FuNGI

A0A1V8SQA5

Protein Details

Accession

A0A1V8SQA5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
165-184	PASGAAKRAPRKKNEKNVMD	Hydrophilic
394-427	EEQQKEQGKEQKRRERRMKKRLIKKEKQYHYESD	Basic
473-492	SKGTNTPSRRPEKKDGVRLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-27	RPRKRAAPSAFLARKPPLKK
170-177	AKRAPRKK
402-420	KEQKRRERRMKKRLIKKEK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSNAVPRPRKRAAPSAFLARKPPLKKAALSAAGTPSQRAYTPTQAPNGSTASLTEKTQHDRPPDQVFDVYISKSDLEQGMRFHGFKFDVKRDNENAPTQIIDPWNASEFTRPVHLHRRYAHDKQDNGDQSDAPSGIDDKEREAFNAKKAERQAEREANQANIAPASGAAKRAPRKKNEKNVMDVYYDENNPKQQKAAQLRYEETKPWHLEDFDNNNTWIGSYQEPLSEQSVLLTLPETADGPFTMVPVERWYKFTETGRLPSMSTEQAEKIMASKIKPSRWFMGTQVGQQEAKKAAVQMLKEKAAAARRAAEDDTAAAPRVKDEGDFYNADVDVLDMEFADEEFQDDDEGALVVGEDDADTREIERRIREEMRGANISAPGLKDQDADYDQEEEQQKEQGKEQKRRERRMKKRLIKKEKQYHYESDSDSDPYNDSSEETDSEEERERADEEKKAEEEALKLTQGGDPSGASSKGTNTPSRRPEKKDGVRLTSLKRPGSPNLSDVSGNESRKKQRLANDETRRIRLKNSPPGSPRNDDTPSGSRAQSPAPVAMPSLEEVRAAIPPEGIAIKDLTLKFRARVQGKENTTAFIKLVSQAGQRDSTSKLIVPKAGEQEGTKEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.67
3	0.7
4	0.69
5	0.63
6	0.62
7	0.58
8	0.6
9	0.56
10	0.58
11	0.56
12	0.55
13	0.55
14	0.55
15	0.58
16	0.56
17	0.54
18	0.5
19	0.45
20	0.45
21	0.42
22	0.37
23	0.29
24	0.24
25	0.23
26	0.24
27	0.25
28	0.29
29	0.37
30	0.41
31	0.45
32	0.45
33	0.46
34	0.45
35	0.41
36	0.33
37	0.25
38	0.22
39	0.21
40	0.21
41	0.21
42	0.23
43	0.25
44	0.3
45	0.37
46	0.42
47	0.44
48	0.46
49	0.52
50	0.55
51	0.54
52	0.51
53	0.46
54	0.4
55	0.36
56	0.35
57	0.29
58	0.22
59	0.2
60	0.17
61	0.16
62	0.18
63	0.17
64	0.17
65	0.19
66	0.19
67	0.24
68	0.26
69	0.27
70	0.24
71	0.26
72	0.26
73	0.29
74	0.35
75	0.38
76	0.43
77	0.46
78	0.53
79	0.53
80	0.57
81	0.57
82	0.53
83	0.47
84	0.4
85	0.37
86	0.31
87	0.31
88	0.25
89	0.22
90	0.18
91	0.18
92	0.19
93	0.19
94	0.18
95	0.18
96	0.18
97	0.17
98	0.23
99	0.22
100	0.26
101	0.36
102	0.41
103	0.44
104	0.48
105	0.56
106	0.57
107	0.64
108	0.68
109	0.66
110	0.63
111	0.59
112	0.63
113	0.59
114	0.54
115	0.48
116	0.38
117	0.31
118	0.31
119	0.29
120	0.19
121	0.14
122	0.12
123	0.12
124	0.15
125	0.14
126	0.14
127	0.18
128	0.18
129	0.19
130	0.24
131	0.25
132	0.27
133	0.36
134	0.34
135	0.36
136	0.4
137	0.47
138	0.46
139	0.5
140	0.53
141	0.52
142	0.53
143	0.53
144	0.51
145	0.44
146	0.4
147	0.34
148	0.26
149	0.17
150	0.15
151	0.09
152	0.08
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.18
158	0.25
159	0.35
160	0.42
161	0.49
162	0.6
163	0.68
164	0.77
165	0.81
166	0.79
167	0.77
168	0.75
169	0.69
170	0.59
171	0.5
172	0.42
173	0.35
174	0.32
175	0.26
176	0.22
177	0.25
178	0.26
179	0.26
180	0.24
181	0.23
182	0.31
183	0.39
184	0.45
185	0.45
186	0.46
187	0.48
188	0.51
189	0.5
190	0.44
191	0.38
192	0.37
193	0.33
194	0.31
195	0.31
196	0.28
197	0.27
198	0.32
199	0.35
200	0.31
201	0.31
202	0.29
203	0.27
204	0.26
205	0.24
206	0.17
207	0.12
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.12
214	0.13
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.08
221	0.06
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.1
236	0.14
237	0.13
238	0.15
239	0.18
240	0.2
241	0.23
242	0.25
243	0.28
244	0.27
245	0.29
246	0.3
247	0.29
248	0.26
249	0.24
250	0.24
251	0.18
252	0.16
253	0.15
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.11
258	0.1
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.18
263	0.22
264	0.26
265	0.31
266	0.33
267	0.34
268	0.34
269	0.35
270	0.3
271	0.35
272	0.31
273	0.29
274	0.27
275	0.25
276	0.24
277	0.22
278	0.23
279	0.15
280	0.15
281	0.13
282	0.12
283	0.14
284	0.15
285	0.16
286	0.19
287	0.21
288	0.21
289	0.2
290	0.2
291	0.19
292	0.21
293	0.22
294	0.17
295	0.17
296	0.17
297	0.19
298	0.19
299	0.16
300	0.12
301	0.11
302	0.11
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.1
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.14
318	0.13
319	0.11
320	0.08
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.09
351	0.1
352	0.13
353	0.15
354	0.16
355	0.21
356	0.24
357	0.24
358	0.25
359	0.27
360	0.3
361	0.29
362	0.28
363	0.23
364	0.21
365	0.2
366	0.17
367	0.14
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.18
380	0.2
381	0.18
382	0.18
383	0.21
384	0.23
385	0.21
386	0.26
387	0.3
388	0.37
389	0.46
390	0.55
391	0.62
392	0.69
393	0.78
394	0.84
395	0.87
396	0.89
397	0.91
398	0.92
399	0.91
400	0.92
401	0.93
402	0.93
403	0.92
404	0.92
405	0.91
406	0.89
407	0.86
408	0.8
409	0.74
410	0.67
411	0.63
412	0.53
413	0.45
414	0.37
415	0.32
416	0.27
417	0.22
418	0.19
419	0.14
420	0.14
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.12
425	0.12
426	0.13
427	0.13
428	0.13
429	0.15
430	0.17
431	0.16
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.16
436	0.19
437	0.2
438	0.2
439	0.24
440	0.24
441	0.24
442	0.24
443	0.22
444	0.21
445	0.2
446	0.19
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.13
453	0.1
454	0.08
455	0.1
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.1
460	0.13
461	0.19
462	0.23
463	0.28
464	0.32
465	0.4
466	0.49
467	0.59
468	0.63
469	0.65
470	0.71
471	0.75
472	0.79
473	0.81
474	0.79
475	0.75
476	0.75
477	0.72
478	0.67
479	0.65
480	0.62
481	0.54
482	0.51
483	0.48
484	0.47
485	0.49
486	0.46
487	0.4
488	0.36
489	0.36
490	0.32
491	0.28
492	0.29
493	0.28
494	0.29
495	0.32
496	0.36
497	0.42
498	0.48
499	0.53
500	0.51
501	0.53
502	0.6
503	0.65
504	0.69
505	0.72
506	0.75
507	0.76
508	0.77
509	0.73
510	0.64
511	0.6
512	0.59
513	0.58
514	0.59
515	0.58
516	0.6
517	0.62
518	0.69
519	0.7
520	0.66
521	0.59
522	0.56
523	0.55
524	0.48
525	0.48
526	0.45
527	0.42
528	0.39
529	0.37
530	0.32
531	0.3
532	0.31
533	0.29
534	0.26
535	0.25
536	0.23
537	0.23
538	0.21
539	0.2
540	0.19
541	0.16
542	0.16
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.13
548	0.14
549	0.13
550	0.11
551	0.11
552	0.13
553	0.13
554	0.12
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.16
559	0.18
560	0.2
561	0.24
562	0.26
563	0.27
564	0.32
565	0.41
566	0.39
567	0.45
568	0.48
569	0.53
570	0.56
571	0.62
572	0.57
573	0.51
574	0.48
575	0.42
576	0.36
577	0.28
578	0.24
579	0.18
580	0.2
581	0.2
582	0.22
583	0.24
584	0.27
585	0.29
586	0.28
587	0.28
588	0.29
589	0.3
590	0.28
591	0.28
592	0.31
593	0.32
594	0.35
595	0.35
596	0.38
597	0.41
598	0.41
599	0.4
600	0.35

A0A1V8SQA5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer