Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TX05

Protein Details
Accession A0A1V8TX05    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MENGIEKKSNKRRREEASVIHydrophilic
25-51DPTVDTAPAKKHKKSKKDHAVEAVKQEHydrophilic
60-88STQPSLPPVKEKSKKRKLKPQENATTTEEHydrophilic
113-134LETTTKKQSKKVKAERRDSAEEHydrophilic
152-177VPNGTSEQTKKKKKKRTELEAAPPEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-41KKHKKSKK
69-78KEKSKKRKLK
161-167KKKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MENGIEKKSNKRRREEASVIGDSQDPTVDTAPAKKHKKSKKDHAVEAVKQESPSEEHAGSTQPSLPPVKEKSKKRKLKPQENATTTEEAAVAAVAAPAPDATLGMLPRASPELETTTKKQSKKVKAERRDSAEETTAVPNGVPRTELEEPIVPNGTSEQTKKKKKKRTELEAAPPEPNGIVDVDEPPAPSATIEAETEVISTTITAIDEKLLDSKSPFKQQTASFYLALSPIAHHFPVEGLCAEHISPLLLTYYPPLKGIVLSFSNPRMSETAEQGQQINGTGPRPVVLGESIDEYAVIFVWLTVDILLFRPRKNTVMEGFVNLQNESMLGLICYNYFNAGVERSRLPKDWRWVEDESAADDAGAMARRGRRSAAGYYVDGKGKKVEGRVVFRVKDFEASPGAETGGGTINIYGTALSPQEDEKIDEDVRSKALVKDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.8
3 0.78
4 0.76
5 0.72
6 0.63
7 0.55
8 0.48
9 0.39
10 0.32
11 0.24
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.2
18 0.27
19 0.36
20 0.43
21 0.49
22 0.58
23 0.66
24 0.75
25 0.8
26 0.83
27 0.85
28 0.87
29 0.87
30 0.88
31 0.87
32 0.81
33 0.78
34 0.71
35 0.62
36 0.52
37 0.45
38 0.36
39 0.3
40 0.29
41 0.26
42 0.22
43 0.2
44 0.21
45 0.23
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.16
50 0.2
51 0.22
52 0.22
53 0.26
54 0.32
55 0.41
56 0.47
57 0.57
58 0.64
59 0.73
60 0.82
61 0.85
62 0.89
63 0.9
64 0.92
65 0.92
66 0.92
67 0.92
68 0.86
69 0.81
70 0.74
71 0.65
72 0.54
73 0.44
74 0.33
75 0.22
76 0.18
77 0.12
78 0.08
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.1
99 0.15
100 0.19
101 0.23
102 0.26
103 0.35
104 0.41
105 0.43
106 0.48
107 0.53
108 0.59
109 0.67
110 0.74
111 0.74
112 0.78
113 0.85
114 0.86
115 0.84
116 0.8
117 0.71
118 0.64
119 0.55
120 0.46
121 0.39
122 0.33
123 0.25
124 0.18
125 0.15
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.15
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.15
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.15
145 0.24
146 0.32
147 0.43
148 0.53
149 0.61
150 0.69
151 0.78
152 0.86
153 0.86
154 0.87
155 0.87
156 0.86
157 0.87
158 0.85
159 0.77
160 0.66
161 0.55
162 0.45
163 0.34
164 0.26
165 0.16
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.14
202 0.16
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.28
207 0.29
208 0.35
209 0.34
210 0.33
211 0.26
212 0.25
213 0.25
214 0.2
215 0.19
216 0.13
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.14
256 0.16
257 0.17
258 0.19
259 0.21
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.16
266 0.13
267 0.11
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.19
299 0.21
300 0.24
301 0.26
302 0.3
303 0.26
304 0.3
305 0.31
306 0.3
307 0.31
308 0.3
309 0.29
310 0.24
311 0.21
312 0.14
313 0.13
314 0.1
315 0.07
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.11
328 0.12
329 0.14
330 0.17
331 0.21
332 0.24
333 0.28
334 0.33
335 0.37
336 0.46
337 0.51
338 0.51
339 0.53
340 0.53
341 0.51
342 0.48
343 0.42
344 0.34
345 0.27
346 0.23
347 0.17
348 0.14
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.1
354 0.15
355 0.18
356 0.19
357 0.21
358 0.23
359 0.26
360 0.3
361 0.34
362 0.33
363 0.34
364 0.36
365 0.38
366 0.39
367 0.35
368 0.32
369 0.28
370 0.28
371 0.29
372 0.3
373 0.34
374 0.37
375 0.43
376 0.51
377 0.56
378 0.54
379 0.52
380 0.52
381 0.45
382 0.42
383 0.35
384 0.3
385 0.26
386 0.25
387 0.24
388 0.21
389 0.2
390 0.16
391 0.15
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.18
411 0.23
412 0.22
413 0.24
414 0.25
415 0.23
416 0.24
417 0.24
418 0.24