FuNGI

A0A1V8TH88

Protein Details

Accession

A0A1V8TH88

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-76	EAAPAPPKAKKQKTKPTEVVEED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000814 TBP IPR030491 TBP_CS IPR012295 TBP_dom_sf IPR033710 TBP_eukaryotic
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF00352 TBP
PROSITE	View protein in PROSITE PS00351 TFIID
CDD	cd04516 TBP_eukaryotes

Amino Acid Sequences

MSTRKRKQDEELVELPEDGSDEESEEEYISEGDEDVSEVGSEEEEEEDDEVEAEAAPAPPKAKKQKTKPTEVVEEDEPAGEEDEDVEEEDLEDDEAAPDSDGGADEDAAETAKSSGHLLRDHFSSSATFTGAYVLLIPSKALQTATSINHTQSVDRSILESTLEIPHSKRNHFTVAMDPYMTHPSTALQAKEFTAPGTLSGFAGGQPNGHLTPPSSEKDGLAQQTGKLAITNGASQGGNAVQAAGVTPATPAATPGAVQGVSGIVPTLQNIVATVNLDCRLDLKTIALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKLGFNAKFTDFKIQNIVGSCDIKFPIRLEGLASRHHMFSSYEPELFPGLIYRMMKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKVREEIYQAFELIYPVLSDFRKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.42
3	0.31
4	0.24
5	0.16
6	0.12
7	0.09
8	0.09
9	0.1
10	0.11
11	0.11
12	0.11
13	0.1
14	0.09
15	0.09
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.06
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.06
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.06
29	0.06
30	0.06
31	0.07
32	0.07
33	0.08
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.07
42	0.08
43	0.08
44	0.09
45	0.12
46	0.15
47	0.24
48	0.35
49	0.44
50	0.53
51	0.63
52	0.73
53	0.8
54	0.87
55	0.87
56	0.83
57	0.82
58	0.75
59	0.69
60	0.6
61	0.53
62	0.43
63	0.34
64	0.27
65	0.19
66	0.16
67	0.11
68	0.09
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.07
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.05
81	0.05
82	0.06
83	0.06
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.05
89	0.06
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.06
101	0.07
102	0.1
103	0.13
104	0.16
105	0.18
106	0.2
107	0.21
108	0.22
109	0.21
110	0.19
111	0.16
112	0.15
113	0.14
114	0.12
115	0.11
116	0.09
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.09
131	0.13
132	0.14
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.22
137	0.22
138	0.2
139	0.18
140	0.19
141	0.16
142	0.15
143	0.16
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.1
152	0.11
153	0.18
154	0.21
155	0.23
156	0.25
157	0.26
158	0.29
159	0.29
160	0.3
161	0.29
162	0.29
163	0.28
164	0.25
165	0.22
166	0.2
167	0.23
168	0.21
169	0.14
170	0.11
171	0.11
172	0.14
173	0.17
174	0.15
175	0.12
176	0.13
177	0.14
178	0.16
179	0.15
180	0.12
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.17
206	0.19
207	0.17
208	0.15
209	0.14
210	0.12
211	0.13
212	0.14
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.03
229	0.03
230	0.04
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.12
273	0.16
274	0.16
275	0.16
276	0.16
277	0.18
278	0.19
279	0.19
280	0.26
281	0.28
282	0.3
283	0.32
284	0.32
285	0.31
286	0.29
287	0.31
288	0.28
289	0.31
290	0.34
291	0.34
292	0.37
293	0.4
294	0.41
295	0.4
296	0.36
297	0.29
298	0.27
299	0.24
300	0.21
301	0.18
302	0.2
303	0.19
304	0.18
305	0.17
306	0.13
307	0.12
308	0.11
309	0.1
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.11
317	0.12
318	0.13
319	0.14
320	0.16
321	0.21
322	0.2
323	0.24
324	0.26
325	0.29
326	0.34
327	0.41
328	0.46
329	0.47
330	0.52
331	0.5
332	0.53
333	0.54
334	0.55
335	0.49
336	0.42
337	0.38
338	0.36
339	0.36
340	0.31
341	0.36
342	0.28
343	0.28
344	0.33
345	0.31
346	0.31
347	0.3
348	0.31
349	0.25
350	0.26
351	0.25
352	0.21
353	0.22
354	0.2
355	0.2
356	0.18
357	0.21
358	0.2
359	0.2
360	0.21
361	0.26
362	0.27
363	0.3
364	0.33
365	0.29
366	0.29
367	0.28
368	0.27
369	0.22
370	0.23
371	0.28
372	0.27
373	0.26
374	0.25
375	0.26
376	0.26
377	0.24
378	0.2
379	0.14
380	0.12
381	0.15
382	0.17
383	0.19
384	0.26
385	0.28
386	0.29
387	0.28
388	0.3
389	0.33
390	0.32
391	0.3
392	0.24
393	0.29
394	0.28
395	0.28
396	0.25
397	0.17
398	0.17
399	0.15
400	0.14
401	0.07
402	0.09
403	0.14
404	0.15
405	0.18
406	0.19
407	0.2
408	0.23
409	0.26
410	0.25
411	0.26
412	0.25
413	0.23
414	0.23
415	0.22
416	0.2
417	0.16
418	0.15
419	0.1
420	0.09
421	0.13

A0A1V8TH88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer