Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TMB0

Protein Details
Accession A0A1V8TMB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-402ISAVNGKSKDSKEKRKKEKGGEKERDKSKRKAAKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-402KSKDSKEKRKKEKGGEKERDKSKRKAAKP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKPKVQETRIALPGEMKKSAPKISQTARAKPSTLSADVVVESGSESDDGTEGGGSDSESEQEKRQNTTKPDIRKVKATEPTIPAVPDDTSSEEEEEEEEDEEDEGSSSDEELPDVTAKASAKPQKSTVTTNGAKRKADDSSSSEDGAADDPEVLPDAPPQKKSRTEAQTTAAPSLPTQPFIAPPGYTRVVTLPSSSIPQSSLAGKQVWHITAPSHLPISALTEASFEAIEKGTPVLTHKSARYSLTPLPSATATTVLLPTSEGYAPLSQSITRTLQIREVVELPELSGKQASQVTGSEKAAEVKLPAISRVKEQPRGLKMRYRPPGFGKGDAGRIGSGSESEDDEIGEQEAGTQSGFRMAKSIPEAISAVNGKSKDSKEKRKKEKGGEKERDKSKRKAAKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.47
3 0.42
4 0.35
5 0.35
6 0.39
7 0.45
8 0.43
9 0.42
10 0.46
11 0.5
12 0.59
13 0.61
14 0.65
15 0.66
16 0.64
17 0.59
18 0.52
19 0.52
20 0.47
21 0.42
22 0.34
23 0.28
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.17
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.07
44 0.07
45 0.09
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.22
50 0.25
51 0.3
52 0.35
53 0.42
54 0.45
55 0.53
56 0.57
57 0.6
58 0.68
59 0.72
60 0.69
61 0.7
62 0.69
63 0.68
64 0.69
65 0.64
66 0.61
67 0.55
68 0.55
69 0.48
70 0.42
71 0.34
72 0.27
73 0.23
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.19
108 0.24
109 0.27
110 0.3
111 0.33
112 0.37
113 0.4
114 0.42
115 0.4
116 0.42
117 0.44
118 0.49
119 0.54
120 0.52
121 0.49
122 0.46
123 0.44
124 0.38
125 0.36
126 0.32
127 0.28
128 0.31
129 0.32
130 0.3
131 0.27
132 0.24
133 0.22
134 0.19
135 0.14
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.08
144 0.14
145 0.16
146 0.2
147 0.23
148 0.28
149 0.32
150 0.36
151 0.43
152 0.43
153 0.46
154 0.46
155 0.46
156 0.45
157 0.42
158 0.4
159 0.31
160 0.24
161 0.19
162 0.22
163 0.19
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.17
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.11
181 0.1
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.1
224 0.13
225 0.16
226 0.16
227 0.2
228 0.22
229 0.24
230 0.24
231 0.25
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.24
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.16
240 0.13
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.17
262 0.17
263 0.2
264 0.22
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.18
270 0.17
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.13
282 0.16
283 0.19
284 0.2
285 0.18
286 0.17
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.14
291 0.11
292 0.14
293 0.14
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.23
298 0.32
299 0.37
300 0.42
301 0.46
302 0.51
303 0.55
304 0.62
305 0.61
306 0.61
307 0.62
308 0.64
309 0.7
310 0.65
311 0.62
312 0.61
313 0.67
314 0.62
315 0.58
316 0.54
317 0.47
318 0.47
319 0.43
320 0.38
321 0.27
322 0.24
323 0.21
324 0.15
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.16
347 0.16
348 0.21
349 0.25
350 0.28
351 0.21
352 0.23
353 0.24
354 0.21
355 0.26
356 0.23
357 0.2
358 0.21
359 0.21
360 0.21
361 0.27
362 0.31
363 0.38
364 0.46
365 0.56
366 0.63
367 0.74
368 0.83
369 0.87
370 0.93
371 0.93
372 0.94
373 0.93
374 0.94
375 0.94
376 0.92
377 0.91
378 0.91
379 0.9
380 0.87
381 0.85
382 0.85