Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SGV2

Protein Details
Accession A0A1V8SGV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-49GGLRDDRRTHKPRYERDRSRSPRKERPNERRRDRSPTADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-74DDRRTHKPRYERDRSRSPRKERPNERRRDRSPTADSRGQNSRGGRGGDRGGRGGPRGGGN
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDRNGTRNDRGGLRDDRRTHKPRYERDRSRSPRKERPNERRRDRSPTADSRGQNSRGGRGGDRGGRGGPRGGGNHMNDRESNNARPPHNRQPEPPRPNSRQAPSQPRQNGNAPKPTSGKGVKPTPDLVMDDPPSEEDEEAAMQRLMGFQGFKSTKNTKVPGNDRNYAVSKVKKAEYRQYMNRVGGFNRPLSPGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.59
4 0.65
5 0.68
6 0.69
7 0.69
8 0.73
9 0.74
10 0.77
11 0.82
12 0.82
13 0.84
14 0.87
15 0.87
16 0.89
17 0.88
18 0.87
19 0.86
20 0.87
21 0.9
22 0.9
23 0.91
24 0.91
25 0.91
26 0.92
27 0.92
28 0.87
29 0.86
30 0.8
31 0.78
32 0.76
33 0.74
34 0.71
35 0.68
36 0.63
37 0.59
38 0.6
39 0.53
40 0.49
41 0.42
42 0.38
43 0.34
44 0.35
45 0.31
46 0.27
47 0.29
48 0.28
49 0.28
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.22
54 0.19
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.17
59 0.21
60 0.21
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.26
65 0.26
66 0.29
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.31
71 0.31
72 0.36
73 0.42
74 0.47
75 0.53
76 0.52
77 0.52
78 0.58
79 0.67
80 0.68
81 0.69
82 0.67
83 0.62
84 0.68
85 0.67
86 0.6
87 0.57
88 0.57
89 0.59
90 0.55
91 0.59
92 0.57
93 0.55
94 0.55
95 0.54
96 0.56
97 0.5
98 0.54
99 0.46
100 0.44
101 0.43
102 0.41
103 0.39
104 0.34
105 0.33
106 0.31
107 0.36
108 0.36
109 0.36
110 0.36
111 0.31
112 0.3
113 0.29
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.15
137 0.17
138 0.18
139 0.25
140 0.29
141 0.35
142 0.42
143 0.45
144 0.42
145 0.5
146 0.57
147 0.59
148 0.62
149 0.6
150 0.54
151 0.57
152 0.54
153 0.49
154 0.48
155 0.44
156 0.42
157 0.43
158 0.47
159 0.48
160 0.51
161 0.56
162 0.6
163 0.63
164 0.66
165 0.69
166 0.7
167 0.68
168 0.66
169 0.58
170 0.51
171 0.49
172 0.44
173 0.4
174 0.36
175 0.36