Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SY62

Protein Details
Accession A0A1V8SY62    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-146VEEPPTKKQRSKPAANGKPKKGVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-156KKQRSKPAANGKPKKGVATKVKTPKIPK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
Amino Acid Sequences MPPKQATLGYVRPSQQTIGKFFGNSNGTTPAAQQSKLKFASKGVAKKEAVNGDASTATKSEEAVEGSHGVVKTEDVDMEDAEHVKVESAEAEAVAADNTPASVSKKRSASVKEEQGDGEVDEVEEPPTKKQRSKPAANGKPKKGVATKVKTPKIPKAEPIVSDEEMDDAQELPAKHSSSSKALRASTPKSRASPIASKSDEDEEKALMAKPAKAKTSKAPNGKVSAAPQEVKPVDVEESKGEASAGESGTEDDVDEEDEDEDEKPEMAAKAREKVQSVLKSSGKDLYPDWKAGDPVPYAALCTTFSKIEMTTKRLEISAHCSLFMRQVLRLTPDDLLPTTLLMIGKLAADYSGIELGIGESLIMKAIGESTGRTLKIIKEDQQKIGDLGLVAAKSRQNQPTMFKPKPLTIRGVHSGLMKIAVVEGQGAQGRKVDEIKKLLSAADTNLPKGQAIDINTDKGGPSEAKFIIRALEGKMRLGLADKTVQVALAQAMVAHDVSLKGEKVPSSEQLKKGEEVFKAVYNELPSYEVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.38
4 0.38
5 0.37
6 0.36
7 0.34
8 0.33
9 0.38
10 0.35
11 0.31
12 0.28
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.27
19 0.28
20 0.31
21 0.3
22 0.38
23 0.43
24 0.44
25 0.37
26 0.37
27 0.44
28 0.47
29 0.51
30 0.48
31 0.52
32 0.5
33 0.53
34 0.57
35 0.53
36 0.45
37 0.4
38 0.35
39 0.28
40 0.29
41 0.25
42 0.2
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.17
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.06
88 0.1
89 0.16
90 0.2
91 0.27
92 0.3
93 0.33
94 0.39
95 0.43
96 0.47
97 0.51
98 0.56
99 0.51
100 0.5
101 0.47
102 0.42
103 0.37
104 0.29
105 0.21
106 0.11
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.11
112 0.12
113 0.16
114 0.25
115 0.29
116 0.35
117 0.42
118 0.52
119 0.58
120 0.66
121 0.72
122 0.75
123 0.81
124 0.86
125 0.88
126 0.82
127 0.81
128 0.73
129 0.69
130 0.62
131 0.6
132 0.6
133 0.58
134 0.62
135 0.63
136 0.67
137 0.67
138 0.68
139 0.67
140 0.66
141 0.61
142 0.57
143 0.56
144 0.54
145 0.5
146 0.49
147 0.46
148 0.37
149 0.34
150 0.29
151 0.22
152 0.17
153 0.16
154 0.11
155 0.07
156 0.06
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.2
165 0.24
166 0.28
167 0.3
168 0.31
169 0.32
170 0.35
171 0.39
172 0.42
173 0.43
174 0.46
175 0.45
176 0.43
177 0.44
178 0.43
179 0.43
180 0.44
181 0.39
182 0.41
183 0.38
184 0.36
185 0.36
186 0.38
187 0.32
188 0.26
189 0.24
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.18
198 0.21
199 0.25
200 0.26
201 0.28
202 0.33
203 0.42
204 0.47
205 0.49
206 0.52
207 0.52
208 0.53
209 0.53
210 0.47
211 0.38
212 0.36
213 0.3
214 0.26
215 0.22
216 0.25
217 0.23
218 0.22
219 0.2
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.11
256 0.12
257 0.15
258 0.2
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.29
263 0.3
264 0.32
265 0.34
266 0.32
267 0.31
268 0.31
269 0.32
270 0.26
271 0.23
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.2
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.17
296 0.19
297 0.21
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.18
304 0.22
305 0.25
306 0.23
307 0.22
308 0.22
309 0.22
310 0.25
311 0.25
312 0.19
313 0.13
314 0.15
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.16
320 0.15
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.08
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.16
363 0.23
364 0.27
365 0.31
366 0.38
367 0.42
368 0.46
369 0.47
370 0.45
371 0.39
372 0.35
373 0.28
374 0.18
375 0.14
376 0.12
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.12
381 0.14
382 0.21
383 0.24
384 0.26
385 0.29
386 0.34
387 0.43
388 0.51
389 0.49
390 0.49
391 0.48
392 0.51
393 0.56
394 0.54
395 0.49
396 0.43
397 0.48
398 0.46
399 0.45
400 0.4
401 0.34
402 0.32
403 0.26
404 0.23
405 0.16
406 0.11
407 0.1
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.21
420 0.23
421 0.26
422 0.31
423 0.32
424 0.32
425 0.32
426 0.3
427 0.26
428 0.24
429 0.2
430 0.23
431 0.23
432 0.23
433 0.24
434 0.24
435 0.22
436 0.21
437 0.21
438 0.17
439 0.17
440 0.23
441 0.23
442 0.25
443 0.25
444 0.25
445 0.23
446 0.2
447 0.2
448 0.15
449 0.14
450 0.18
451 0.19
452 0.21
453 0.22
454 0.22
455 0.21
456 0.21
457 0.21
458 0.19
459 0.25
460 0.24
461 0.25
462 0.26
463 0.23
464 0.22
465 0.23
466 0.2
467 0.16
468 0.19
469 0.19
470 0.19
471 0.19
472 0.19
473 0.16
474 0.15
475 0.12
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.09
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.16
490 0.17
491 0.2
492 0.24
493 0.29
494 0.35
495 0.42
496 0.46
497 0.51
498 0.53
499 0.51
500 0.54
501 0.53
502 0.46
503 0.43
504 0.41
505 0.39
506 0.38
507 0.36
508 0.34
509 0.3
510 0.3
511 0.25