Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8V8N5

Protein Details
Accession A0A1V8V8N5    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-53GATQSRKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRKLGDEGDAPBasic
79-98GAATAAKSKKRKREEPTTGTHydrophilic
104-127EAGATTKVPKKRRKKTTTAPAPTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-45RKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRK
85-91KSKKRKR
111-118VPKKRRKK
235-246KRGRAKKETGRK
263-313RKEKIKVKNVRLEEQRGRRAELERKERAKKEGKEGKEGKEGGKPKAVEKVP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSHSEVTVAVNGAVPDDGATQSRKEKRAQRDAERAAKTKRGKKRKLGDEGDAPALPAENELEEDFIALPKVEATEGAAGAATAAKSKKRKREEPTTGTDAPTVEAGATTKVPKKRRKKTTTAPAPTDAPTDTTTAKPANQRFIVFLGNLPYTTTDASLNLHFKSLQPFTLRHRTDPATKKSKGFAFLEFENYDRMKTCLKLYHHSYFDPENPEKSKLVVEGEPEAEPQAAVYGGKRGRAKKETGRKINVELTVGGGGSGSTVRKEKIKVKNVRLEEQRGRRAELERKERAKKEGKEGKEGKEGGKPKAVEKVPATKGAEGMHPSRMAMMAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.15
8 0.25
9 0.32
10 0.36
11 0.43
12 0.51
13 0.59
14 0.68
15 0.75
16 0.75
17 0.78
18 0.83
19 0.84
20 0.82
21 0.78
22 0.72
23 0.71
24 0.71
25 0.69
26 0.71
27 0.73
28 0.76
29 0.8
30 0.86
31 0.87
32 0.88
33 0.85
34 0.81
35 0.77
36 0.72
37 0.65
38 0.54
39 0.44
40 0.33
41 0.27
42 0.2
43 0.13
44 0.09
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.09
71 0.15
72 0.24
73 0.32
74 0.42
75 0.5
76 0.6
77 0.66
78 0.75
79 0.8
80 0.79
81 0.79
82 0.77
83 0.69
84 0.6
85 0.52
86 0.41
87 0.31
88 0.24
89 0.16
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.1
96 0.15
97 0.22
98 0.31
99 0.41
100 0.51
101 0.6
102 0.71
103 0.77
104 0.81
105 0.85
106 0.88
107 0.89
108 0.86
109 0.79
110 0.71
111 0.64
112 0.55
113 0.46
114 0.35
115 0.26
116 0.19
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.21
124 0.23
125 0.27
126 0.27
127 0.27
128 0.26
129 0.27
130 0.25
131 0.19
132 0.17
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.22
156 0.32
157 0.32
158 0.29
159 0.32
160 0.33
161 0.4
162 0.46
163 0.49
164 0.47
165 0.48
166 0.49
167 0.49
168 0.49
169 0.44
170 0.37
171 0.32
172 0.27
173 0.26
174 0.28
175 0.25
176 0.23
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.14
181 0.15
182 0.12
183 0.13
184 0.16
185 0.19
186 0.22
187 0.28
188 0.34
189 0.39
190 0.4
191 0.39
192 0.39
193 0.35
194 0.36
195 0.37
196 0.32
197 0.29
198 0.3
199 0.32
200 0.3
201 0.28
202 0.25
203 0.19
204 0.21
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.11
220 0.12
221 0.18
222 0.23
223 0.27
224 0.35
225 0.4
226 0.46
227 0.5
228 0.6
229 0.66
230 0.7
231 0.72
232 0.68
233 0.68
234 0.66
235 0.58
236 0.48
237 0.38
238 0.3
239 0.23
240 0.2
241 0.14
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.1
249 0.11
250 0.16
251 0.21
252 0.3
253 0.39
254 0.49
255 0.57
256 0.65
257 0.72
258 0.74
259 0.77
260 0.75
261 0.74
262 0.73
263 0.73
264 0.72
265 0.65
266 0.63
267 0.58
268 0.58
269 0.58
270 0.58
271 0.59
272 0.6
273 0.66
274 0.72
275 0.72
276 0.74
277 0.76
278 0.72
279 0.74
280 0.73
281 0.69
282 0.71
283 0.73
284 0.7
285 0.68
286 0.64
287 0.56
288 0.55
289 0.56
290 0.49
291 0.51
292 0.46
293 0.4
294 0.47
295 0.46
296 0.44
297 0.45
298 0.5
299 0.46
300 0.53
301 0.53
302 0.45
303 0.45
304 0.4
305 0.4
306 0.35
307 0.33
308 0.31
309 0.28
310 0.27
311 0.25