Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8UL40

Protein Details
Accession A0A1V8UL40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
517-536SVERANRKRNELKKAIEEKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
521-546ANRKRNELKKAIEEKAKVPVKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 10.666, cyto 7, cyto_mito 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSVPVSWHTIQSDSASLPRLLLKADLGRTGYTVTLTDLSRVWKQTLDRQATFDYAKKHRTVIDPSEDDEQYDILSTKLQDALRQHDGNSTSISAAKSGDLVLDVSIPMPKPLAALQWTFHLTQCTDTAVADTLVYPLLERAQVLKHQMDRLLSELQANDKVISRITDKLERSAYDLTDVFPVAAGVKLNKERSQREQLSKYVQGLGKFDRGAWTDQLDIAEVASGAVGIGKDLINAEGVDADHVEWWRSLRGSITLGTESKPSDHVTQTVSEIESQGQKVSKAEDDFQRQATPPGLHVTQPAVANNAASDSDDLDRSSQASNPSRRVYRDAVQGDTGMKPATLPNPDDGSETEGEEDVTLPDASPQKVIKTRSSSPVAPVSPTVLPSTGVQSSAVKKLGVLGGRKRMASSVEEATPPSTAEEPSIQGTGPSMRPKSRLGTLGGKAARNETETSPQPTPPSVTSPSPVKAKKLGTIGGASAASHVSPDAHTSTHMEELRTSRATSRAITPVNEVRETSVERANRKRNELKKAIEEKAKVPVKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.21
4 0.21
5 0.22
6 0.21
7 0.19
8 0.19
9 0.2
10 0.23
11 0.25
12 0.27
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.25
17 0.22
18 0.17
19 0.15
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.2
26 0.24
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.3
31 0.38
32 0.46
33 0.5
34 0.47
35 0.48
36 0.49
37 0.48
38 0.48
39 0.43
40 0.41
41 0.39
42 0.43
43 0.42
44 0.42
45 0.43
46 0.47
47 0.51
48 0.5
49 0.53
50 0.49
51 0.49
52 0.52
53 0.47
54 0.41
55 0.34
56 0.26
57 0.16
58 0.16
59 0.13
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.16
65 0.16
66 0.19
67 0.23
68 0.3
69 0.35
70 0.36
71 0.35
72 0.35
73 0.36
74 0.34
75 0.32
76 0.26
77 0.19
78 0.21
79 0.2
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.11
129 0.14
130 0.18
131 0.21
132 0.23
133 0.25
134 0.27
135 0.27
136 0.25
137 0.26
138 0.24
139 0.2
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.2
153 0.26
154 0.26
155 0.3
156 0.31
157 0.3
158 0.31
159 0.29
160 0.26
161 0.22
162 0.21
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.1
174 0.15
175 0.18
176 0.23
177 0.28
178 0.32
179 0.39
180 0.48
181 0.51
182 0.55
183 0.56
184 0.55
185 0.56
186 0.54
187 0.48
188 0.43
189 0.38
190 0.31
191 0.3
192 0.28
193 0.25
194 0.23
195 0.21
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.18
200 0.17
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.12
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.15
271 0.18
272 0.24
273 0.25
274 0.26
275 0.26
276 0.23
277 0.24
278 0.23
279 0.19
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.16
307 0.23
308 0.27
309 0.31
310 0.35
311 0.36
312 0.38
313 0.41
314 0.39
315 0.36
316 0.41
317 0.38
318 0.36
319 0.33
320 0.32
321 0.28
322 0.24
323 0.2
324 0.12
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.18
337 0.16
338 0.15
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.18
354 0.24
355 0.27
356 0.3
357 0.34
358 0.38
359 0.42
360 0.46
361 0.43
362 0.41
363 0.44
364 0.39
365 0.33
366 0.3
367 0.26
368 0.22
369 0.22
370 0.19
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.16
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.17
380 0.2
381 0.2
382 0.17
383 0.16
384 0.18
385 0.2
386 0.22
387 0.24
388 0.26
389 0.34
390 0.36
391 0.36
392 0.34
393 0.33
394 0.31
395 0.28
396 0.26
397 0.21
398 0.21
399 0.21
400 0.22
401 0.21
402 0.19
403 0.17
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.15
412 0.13
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.17
417 0.22
418 0.24
419 0.27
420 0.3
421 0.33
422 0.37
423 0.38
424 0.38
425 0.36
426 0.4
427 0.39
428 0.44
429 0.45
430 0.42
431 0.38
432 0.37
433 0.33
434 0.28
435 0.29
436 0.23
437 0.27
438 0.29
439 0.34
440 0.34
441 0.34
442 0.34
443 0.33
444 0.33
445 0.29
446 0.3
447 0.29
448 0.29
449 0.31
450 0.34
451 0.37
452 0.42
453 0.42
454 0.41
455 0.43
456 0.44
457 0.45
458 0.45
459 0.43
460 0.37
461 0.36
462 0.32
463 0.28
464 0.25
465 0.19
466 0.16
467 0.13
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.13
477 0.16
478 0.18
479 0.24
480 0.26
481 0.24
482 0.26
483 0.29
484 0.33
485 0.32
486 0.31
487 0.27
488 0.3
489 0.32
490 0.31
491 0.33
492 0.35
493 0.36
494 0.36
495 0.4
496 0.42
497 0.44
498 0.43
499 0.38
500 0.33
501 0.34
502 0.36
503 0.33
504 0.33
505 0.33
506 0.4
507 0.49
508 0.56
509 0.59
510 0.65
511 0.72
512 0.74
513 0.79
514 0.8
515 0.78
516 0.79
517 0.8
518 0.79
519 0.77
520 0.72
521 0.64
522 0.65
523 0.66
524 0.6
525 0.61
526 0.64