FuNGI

A0A1V8SKD7

Protein Details

Accession

A0A1V8SKD7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
127-148	AWNWAPRSRRRVTNNRRVDRTG	Hydrophilic
444-470	TEKQRERLQRKAEKHLRRQRREAEASA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-464	LQRKAEKHLRRQRR
532-536	RKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

VSDGNDSLALINSATVPMVATYRTAIDERETLTVQDPTILHLPSDPSVLSKIVDWTMSSVEIRGKTSRLTALRQEGALVQELYLSHPAAGIDLPTELPTWASKLEKSSSRVRDSFVVEDDEAEPLAAWNWAPRSRRRVTNNRRVDRTGDEWTVSYERCMGVLAAAKEQVEQIGQHLERARGLLDQIPADPVQPMQTLHELGNAEVGVHDIDAASAALAELQDIRRWAGNDLDGIDERLPNMVLRATKMPRLDPAVIYMPTASLDALYDSMVSESITTLDLAVPRAVRIAKEQHARRMAAAVSLASHVLWHEVINPSAQDDDTQTQTQTQSQSQFGTLQVPGISFSRSSQAYPGASQSQSLLPTPSPTGTPSISTQASALSASPISILTCFATFTKPVAPLLSRPVRKVLTHWPLDSDIDTYDWLSTSRTIALQTEEEEADSQLTEKQRERLQRKAEKHLRRQRREAEASAARAMLSSQVAEVVVAPTRAPSGFVAGASQQAVGGARGSSQVLGASAASQVLPGRFGGKMVVRKKRKQGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.07
3	0.06
4	0.07
5	0.08
6	0.08
7	0.08
8	0.09
9	0.11
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.16
14	0.19
15	0.2
16	0.23
17	0.22
18	0.21
19	0.24
20	0.24
21	0.21
22	0.22
23	0.2
24	0.2
25	0.24
26	0.23
27	0.2
28	0.2
29	0.22
30	0.19
31	0.21
32	0.17
33	0.14
34	0.16
35	0.17
36	0.15
37	0.14
38	0.16
39	0.15
40	0.16
41	0.15
42	0.15
43	0.15
44	0.16
45	0.15
46	0.14
47	0.18
48	0.19
49	0.22
50	0.22
51	0.22
52	0.22
53	0.25
54	0.31
55	0.3
56	0.33
57	0.37
58	0.42
59	0.43
60	0.42
61	0.39
62	0.33
63	0.31
64	0.29
65	0.22
66	0.14
67	0.13
68	0.13
69	0.15
70	0.15
71	0.13
72	0.1
73	0.11
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.07
84	0.08
85	0.09
86	0.1
87	0.12
88	0.14
89	0.14
90	0.18
91	0.24
92	0.29
93	0.32
94	0.4
95	0.46
96	0.51
97	0.51
98	0.49
99	0.49
100	0.47
101	0.45
102	0.37
103	0.33
104	0.26
105	0.26
106	0.24
107	0.2
108	0.16
109	0.13
110	0.1
111	0.07
112	0.07
113	0.06
114	0.05
115	0.07
116	0.11
117	0.17
118	0.21
119	0.27
120	0.35
121	0.41
122	0.5
123	0.57
124	0.65
125	0.7
126	0.77
127	0.82
128	0.81
129	0.81
130	0.75
131	0.69
132	0.63
133	0.57
134	0.52
135	0.43
136	0.36
137	0.3
138	0.31
139	0.29
140	0.24
141	0.19
142	0.15
143	0.13
144	0.12
145	0.12
146	0.09
147	0.09
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.18
163	0.18
164	0.18
165	0.18
166	0.17
167	0.12
168	0.13
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.11
183	0.13
184	0.12
185	0.15
186	0.14
187	0.13
188	0.14
189	0.11
190	0.1
191	0.08
192	0.08
193	0.05
194	0.04
195	0.05
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.02
202	0.02
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.04
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.09
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.09
231	0.14
232	0.15
233	0.18
234	0.2
235	0.2
236	0.2
237	0.24
238	0.23
239	0.18
240	0.2
241	0.2
242	0.19
243	0.18
244	0.16
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.07
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.11
275	0.15
276	0.2
277	0.28
278	0.3
279	0.36
280	0.39
281	0.39
282	0.36
283	0.34
284	0.28
285	0.21
286	0.19
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.13
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.15
313	0.17
314	0.17
315	0.18
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.19
320	0.19
321	0.17
322	0.17
323	0.14
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.11
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.15
337	0.15
338	0.16
339	0.18
340	0.18
341	0.17
342	0.17
343	0.17
344	0.16
345	0.16
346	0.16
347	0.14
348	0.11
349	0.13
350	0.14
351	0.13
352	0.12
353	0.12
354	0.14
355	0.13
356	0.15
357	0.15
358	0.18
359	0.18
360	0.17
361	0.16
362	0.14
363	0.14
364	0.12
365	0.1
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.14
382	0.15
383	0.15
384	0.17
385	0.18
386	0.18
387	0.26
388	0.34
389	0.32
390	0.33
391	0.38
392	0.38
393	0.37
394	0.4
395	0.41
396	0.41
397	0.43
398	0.42
399	0.39
400	0.39
401	0.39
402	0.36
403	0.26
404	0.18
405	0.14
406	0.14
407	0.12
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.13
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.17
422	0.16
423	0.16
424	0.15
425	0.14
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.11
430	0.14
431	0.18
432	0.21
433	0.26
434	0.32
435	0.42
436	0.47
437	0.53
438	0.6
439	0.66
440	0.69
441	0.75
442	0.8
443	0.8
444	0.85
445	0.87
446	0.87
447	0.86
448	0.89
449	0.87
450	0.87
451	0.83
452	0.75
453	0.74
454	0.68
455	0.62
456	0.54
457	0.45
458	0.34
459	0.28
460	0.24
461	0.17
462	0.12
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.09
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.11
475	0.11
476	0.12
477	0.11
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.16
482	0.15
483	0.17
484	0.16
485	0.15
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.09
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.07
505	0.08
506	0.1
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.17
514	0.22
515	0.3
516	0.39
517	0.49
518	0.57
519	0.65

A0A1V8SKD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer