Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V8UA23

Protein Details
Accession A0A1V8UA23    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61VDGKNRKQTSQPPKAWQGPNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MSAATVNGDNSGKASGSKPQQSKSGSNGRALEGTRKQAASPVDGKNRKQTSQPPKAWQGPNPITQRTSNQSGMHNGTEKPLPKLPPQSPAGAPSDTHIEQHAHDRLLFLLAHSTGTDATLTLKNGEQFSGVFSGASLEAASKSVYILKMAKRTRLPSSQQVNGERALPDEYIGDGEDHIMTFDVQDTIDLAVSEVVLASALTQNGSAASSFRTDTEISTRNRDRPIERELQPWSGGIEMSLDDMALESSGDTKWDQFAVNEEKFGTQTTYDEDEYTTTIDRSRPEYARLAAQAERIEREIFKSTAMNSHVAEERGQNMDEGDGLDEEDKYSGVRREAPTLPKGAAGSYVPPSRRLLTNVPTVPGAPYDPAIISLEKPAPAAAAAPTVIEPALTPEPVTTPSSIKPEAAEVANDSVASTSQTPEAAKRPENTTEDHVRGTADAFKQFANNEKLRMHQAREQQRMAKKQEKNVQINDLKKFAENFKLKSRVPDDLVPILAKDHEKQAEIKRKAESSALQEEVRAKEREKERASATPSPQKQPQAAIDPQTSLSLQHSRARVAQNLRGGPSLTSPRGFAPPRGQNIPYMGRQPGMGPQTQPLPADIRIPTGPMARDNGPLSPASATSATNTRYNVNAKEFKFTPGVSSFTPSGATPSPQRIPISAPAPETNATFFDEKDNKGDMPKRDVNVDCDTIKRLLTAEYPADHKKSFINGIPQPFRTPPTWPVAKEFENKSFLDAFPKPRIHSQGPTPRATPIPVGMHMQHQLPQHPQHHGHTPLPSPGQRPPFFGQQGSQHGQQFDHRIQYPGGPGSVQNSPRYAHAQMVGYGPQMGQGPVPQMPQFAGQQGYGMSPGMQFRQMQAPPGGPMMMMQQHPQQQSEYRMRPNAYPQPGPNNPNAFPPNMHQQPRAHMMSHSSSNSSYHPNNLPHQPQQGYSPMPQHAQPNGYAPSPRPGAQMMQHSGSHQGFQPPHQGQGGYGQGPPQFMRNPSGGGGHGGYAGQMTPRGNAVASTVESEQDGVAARARSPSSRRSSDSRLEAFSQRSEVRRNSDDFELDPEEDPKSYTTEYVWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.2
3 0.29
4 0.38
5 0.43
6 0.45
7 0.52
8 0.56
9 0.6
10 0.6
11 0.62
12 0.56
13 0.57
14 0.56
15 0.5
16 0.49
17 0.46
18 0.47
19 0.42
20 0.44
21 0.43
22 0.41
23 0.39
24 0.39
25 0.4
26 0.38
27 0.39
28 0.42
29 0.47
30 0.54
31 0.57
32 0.63
33 0.66
34 0.62
35 0.63
36 0.64
37 0.65
38 0.69
39 0.73
40 0.72
41 0.75
42 0.82
43 0.8
44 0.75
45 0.75
46 0.7
47 0.71
48 0.68
49 0.63
50 0.57
51 0.55
52 0.55
53 0.51
54 0.51
55 0.48
56 0.45
57 0.45
58 0.48
59 0.49
60 0.47
61 0.43
62 0.37
63 0.35
64 0.37
65 0.36
66 0.35
67 0.36
68 0.36
69 0.4
70 0.49
71 0.5
72 0.52
73 0.52
74 0.52
75 0.48
76 0.48
77 0.45
78 0.37
79 0.33
80 0.27
81 0.31
82 0.26
83 0.25
84 0.23
85 0.2
86 0.2
87 0.28
88 0.31
89 0.26
90 0.26
91 0.25
92 0.24
93 0.25
94 0.23
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.07
105 0.1
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.2
113 0.18
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.19
134 0.23
135 0.32
136 0.36
137 0.43
138 0.46
139 0.5
140 0.55
141 0.58
142 0.59
143 0.6
144 0.63
145 0.63
146 0.63
147 0.63
148 0.58
149 0.5
150 0.46
151 0.36
152 0.31
153 0.26
154 0.19
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.2
203 0.26
204 0.27
205 0.36
206 0.4
207 0.43
208 0.48
209 0.51
210 0.48
211 0.46
212 0.51
213 0.51
214 0.49
215 0.49
216 0.47
217 0.45
218 0.42
219 0.37
220 0.3
221 0.21
222 0.19
223 0.13
224 0.1
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.16
245 0.23
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.17
253 0.1
254 0.1
255 0.14
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.13
264 0.1
265 0.11
266 0.13
267 0.15
268 0.18
269 0.24
270 0.24
271 0.27
272 0.31
273 0.3
274 0.32
275 0.32
276 0.31
277 0.25
278 0.27
279 0.26
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.2
284 0.17
285 0.19
286 0.21
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.21
292 0.23
293 0.22
294 0.18
295 0.21
296 0.22
297 0.21
298 0.21
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.08
318 0.1
319 0.12
320 0.18
321 0.19
322 0.25
323 0.3
324 0.34
325 0.34
326 0.34
327 0.33
328 0.28
329 0.27
330 0.21
331 0.18
332 0.13
333 0.13
334 0.15
335 0.19
336 0.18
337 0.2
338 0.22
339 0.23
340 0.24
341 0.26
342 0.27
343 0.27
344 0.35
345 0.34
346 0.33
347 0.31
348 0.29
349 0.25
350 0.21
351 0.17
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.11
386 0.12
387 0.14
388 0.19
389 0.19
390 0.18
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.15
395 0.13
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.16
411 0.18
412 0.21
413 0.23
414 0.26
415 0.3
416 0.31
417 0.32
418 0.32
419 0.34
420 0.32
421 0.3
422 0.27
423 0.22
424 0.2
425 0.18
426 0.17
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.14
433 0.2
434 0.22
435 0.22
436 0.24
437 0.24
438 0.26
439 0.32
440 0.35
441 0.31
442 0.3
443 0.37
444 0.44
445 0.49
446 0.5
447 0.49
448 0.52
449 0.56
450 0.58
451 0.59
452 0.53
453 0.55
454 0.6
455 0.63
456 0.62
457 0.57
458 0.59
459 0.55
460 0.56
461 0.5
462 0.44
463 0.35
464 0.31
465 0.3
466 0.24
467 0.27
468 0.26
469 0.27
470 0.32
471 0.38
472 0.37
473 0.41
474 0.42
475 0.36
476 0.35
477 0.35
478 0.31
479 0.26
480 0.26
481 0.2
482 0.18
483 0.14
484 0.13
485 0.11
486 0.09
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.17
491 0.25
492 0.35
493 0.36
494 0.39
495 0.37
496 0.37
497 0.37
498 0.35
499 0.28
500 0.23
501 0.25
502 0.24
503 0.22
504 0.22
505 0.24
506 0.23
507 0.25
508 0.21
509 0.17
510 0.22
511 0.26
512 0.33
513 0.33
514 0.34
515 0.33
516 0.37
517 0.42
518 0.41
519 0.41
520 0.41
521 0.41
522 0.41
523 0.42
524 0.39
525 0.35
526 0.32
527 0.31
528 0.28
529 0.27
530 0.27
531 0.24
532 0.22
533 0.22
534 0.2
535 0.17
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.17
541 0.18
542 0.18
543 0.22
544 0.24
545 0.27
546 0.27
547 0.29
548 0.29
549 0.3
550 0.29
551 0.26
552 0.24
553 0.2
554 0.19
555 0.19
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.15
560 0.2
561 0.21
562 0.21
563 0.25
564 0.29
565 0.32
566 0.35
567 0.34
568 0.3
569 0.33
570 0.34
571 0.28
572 0.24
573 0.21
574 0.18
575 0.18
576 0.17
577 0.18
578 0.17
579 0.16
580 0.14
581 0.14
582 0.17
583 0.18
584 0.17
585 0.13
586 0.14
587 0.13
588 0.16
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.15
593 0.15
594 0.14
595 0.14
596 0.12
597 0.15
598 0.14
599 0.17
600 0.17
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.14
605 0.11
606 0.1
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.12
612 0.14
613 0.15
614 0.16
615 0.15
616 0.18
617 0.21
618 0.22
619 0.25
620 0.31
621 0.29
622 0.33
623 0.33
624 0.33
625 0.32
626 0.29
627 0.26
628 0.21
629 0.23
630 0.18
631 0.2
632 0.18
633 0.16
634 0.17
635 0.13
636 0.14
637 0.12
638 0.14
639 0.13
640 0.18
641 0.19
642 0.21
643 0.22
644 0.2
645 0.22
646 0.25
647 0.26
648 0.23
649 0.23
650 0.21
651 0.22
652 0.22
653 0.19
654 0.16
655 0.14
656 0.14
657 0.13
658 0.12
659 0.17
660 0.19
661 0.2
662 0.22
663 0.23
664 0.21
665 0.26
666 0.31
667 0.28
668 0.32
669 0.36
670 0.34
671 0.38
672 0.38
673 0.38
674 0.36
675 0.36
676 0.29
677 0.26
678 0.27
679 0.23
680 0.21
681 0.17
682 0.13
683 0.12
684 0.12
685 0.14
686 0.14
687 0.14
688 0.18
689 0.2
690 0.23
691 0.21
692 0.21
693 0.19
694 0.21
695 0.23
696 0.22
697 0.27
698 0.28
699 0.36
700 0.39
701 0.38
702 0.39
703 0.37
704 0.37
705 0.3
706 0.3
707 0.27
708 0.3
709 0.34
710 0.31
711 0.35
712 0.37
713 0.39
714 0.42
715 0.42
716 0.39
717 0.38
718 0.37
719 0.35
720 0.32
721 0.28
722 0.29
723 0.28
724 0.28
725 0.32
726 0.35
727 0.35
728 0.38
729 0.44
730 0.42
731 0.42
732 0.47
733 0.49
734 0.52
735 0.52
736 0.48
737 0.44
738 0.41
739 0.38
740 0.3
741 0.24
742 0.21
743 0.2
744 0.22
745 0.2
746 0.22
747 0.22
748 0.22
749 0.21
750 0.2
751 0.22
752 0.25
753 0.31
754 0.32
755 0.36
756 0.38
757 0.38
758 0.43
759 0.44
760 0.42
761 0.39
762 0.38
763 0.36
764 0.38
765 0.37
766 0.33
767 0.35
768 0.41
769 0.38
770 0.42
771 0.42
772 0.45
773 0.45
774 0.43
775 0.39
776 0.36
777 0.42
778 0.4
779 0.4
780 0.35
781 0.34
782 0.33
783 0.34
784 0.34
785 0.29
786 0.31
787 0.28
788 0.28
789 0.28
790 0.29
791 0.28
792 0.24
793 0.22
794 0.16
795 0.15
796 0.16
797 0.22
798 0.22
799 0.21
800 0.21
801 0.22
802 0.24
803 0.28
804 0.26
805 0.22
806 0.22
807 0.22
808 0.22
809 0.23
810 0.21
811 0.17
812 0.17
813 0.14
814 0.12
815 0.12
816 0.1
817 0.09
818 0.09
819 0.11
820 0.13
821 0.15
822 0.14
823 0.13
824 0.14
825 0.16
826 0.16
827 0.16
828 0.16
829 0.13
830 0.14
831 0.13
832 0.13
833 0.11
834 0.1
835 0.08
836 0.08
837 0.1
838 0.11
839 0.13
840 0.13
841 0.14
842 0.22
843 0.23
844 0.25
845 0.26
846 0.25
847 0.24
848 0.25
849 0.23
850 0.14
851 0.14
852 0.14
853 0.16
854 0.16
855 0.16
856 0.2
857 0.27
858 0.28
859 0.29
860 0.28
861 0.29
862 0.36
863 0.43
864 0.45
865 0.45
866 0.49
867 0.5
868 0.51
869 0.55
870 0.57
871 0.53
872 0.52
873 0.5
874 0.53
875 0.58
876 0.59
877 0.57
878 0.53
879 0.48
880 0.5
881 0.49
882 0.41
883 0.37
884 0.37
885 0.4
886 0.43
887 0.46
888 0.44
889 0.44
890 0.48
891 0.53
892 0.51
893 0.42
894 0.35
895 0.37
896 0.36
897 0.38
898 0.34
899 0.29
900 0.27
901 0.28
902 0.29
903 0.31
904 0.27
905 0.28
906 0.33
907 0.36
908 0.41
909 0.47
910 0.51
911 0.5
912 0.56
913 0.52
914 0.46
915 0.46
916 0.45
917 0.41
918 0.38
919 0.38
920 0.33
921 0.33
922 0.35
923 0.36
924 0.35
925 0.34
926 0.32
927 0.31
928 0.31
929 0.31
930 0.31
931 0.27
932 0.3
933 0.31
934 0.31
935 0.28
936 0.27
937 0.29
938 0.32
939 0.38
940 0.36
941 0.36
942 0.35
943 0.34
944 0.38
945 0.35
946 0.31
947 0.25
948 0.29
949 0.27
950 0.29
951 0.38
952 0.33
953 0.36
954 0.36
955 0.34
956 0.27
957 0.32
958 0.34
959 0.26
960 0.25
961 0.25
962 0.25
963 0.27
964 0.27
965 0.25
966 0.24
967 0.25
968 0.28
969 0.27
970 0.27
971 0.26
972 0.28
973 0.24
974 0.22
975 0.2
976 0.17
977 0.16
978 0.13
979 0.12
980 0.1
981 0.1
982 0.08
983 0.1
984 0.1
985 0.11
986 0.12
987 0.13
988 0.13
989 0.13
990 0.13
991 0.14
992 0.14
993 0.16
994 0.15
995 0.15
996 0.15
997 0.16
998 0.13
999 0.11
1000 0.11
1001 0.09
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.14
1005 0.18
1006 0.2
1007 0.25
1008 0.29
1009 0.37
1010 0.42
1011 0.48
1012 0.52
1013 0.55
1014 0.61
1015 0.64
1016 0.68
1017 0.63
1018 0.59
1019 0.57
1020 0.57
1021 0.53
1022 0.48
1023 0.45
1024 0.41
1025 0.42
1026 0.45
1027 0.46
1028 0.49
1029 0.51
1030 0.52
1031 0.51
1032 0.51
1033 0.48
1034 0.42
1035 0.42
1036 0.38
1037 0.34
1038 0.32
1039 0.29
1040 0.26
1041 0.24
1042 0.24
1043 0.19
1044 0.19
1045 0.18
1046 0.18