Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8UHP8

Protein Details
Accession A0A1V8UHP8    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50QAAKDKGKLVRPRKTSRTLGEHydrophilic
140-163GTGVRPAATKKSRKPKTKSESIILHydrophilic
226-249EEMATTVKPKRKRTVAKKEDDGELHydrophilic
295-314KDVPKARKPRAKKVALPTSDHydrophilic
324-346LLSKQANTRKPRVRQKTEQLTYFHydrophilic
511-545PPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKPQTITALAHydrophilic
981-1000VATAVKKPRGRPRKDTPLSDHydrophilic
1071-1094ESPATPSSRRRRRATSSPPTIRPLHydrophilic
1176-1207NGKGVRISVRRPKPKVKGKKKGDEKTVGTEREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-157KKPRKETEPKSGTGVRPAATKKSRKPKTK
233-243KPKRKRTVAKK
299-307KARKPRAKK
497-538KRRKIELEDSVKMPPPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKP
593-607KIKKPRKSRAKVPNG
614-627GGKVSKVKAKAKVK
986-994KKPRGRPRK
1007-1014KRARGRPR
1181-1197RISVRRPKPKVKGKKKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MGFTTARSLHTLLATVGDAEEDGTAVAREQAAKDKGKLVRPRKTSRTLGEVAKGSVSPRLAAFAHAEAQSTGTRSPHGPPALRKSTTPSVDAASPGRSRRPSISLSEFSFNGNAAPAVVSPIHLALPIKKPRKETEPKSGTGVRPAATKKSRKPKTKSESIILNSDEPDEALTAEIGDSVATVPELEEISAEHVRNNEEPPRRTGPAIANFAYHTSALPNPMAPAEEMATTVKPKRKRTVAKKEDDGELVAKRSKVARTKSKTTDPSVGITAGSSALAELSINTIVPPAMQGSEKDVPKARKPRAKKVALPTSDLVTAGDAPELLSKQANTRKPRVRQKTEQLTYFASIAPAMASVAGAAQPQPEPIADITPEGEINIFSQVNAELDQTLHEKPLADFLGTIESVPGEPATKDLAGELNPSELAPTRRRSWTPTHEHRLLHNVTGDISREVDADSDVDDIPERVSMAQLLQSFTYAAADGQSMPQDKRAGSVEAQPKRRKIELEDSVKMPPPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKPQTITALATAAYLSVIVPEIAQPTVSSYFDTVKPNSDDSRDPEKPDEGEATEVVAKIKKPRKSRAKVPNGDGTLINGGKVSKVKAKAKVKFKEVDYRPPLCTPGKANAAMMTQDFLFGTSSQLAAEESPTFIREMQLAIRQSEVQSPQRPGRRSKSEGYGTQIVTQMPGANSPTAKSYSRVPTAPHGTDLSILQAERELWCSGSRDYSGGMLEKERAFEARALLDEEPLNVTKTESEALQPLVRATIADLNAPLRTGHPLKTAEVPACIIEAVAPQQMDLPTAPSAVLDPVEHAADEPASGELQSGEPTQLAESVMIDLSYTSPIAEDSAIELPGLSKQDAAMTGMRQPLTNCDQDDDGWALLRSDISLSSEILPDIPAPPLLRHSESFSHKSHSPTPHVPIPGPPRTALRSLDANANMKVMEALPKATTLSISRSHTSTTAGVATAVKKPRGRPRKDTPLSDVATEPVKRARGRPRKDLTATNAPATSEAQLKSAAIPAFLASPPALRKQHSHPFTLSQPAEWANIDEISDLESPATPSSRRRRRATSSPPTIRPLDFSPPISPSIKAPAPAPPTSLSNAALKPTDPEWLSQIPILFPRITATITSSPPSTDLKHPSWHEKILLYDPIVLEDLTAYLNGKGVRISVRRPKPKVKGKKKGDEKTVGTEREREVVEEELKGWMVQKWCEEFSICCLWREGLRGGVKGNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.08
6 0.08
7 0.07
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.06
13 0.07
14 0.08
15 0.1
16 0.12
17 0.2
18 0.26
19 0.31
20 0.33
21 0.4
22 0.45
23 0.52
24 0.61
25 0.62
26 0.66
27 0.71
28 0.79
29 0.8
30 0.82
31 0.82
32 0.77
33 0.75
34 0.71
35 0.67
36 0.63
37 0.57
38 0.49
39 0.42
40 0.37
41 0.3
42 0.28
43 0.24
44 0.19
45 0.16
46 0.19
47 0.17
48 0.19
49 0.21
50 0.18
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.18
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.17
61 0.18
62 0.22
63 0.28
64 0.34
65 0.38
66 0.44
67 0.53
68 0.59
69 0.59
70 0.56
71 0.56
72 0.58
73 0.55
74 0.49
75 0.41
76 0.36
77 0.35
78 0.37
79 0.31
80 0.28
81 0.29
82 0.3
83 0.36
84 0.36
85 0.39
86 0.41
87 0.44
88 0.43
89 0.46
90 0.51
91 0.49
92 0.49
93 0.49
94 0.44
95 0.4
96 0.37
97 0.29
98 0.21
99 0.16
100 0.12
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.15
113 0.25
114 0.34
115 0.42
116 0.45
117 0.51
118 0.56
119 0.65
120 0.71
121 0.69
122 0.71
123 0.69
124 0.67
125 0.68
126 0.68
127 0.6
128 0.57
129 0.52
130 0.42
131 0.41
132 0.42
133 0.45
134 0.47
135 0.55
136 0.57
137 0.65
138 0.74
139 0.77
140 0.82
141 0.84
142 0.85
143 0.86
144 0.83
145 0.79
146 0.78
147 0.71
148 0.69
149 0.6
150 0.52
151 0.42
152 0.36
153 0.29
154 0.2
155 0.17
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.11
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.25
184 0.29
185 0.34
186 0.37
187 0.42
188 0.47
189 0.47
190 0.46
191 0.46
192 0.46
193 0.46
194 0.49
195 0.43
196 0.38
197 0.36
198 0.36
199 0.32
200 0.24
201 0.16
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.15
218 0.21
219 0.26
220 0.32
221 0.4
222 0.48
223 0.57
224 0.67
225 0.75
226 0.8
227 0.84
228 0.85
229 0.86
230 0.8
231 0.73
232 0.64
233 0.54
234 0.46
235 0.38
236 0.32
237 0.27
238 0.23
239 0.21
240 0.24
241 0.29
242 0.33
243 0.4
244 0.48
245 0.53
246 0.62
247 0.68
248 0.73
249 0.73
250 0.7
251 0.69
252 0.6
253 0.55
254 0.48
255 0.41
256 0.31
257 0.24
258 0.19
259 0.12
260 0.1
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.15
280 0.21
281 0.22
282 0.25
283 0.3
284 0.34
285 0.43
286 0.52
287 0.55
288 0.57
289 0.65
290 0.73
291 0.77
292 0.8
293 0.79
294 0.79
295 0.8
296 0.73
297 0.7
298 0.6
299 0.52
300 0.45
301 0.37
302 0.26
303 0.17
304 0.15
305 0.1
306 0.09
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.16
315 0.24
316 0.31
317 0.36
318 0.45
319 0.53
320 0.62
321 0.73
322 0.77
323 0.78
324 0.8
325 0.85
326 0.86
327 0.83
328 0.76
329 0.68
330 0.6
331 0.52
332 0.43
333 0.32
334 0.21
335 0.15
336 0.12
337 0.09
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.07
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.16
382 0.15
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.14
411 0.17
412 0.21
413 0.24
414 0.29
415 0.31
416 0.35
417 0.41
418 0.47
419 0.53
420 0.58
421 0.62
422 0.63
423 0.63
424 0.59
425 0.58
426 0.5
427 0.42
428 0.33
429 0.25
430 0.21
431 0.2
432 0.2
433 0.13
434 0.12
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.08
469 0.1
470 0.1
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.24
479 0.3
480 0.35
481 0.43
482 0.45
483 0.47
484 0.49
485 0.5
486 0.45
487 0.42
488 0.45
489 0.46
490 0.49
491 0.48
492 0.45
493 0.45
494 0.45
495 0.39
496 0.3
497 0.26
498 0.28
499 0.35
500 0.43
501 0.48
502 0.55
503 0.61
504 0.71
505 0.77
506 0.78
507 0.77
508 0.78
509 0.77
510 0.75
511 0.8
512 0.73
513 0.7
514 0.7
515 0.68
516 0.66
517 0.7
518 0.75
519 0.75
520 0.82
521 0.85
522 0.86
523 0.89
524 0.84
525 0.83
526 0.81
527 0.73
528 0.65
529 0.56
530 0.45
531 0.35
532 0.32
533 0.22
534 0.13
535 0.09
536 0.06
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.04
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.04
547 0.06
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.11
553 0.14
554 0.17
555 0.16
556 0.17
557 0.19
558 0.21
559 0.21
560 0.21
561 0.2
562 0.23
563 0.32
564 0.3
565 0.31
566 0.3
567 0.3
568 0.28
569 0.27
570 0.23
571 0.14
572 0.14
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.16
581 0.23
582 0.28
583 0.35
584 0.45
585 0.55
586 0.61
587 0.71
588 0.73
589 0.78
590 0.78
591 0.75
592 0.72
593 0.62
594 0.56
595 0.45
596 0.35
597 0.27
598 0.21
599 0.17
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.12
606 0.18
607 0.23
608 0.31
609 0.4
610 0.46
611 0.55
612 0.59
613 0.59
614 0.58
615 0.56
616 0.57
617 0.52
618 0.54
619 0.51
620 0.49
621 0.45
622 0.41
623 0.42
624 0.33
625 0.32
626 0.24
627 0.23
628 0.24
629 0.22
630 0.22
631 0.2
632 0.19
633 0.18
634 0.16
635 0.11
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.07
659 0.08
660 0.12
661 0.13
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.14
666 0.16
667 0.19
668 0.19
669 0.22
670 0.25
671 0.3
672 0.36
673 0.39
674 0.42
675 0.47
676 0.5
677 0.51
678 0.51
679 0.53
680 0.52
681 0.5
682 0.49
683 0.46
684 0.38
685 0.35
686 0.33
687 0.25
688 0.2
689 0.18
690 0.14
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.18
702 0.22
703 0.25
704 0.26
705 0.26
706 0.29
707 0.34
708 0.34
709 0.3
710 0.25
711 0.22
712 0.22
713 0.2
714 0.15
715 0.1
716 0.09
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.1
725 0.12
726 0.12
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.11
731 0.12
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.1
736 0.12
737 0.12
738 0.12
739 0.11
740 0.11
741 0.11
742 0.12
743 0.12
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.11
753 0.11
754 0.09
755 0.09
756 0.08
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.08
761 0.09
762 0.1
763 0.11
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.08
769 0.07
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.1
774 0.11
775 0.11
776 0.11
777 0.1
778 0.07
779 0.11
780 0.13
781 0.14
782 0.18
783 0.2
784 0.21
785 0.25
786 0.27
787 0.23
788 0.22
789 0.21
790 0.16
791 0.15
792 0.13
793 0.08
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.07
799 0.06
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.09
804 0.1
805 0.09
806 0.09
807 0.09
808 0.07
809 0.08
810 0.07
811 0.08
812 0.05
813 0.06
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.06
820 0.06
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.06
828 0.07
829 0.07
830 0.07
831 0.07
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.07
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.05
846 0.04
847 0.05
848 0.05
849 0.06
850 0.06
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.09
859 0.11
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.14
869 0.17
870 0.17
871 0.17
872 0.17
873 0.2
874 0.23
875 0.25
876 0.23
877 0.21
878 0.22
879 0.21
880 0.23
881 0.19
882 0.15
883 0.12
884 0.12
885 0.1
886 0.1
887 0.09
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.08
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.11
896 0.1
897 0.1
898 0.1
899 0.08
900 0.08
901 0.08
902 0.09
903 0.09
904 0.1
905 0.13
906 0.17
907 0.19
908 0.19
909 0.23
910 0.28
911 0.34
912 0.38
913 0.36
914 0.37
915 0.37
916 0.41
917 0.44
918 0.44
919 0.45
920 0.45
921 0.49
922 0.49
923 0.49
924 0.45
925 0.45
926 0.47
927 0.45
928 0.42
929 0.38
930 0.36
931 0.37
932 0.4
933 0.34
934 0.3
935 0.27
936 0.27
937 0.32
938 0.32
939 0.31
940 0.28
941 0.27
942 0.23
943 0.19
944 0.18
945 0.12
946 0.14
947 0.12
948 0.13
949 0.13
950 0.13
951 0.14
952 0.13
953 0.14
954 0.11
955 0.14
956 0.18
957 0.22
958 0.23
959 0.24
960 0.25
961 0.25
962 0.26
963 0.23
964 0.19
965 0.16
966 0.14
967 0.14
968 0.14
969 0.16
970 0.19
971 0.23
972 0.27
973 0.29
974 0.37
975 0.47
976 0.55
977 0.62
978 0.65
979 0.7
980 0.77
981 0.81
982 0.79
983 0.75
984 0.73
985 0.66
986 0.59
987 0.49
988 0.39
989 0.37
990 0.32
991 0.27
992 0.22
993 0.27
994 0.27
995 0.34
996 0.43
997 0.48
998 0.55
999 0.64
1000 0.67
1001 0.71
1002 0.74
1003 0.73
1004 0.7
1005 0.7
1006 0.66
1007 0.58
1008 0.51
1009 0.42
1010 0.38
1011 0.32
1012 0.26
1013 0.2
1014 0.18
1015 0.16
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.19
1020 0.18
1021 0.13
1022 0.13
1023 0.12
1024 0.14
1025 0.13
1026 0.14
1027 0.09
1028 0.12
1029 0.14
1030 0.22
1031 0.25
1032 0.24
1033 0.29
1034 0.36
1035 0.47
1036 0.47
1037 0.49
1038 0.44
1039 0.46
1040 0.48
1041 0.53
1042 0.45
1043 0.35
1044 0.34
1045 0.31
1046 0.3
1047 0.25
1048 0.23
1049 0.15
1050 0.15
1051 0.15
1052 0.12
1053 0.11
1054 0.12
1055 0.12
1056 0.11
1057 0.1
1058 0.1
1059 0.11
1060 0.12
1061 0.15
1062 0.13
1063 0.22
1064 0.33
1065 0.43
1066 0.51
1067 0.57
1068 0.65
1069 0.71
1070 0.8
1071 0.82
1072 0.82
1073 0.83
1074 0.83
1075 0.81
1076 0.77
1077 0.72
1078 0.61
1079 0.55
1080 0.48
1081 0.45
1082 0.4
1083 0.38
1084 0.36
1085 0.35
1086 0.38
1087 0.35
1088 0.31
1089 0.25
1090 0.29
1091 0.28
1092 0.26
1093 0.25
1094 0.29
1095 0.34
1096 0.34
1097 0.35
1098 0.29
1099 0.3
1100 0.32
1101 0.33
1102 0.27
1103 0.26
1104 0.26
1105 0.26
1106 0.25
1107 0.22
1108 0.23
1109 0.21
1110 0.25
1111 0.21
1112 0.21
1113 0.24
1114 0.25
1115 0.26
1116 0.24
1117 0.24
1118 0.2
1119 0.22
1120 0.24
1121 0.19
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.17
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.19
1128 0.21
1129 0.23
1130 0.25
1131 0.24
1132 0.23
1133 0.25
1134 0.27
1135 0.26
1136 0.28
1137 0.33
1138 0.35
1139 0.43
1140 0.47
1141 0.54
1142 0.56
1143 0.56
1144 0.51
1145 0.46
1146 0.47
1147 0.44
1148 0.43
1149 0.35
1150 0.33
1151 0.29
1152 0.27
1153 0.26
1154 0.21
1155 0.16
1156 0.11
1157 0.11
1158 0.08
1159 0.08
1160 0.08
1161 0.07
1162 0.1
1163 0.11
1164 0.11
1165 0.11
1166 0.13
1167 0.2
1168 0.24
1169 0.33
1170 0.4
1171 0.5
1172 0.6
1173 0.68
1174 0.76
1175 0.79
1176 0.86
1177 0.89
1178 0.9
1179 0.9
1180 0.9
1181 0.93
1182 0.94
1183 0.93
1184 0.92
1185 0.9
1186 0.83
1187 0.82
1188 0.8
1189 0.75
1190 0.67
1191 0.63
1192 0.55
1193 0.51
1194 0.46
1195 0.38
1196 0.32
1197 0.31
1198 0.31
1199 0.26
1200 0.25
1201 0.21
1202 0.21
1203 0.19
1204 0.19
1205 0.18
1206 0.19
1207 0.21
1208 0.27
1209 0.3
1210 0.31
1211 0.33
1212 0.33
1213 0.3
1214 0.32
1215 0.39
1216 0.34
1217 0.31
1218 0.31
1219 0.31
1220 0.32
1221 0.35
1222 0.32
1223 0.3
1224 0.33
1225 0.33