FuNGI

A0A1V8TC43

Protein Details

Accession

A0A1V8TC43

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
420-447	LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
426-439	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MSLSLEEVEAYLFENGYQGALTALQNDARAGAKRKRAETSSPDISDANSESSRESLSATPEPSAPAAKKAKLATPPAESESDSEDEDSSDGDEEDKSEDVSSSEDSESEDEEDVMDTTEPVVAAAIADDASSSSASSRSAESDDSSSSEEEETAALLPNGVASDDASDCDSGSSSDDSDDESEGGESESSGESPSDSEEDESAESGADNSSVASSIFGGGSGIKVEASGSVTSSSDSEESESAKDAVDAADGSSDSGSSSSSDESDAAESSGEIDDGESDTSSDSSSDESDAPAKPATAVPVPIVKKAGKKNKVEAKAEPEVASASSSATLAGASPEPVTQPSSAEVSSGESGMHPSRLARMDPTAAPSAAVVTAAAAAKIKKESNTPFSRIPANQAVDPKFASNQYVPYDYAEKAHQDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDFAPKGIKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.08
4	0.07
5	0.06
6	0.06
7	0.08
8	0.08
9	0.09
10	0.1
11	0.11
12	0.12
13	0.12
14	0.13
15	0.14
16	0.19
17	0.26
18	0.32
19	0.39
20	0.46
21	0.51
22	0.56
23	0.59
24	0.62
25	0.62
26	0.63
27	0.63
28	0.58
29	0.55
30	0.48
31	0.43
32	0.38
33	0.32
34	0.28
35	0.2
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.19
40	0.16
41	0.16
42	0.14
43	0.19
44	0.22
45	0.23
46	0.23
47	0.23
48	0.24
49	0.23
50	0.26
51	0.22
52	0.26
53	0.31
54	0.31
55	0.36
56	0.37
57	0.41
58	0.43
59	0.48
60	0.45
61	0.44
62	0.45
63	0.43
64	0.42
65	0.37
66	0.32
67	0.29
68	0.26
69	0.21
70	0.19
71	0.16
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.09
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.13
96	0.12
97	0.09
98	0.09
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.05
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.04
113	0.03
114	0.03
115	0.03
116	0.03
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.07
124	0.08
125	0.09
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.14
130	0.14
131	0.14
132	0.15
133	0.14
134	0.13
135	0.12
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.03
150	0.05
151	0.05
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.07
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.05
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.08
275	0.07
276	0.08
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.13
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.17
289	0.18
290	0.19
291	0.22
292	0.21
293	0.27
294	0.36
295	0.45
296	0.47
297	0.51
298	0.59
299	0.65
300	0.71
301	0.68
302	0.63
303	0.6
304	0.57
305	0.54
306	0.45
307	0.36
308	0.29
309	0.25
310	0.21
311	0.13
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.09
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.11
343	0.11
344	0.15
345	0.18
346	0.19
347	0.18
348	0.2
349	0.23
350	0.23
351	0.27
352	0.25
353	0.22
354	0.21
355	0.19
356	0.17
357	0.13
358	0.12
359	0.08
360	0.05
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.1
367	0.14
368	0.16
369	0.17
370	0.24
371	0.31
372	0.39
373	0.46
374	0.49
375	0.49
376	0.5
377	0.55
378	0.48
379	0.48
380	0.46
381	0.43
382	0.41
383	0.45
384	0.45
385	0.41
386	0.41
387	0.36
388	0.3
389	0.28
390	0.29
391	0.24
392	0.26
393	0.27
394	0.29
395	0.28
396	0.28
397	0.31
398	0.26
399	0.27
400	0.25
401	0.23
402	0.23
403	0.24
404	0.21
405	0.19
406	0.21
407	0.24
408	0.28
409	0.26
410	0.25
411	0.27
412	0.28
413	0.33
414	0.36
415	0.41
416	0.46
417	0.56
418	0.66
419	0.73
420	0.82
421	0.85
422	0.9
423	0.91
424	0.9
425	0.9
426	0.88
427	0.86
428	0.86
429	0.78
430	0.69
431	0.59
432	0.56
433	0.45
434	0.39
435	0.32
436	0.22

A0A1V8TC43

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer