Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SYC7

Protein Details
Accession A0A1V8SYC7    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
672-701QETRRWIEKLERKCRKKFERERTATPRSRTBasic
766-787EQSPSPDRKRRHEDARHTPCPPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 8, mito 5, plas 3, nucl 2.5, extr 1, pero 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFPFADICTLLTRLENIDTHGPLHLPDARKAKVKEVTESWFKSHQSAIAKLGVNGAAALLSALLPERRTDRVYGIQTPGLCRILCRCLHLQAGRVKDLRAFAQPGHGDLGLCLERVLRDGGGPPAQPVVILEEVDDLLVTLAGGCKFSDPSVPQLPAGSSEARDELLARLILRLEPIHAKWLVRLILKDLSPVKVDEGLVLRSFHFLLLDLLRFQQNFTSAISLLRGPLVEYPERPDPRSQRLLRQQATSLIRPCVGVKVGRPNFHKARSMQHCINLLGQQQWVLERKYDGEYCEIHIDMSLFLDPTRCIKIFSKSGKDSTADRKGIHDTLVKCLGLGQSHCKIKRQAILLGELVVWSDTEKRAMPFEKIRKHVTRSGVSLGTDLDSQKHQDEHLAIVFFDLLLLDDEVIMTKPIDERRTWLREVYKKIRGRAFSAEWKTVDFRKAEVAQRHLIHQFAASIAERCEGLVLKPCGVPYFSLNRDDEGFTGGFVKLKKDYIADLGDEADLAVVGGNYNAQHALKSGLSHVKWTDFHLGALLNKEDVLRYDAKSKFKVVGTVNSDGWIPKPVLQSANTVAAFCAVPYDLQTSPSQFDLDLPASCKIDHIFTNPLVFEVLGSGYEKPSNADYLMLRHARVKKIHQDRSWKDCVSFRELQHQAQATRDAPADSESQETRRWIEKLERKCRKKFERERTATPRSRTTGTPSTNRSLGTAKSAGIVTNCVVDGPGKSPGRMPMSDASGNRRRLPGAVVFTEQKALDGSTLVEQSPSPDRKRRHEDARHTPCPPAKRQCNTPEAFHSIEARKPESPSHDTNNFIPSAIAKENTNVVERSMLAFLPGKLLELFRQPMQSAAERAQPVADVASRHCESASCHFSKSVVYLAPCIAKTPYITSTLLSQHSAILTCALSHWARKTHTHASLTDTISESQSYPGCRKIVLVEARRINAMREVVSDIEALGLKERVEVWDWRVLEWMKRHGKLDEKCSWAYFVGALIWDGESDEAEFVWSRRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.18
4 0.19
5 0.24
6 0.24
7 0.24
8 0.24
9 0.22
10 0.19
11 0.23
12 0.25
13 0.23
14 0.29
15 0.36
16 0.38
17 0.47
18 0.48
19 0.52
20 0.54
21 0.54
22 0.54
23 0.52
24 0.56
25 0.57
26 0.58
27 0.54
28 0.52
29 0.5
30 0.45
31 0.42
32 0.4
33 0.37
34 0.37
35 0.36
36 0.37
37 0.36
38 0.34
39 0.35
40 0.3
41 0.24
42 0.2
43 0.16
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.11
54 0.14
55 0.18
56 0.21
57 0.23
58 0.27
59 0.34
60 0.39
61 0.42
62 0.43
63 0.43
64 0.42
65 0.42
66 0.41
67 0.35
68 0.3
69 0.26
70 0.26
71 0.31
72 0.31
73 0.34
74 0.33
75 0.34
76 0.42
77 0.43
78 0.45
79 0.44
80 0.48
81 0.49
82 0.47
83 0.43
84 0.38
85 0.39
86 0.35
87 0.34
88 0.31
89 0.25
90 0.32
91 0.32
92 0.3
93 0.3
94 0.27
95 0.22
96 0.19
97 0.24
98 0.16
99 0.16
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.15
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.17
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.17
137 0.16
138 0.22
139 0.28
140 0.29
141 0.28
142 0.29
143 0.29
144 0.25
145 0.27
146 0.22
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.16
164 0.17
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.22
169 0.27
170 0.28
171 0.25
172 0.25
173 0.24
174 0.27
175 0.27
176 0.31
177 0.28
178 0.26
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.12
199 0.14
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.21
221 0.29
222 0.32
223 0.33
224 0.39
225 0.41
226 0.47
227 0.56
228 0.54
229 0.55
230 0.63
231 0.71
232 0.66
233 0.63
234 0.57
235 0.55
236 0.56
237 0.51
238 0.44
239 0.36
240 0.33
241 0.31
242 0.29
243 0.24
244 0.22
245 0.19
246 0.19
247 0.28
248 0.33
249 0.39
250 0.41
251 0.47
252 0.51
253 0.53
254 0.56
255 0.47
256 0.53
257 0.54
258 0.58
259 0.53
260 0.52
261 0.5
262 0.45
263 0.45
264 0.38
265 0.31
266 0.25
267 0.22
268 0.18
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.17
276 0.2
277 0.22
278 0.2
279 0.2
280 0.2
281 0.21
282 0.22
283 0.2
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.14
296 0.13
297 0.16
298 0.19
299 0.25
300 0.32
301 0.39
302 0.45
303 0.44
304 0.46
305 0.45
306 0.44
307 0.43
308 0.43
309 0.45
310 0.4
311 0.37
312 0.37
313 0.39
314 0.38
315 0.35
316 0.32
317 0.24
318 0.27
319 0.29
320 0.26
321 0.22
322 0.23
323 0.21
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.22
328 0.29
329 0.3
330 0.33
331 0.35
332 0.38
333 0.42
334 0.4
335 0.37
336 0.33
337 0.35
338 0.31
339 0.28
340 0.23
341 0.17
342 0.14
343 0.1
344 0.07
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.14
352 0.16
353 0.19
354 0.26
355 0.35
356 0.41
357 0.44
358 0.51
359 0.52
360 0.56
361 0.57
362 0.55
363 0.5
364 0.45
365 0.44
366 0.38
367 0.33
368 0.29
369 0.23
370 0.17
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.08
388 0.07
389 0.05
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.07
402 0.11
403 0.13
404 0.13
405 0.17
406 0.24
407 0.29
408 0.29
409 0.31
410 0.35
411 0.39
412 0.48
413 0.52
414 0.54
415 0.53
416 0.57
417 0.58
418 0.52
419 0.49
420 0.46
421 0.43
422 0.43
423 0.43
424 0.4
425 0.36
426 0.35
427 0.33
428 0.3
429 0.29
430 0.2
431 0.17
432 0.19
433 0.23
434 0.27
435 0.29
436 0.31
437 0.32
438 0.32
439 0.34
440 0.3
441 0.27
442 0.21
443 0.17
444 0.14
445 0.09
446 0.1
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.12
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.11
465 0.16
466 0.17
467 0.2
468 0.2
469 0.21
470 0.22
471 0.21
472 0.18
473 0.15
474 0.13
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.04
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.09
512 0.14
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.16
517 0.17
518 0.19
519 0.21
520 0.17
521 0.16
522 0.16
523 0.16
524 0.14
525 0.15
526 0.13
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.18
536 0.23
537 0.26
538 0.28
539 0.28
540 0.29
541 0.27
542 0.32
543 0.26
544 0.29
545 0.3
546 0.31
547 0.29
548 0.26
549 0.26
550 0.2
551 0.19
552 0.14
553 0.1
554 0.11
555 0.13
556 0.14
557 0.16
558 0.17
559 0.19
560 0.19
561 0.23
562 0.19
563 0.18
564 0.16
565 0.15
566 0.14
567 0.11
568 0.1
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.09
573 0.08
574 0.1
575 0.11
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.11
585 0.12
586 0.13
587 0.14
588 0.13
589 0.14
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.13
594 0.15
595 0.15
596 0.17
597 0.16
598 0.15
599 0.13
600 0.12
601 0.09
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.1
615 0.1
616 0.12
617 0.18
618 0.17
619 0.17
620 0.22
621 0.26
622 0.3
623 0.33
624 0.37
625 0.41
626 0.5
627 0.59
628 0.59
629 0.65
630 0.66
631 0.7
632 0.7
633 0.61
634 0.53
635 0.49
636 0.47
637 0.43
638 0.43
639 0.36
640 0.4
641 0.41
642 0.4
643 0.4
644 0.39
645 0.32
646 0.28
647 0.31
648 0.21
649 0.21
650 0.21
651 0.16
652 0.14
653 0.15
654 0.14
655 0.12
656 0.14
657 0.13
658 0.15
659 0.17
660 0.18
661 0.19
662 0.22
663 0.21
664 0.21
665 0.3
666 0.36
667 0.45
668 0.55
669 0.62
670 0.66
671 0.73
672 0.81
673 0.81
674 0.85
675 0.85
676 0.85
677 0.86
678 0.85
679 0.87
680 0.86
681 0.86
682 0.81
683 0.74
684 0.69
685 0.61
686 0.57
687 0.49
688 0.47
689 0.46
690 0.44
691 0.47
692 0.45
693 0.45
694 0.44
695 0.43
696 0.37
697 0.31
698 0.27
699 0.25
700 0.22
701 0.18
702 0.18
703 0.18
704 0.16
705 0.14
706 0.15
707 0.1
708 0.1
709 0.1
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.09
715 0.17
716 0.16
717 0.17
718 0.19
719 0.24
720 0.28
721 0.28
722 0.29
723 0.24
724 0.29
725 0.33
726 0.33
727 0.35
728 0.38
729 0.42
730 0.41
731 0.39
732 0.34
733 0.31
734 0.33
735 0.31
736 0.28
737 0.27
738 0.27
739 0.27
740 0.27
741 0.28
742 0.24
743 0.19
744 0.15
745 0.13
746 0.1
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.1
752 0.1
753 0.09
754 0.12
755 0.2
756 0.25
757 0.29
758 0.36
759 0.42
760 0.51
761 0.6
762 0.66
763 0.68
764 0.73
765 0.77
766 0.81
767 0.85
768 0.82
769 0.74
770 0.72
771 0.66
772 0.62
773 0.61
774 0.6
775 0.6
776 0.6
777 0.67
778 0.69
779 0.73
780 0.69
781 0.64
782 0.59
783 0.55
784 0.5
785 0.43
786 0.41
787 0.34
788 0.35
789 0.34
790 0.32
791 0.29
792 0.3
793 0.33
794 0.34
795 0.38
796 0.4
797 0.44
798 0.44
799 0.45
800 0.45
801 0.44
802 0.37
803 0.31
804 0.26
805 0.19
806 0.19
807 0.19
808 0.18
809 0.14
810 0.16
811 0.19
812 0.21
813 0.23
814 0.18
815 0.17
816 0.17
817 0.17
818 0.18
819 0.15
820 0.13
821 0.12
822 0.14
823 0.14
824 0.15
825 0.15
826 0.14
827 0.14
828 0.15
829 0.15
830 0.18
831 0.21
832 0.19
833 0.22
834 0.21
835 0.23
836 0.26
837 0.27
838 0.24
839 0.24
840 0.29
841 0.26
842 0.27
843 0.24
844 0.21
845 0.18
846 0.17
847 0.17
848 0.11
849 0.12
850 0.2
851 0.2
852 0.2
853 0.2
854 0.19
855 0.21
856 0.29
857 0.36
858 0.3
859 0.31
860 0.31
861 0.32
862 0.32
863 0.3
864 0.25
865 0.2
866 0.19
867 0.2
868 0.22
869 0.25
870 0.23
871 0.23
872 0.2
873 0.18
874 0.18
875 0.21
876 0.21
877 0.21
878 0.22
879 0.21
880 0.24
881 0.27
882 0.28
883 0.25
884 0.23
885 0.2
886 0.21
887 0.21
888 0.17
889 0.14
890 0.12
891 0.11
892 0.11
893 0.14
894 0.14
895 0.17
896 0.22
897 0.26
898 0.29
899 0.34
900 0.41
901 0.46
902 0.52
903 0.53
904 0.49
905 0.5
906 0.54
907 0.51
908 0.46
909 0.39
910 0.32
911 0.3
912 0.29
913 0.23
914 0.19
915 0.2
916 0.22
917 0.23
918 0.27
919 0.27
920 0.26
921 0.26
922 0.26
923 0.33
924 0.38
925 0.41
926 0.45
927 0.49
928 0.5
929 0.52
930 0.5
931 0.42
932 0.38
933 0.34
934 0.27
935 0.24
936 0.25
937 0.23
938 0.23
939 0.21
940 0.16
941 0.15
942 0.14
943 0.13
944 0.12
945 0.12
946 0.11
947 0.12
948 0.13
949 0.13
950 0.16
951 0.19
952 0.21
953 0.27
954 0.27
955 0.26
956 0.32
957 0.32
958 0.35
959 0.38
960 0.44
961 0.46
962 0.5
963 0.52
964 0.52
965 0.59
966 0.6
967 0.63
968 0.62
969 0.58
970 0.57
971 0.56
972 0.52
973 0.43
974 0.36
975 0.28
976 0.2
977 0.15
978 0.14
979 0.12
980 0.11
981 0.1
982 0.09
983 0.09
984 0.08
985 0.07
986 0.08
987 0.08
988 0.07
989 0.08
990 0.09
991 0.09