 0.82
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.85
32 0.78
33 0.71
34 0.64
35 0.57
36 0.48
37 0.42
38 0.33
39 0.27
40 0.25
41 0.24
42 0.21
43 0.17
44 0.18
45 0.21
46 0.2
47 0.17
48 0.17
49 0.14
50 0.16
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.24
55 0.34
56 0.41
57 0.51
58 0.6
59 0.69
60 0.78
61 0.83
62 0.89
63 0.9
64 0.92
65 0.92
66 0.92
67 0.91
68 0.85
69 0.8
70 0.72
71 0.64
72 0.52
73 0.43
74 0.32
75 0.22
76 0.16
77 0.12
78 0.08
79 0.05
80 0.05
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.1
99 0.13
100 0.16
101 0.2
102 0.22
103 0.3
104 0.36
105 0.39
106 0.45
107 0.49
108 0.56
109 0.64
110 0.72
111 0.73
112 0.77
113 0.84
114 0.83
115 0.8
116 0.75
117 0.66
118 0.58
119 0.5
120 0.4
121 0.32
122 0.27
123 0.22
124 0.17
125 0.14
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.16
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.25
136 0.26
137 0.29
138 0.33
139 0.27
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.22
144 0.23
145 0.29
146 0.33
147 0.44
148 0.52
149 0.59
150 0.65
151 0.73
152 0.82
153 0.8
154 0.81
155 0.79
156 0.8
157 0.79
158 0.72
159 0.64
160 0.54
161 0.46
162 0.36
163 0.27
164 0.17
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.14
201 0.17
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.28
206 0.29
207 0.35
208 0.34
209 0.33
210 0.26
211 0.25
212 0.25
213 0.2
214 0.19
215 0.13
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.16
255 0.2
256 0.22
257 0.25
258 0.26
259 0.28
260 0.29
261 0.26
262 0.25
263 0.2
264 0.17
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.19
298 0.21
299 0.24
300 0.26
301 0.3
302 0.26
303 0.3
304 0.31
305 0.3
306 0.31
307 0.3
308 0.29
309 0.24
310 0.21
311 0.14
312 0.13
313 0.1
314 0.07
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.17
330 0.21
331 0.24
332 0.27
333 0.33
334 0.37
335 0.46
336 0.51
337 0.51
338 0.53
339 0.53
340 0.51
341 0.48
342 0.42
343 0.34
344 0.27
345 0.23
346 0.17
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.1
353 0.15
354 0.18
355 0.19
356 0.21
357 0.23
358 0.26
359 0.3
360 0.34
361 0.33
362 0.34
363 0.36
364 0.38
365 0.39
366 0.35
367 0.32
368 0.28
369 0.28
370 0.29
371 0.3
372 0.34
373 0.33
374 0.39
375 0.43
376 0.44
377 0.41
378 0.39
379 0.38
380 0.3
381 0.28
382 0.22
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.17
387 0.14
388 0.15
389 0.13
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.18
410 0.23
411 0.22
412 0.24
413 0.25
414 0.23
415 0.24
416 0.24
417 0.24