FuNGI

A0A1V8UD55

Protein Details

Accession

A0A1V8UD55

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
222-241	PTSGAAKRAPRKKNEKNVMD	Hydrophilic
451-484	EEQQKEQGKEQKRRERRMKKRLIKKEKQYHYESD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
65-84	RPRKRPAPSAFLARKPPLKK
228-234	KRAPRKK
459-477	KEQKRRERRMKKRLIKKEK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.833, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MWSGDSGIFRRAAWCLDVTASRLPSTLSATLYIFVSLLRCTLHEHKHVVDCSEKEVIMSSNAVPRPRKRPAPSAFLARKPPLKKAALSAAGTPSQRADTPSQPPYGSAASTTEKTQHDRPPDQVFDVYISKSDLEQGMRFHGFKFDVKRDNEKAPTQIIDPWNASEFTRPVHLHRRYAHDKQDNGDQSDAPSGIDDKEREAFNAKKAERQAEREANQANIAPTSGAAKRAPRKKNEKNVMDVYYDENNPKQQKAAQLRYEETKPWHLEDFDNKNTWIGSYQEPLSEQSVLLTLPETADGPFTMVPVERWYKFTETGRLPSMSTEQAERIMASKIKPSRWFMGTQVGQQEAKKAAVQMLKEKAAAARRAAEDDTAAVPRVKDEGDFYNADVDVLDMEFADEEFQDDDEGALVVGEDDADTREIERRIREEMRGANISAPGLKDQAADYDQEEEQQKEQGKEQKRRERRMKKRLIKKEKQYHYESDSDSDPYNDSSEETDSEEERERADEEKKAEEEALKLTQGGDPSGASSKGTNTPSGRPEKKDDVRLTSLKRPGSPNLSDVSGNESRKKQRVANDETRRIRLKNSPPGSPRNDDTPSGSRAQSPAPVAMPSLDEVRAAIPPEGIAIKDLTLKFRARVQGKENTTAFIKLVSQAGQRDSTSKLIVPKAGEQEGTKEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.17
3	0.2
4	0.21
5	0.23
6	0.26
7	0.26
8	0.24
9	0.23
10	0.22
11	0.21
12	0.24
13	0.23
14	0.19
15	0.19
16	0.2
17	0.21
18	0.2
19	0.18
20	0.13
21	0.11
22	0.11
23	0.09
24	0.1
25	0.09
26	0.09
27	0.16
28	0.24
29	0.31
30	0.36
31	0.39
32	0.43
33	0.5
34	0.52
35	0.48
36	0.47
37	0.41
38	0.39
39	0.38
40	0.33
41	0.26
42	0.26
43	0.23
44	0.18
45	0.19
46	0.17
47	0.21
48	0.24
49	0.3
50	0.35
51	0.4
52	0.48
53	0.55
54	0.63
55	0.62
56	0.7
57	0.71
58	0.73
59	0.71
60	0.73
61	0.71
62	0.67
63	0.68
64	0.64
65	0.65
66	0.6
67	0.62
68	0.6
69	0.57
70	0.53
71	0.51
72	0.54
73	0.52
74	0.5
75	0.45
76	0.41
77	0.4
78	0.39
79	0.33
80	0.26
81	0.21
82	0.21
83	0.22
84	0.23
85	0.25
86	0.33
87	0.37
88	0.38
89	0.36
90	0.36
91	0.36
92	0.32
93	0.26
94	0.2
95	0.19
96	0.2
97	0.21
98	0.21
99	0.24
100	0.25
101	0.3
102	0.35
103	0.39
104	0.44
105	0.47
106	0.51
107	0.53
108	0.53
109	0.51
110	0.45
111	0.38
112	0.33
113	0.31
114	0.26
115	0.19
116	0.17
117	0.15
118	0.14
119	0.16
120	0.15
121	0.15
122	0.16
123	0.17
124	0.21
125	0.23
126	0.23
127	0.22
128	0.23
129	0.23
130	0.26
131	0.32
132	0.34
133	0.4
134	0.44
135	0.52
136	0.53
137	0.57
138	0.58
139	0.54
140	0.5
141	0.44
142	0.41
143	0.34
144	0.36
145	0.31
146	0.29
147	0.27
148	0.25
149	0.24
150	0.23
151	0.22
152	0.19
153	0.18
154	0.15
155	0.21
156	0.2
157	0.24
158	0.33
159	0.38
160	0.41
161	0.45
162	0.53
163	0.55
164	0.61
165	0.66
166	0.63
167	0.6
168	0.56
169	0.61
170	0.56
171	0.51
172	0.45
173	0.35
174	0.29
175	0.29
176	0.26
177	0.17
178	0.12
179	0.11
180	0.11
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.16
185	0.16
186	0.17
187	0.22
188	0.23
189	0.25
190	0.34
191	0.32
192	0.34
193	0.37
194	0.44
195	0.43
196	0.46
197	0.5
198	0.49
199	0.5
200	0.5
201	0.48
202	0.41
203	0.37
204	0.33
205	0.25
206	0.16
207	0.15
208	0.09
209	0.08
210	0.11
211	0.1
212	0.12
213	0.13
214	0.2
215	0.28
216	0.37
217	0.44
218	0.5
219	0.61
220	0.68
221	0.77
222	0.81
223	0.77
224	0.75
225	0.73
226	0.67
227	0.57
228	0.47
229	0.4
230	0.33
231	0.29
232	0.24
233	0.2
234	0.23
235	0.24
236	0.23
237	0.21
238	0.21
239	0.28
240	0.36
241	0.43
242	0.42
243	0.44
244	0.46
245	0.48
246	0.47
247	0.41
248	0.35
249	0.34
250	0.3
251	0.28
252	0.28
253	0.25
254	0.26
255	0.31
256	0.35
257	0.32
258	0.32
259	0.3
260	0.29
261	0.27
262	0.25
263	0.18
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.13
269	0.14
270	0.15
271	0.15
272	0.13
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.05
291	0.06
292	0.09
293	0.13
294	0.12
295	0.14
296	0.16
297	0.18
298	0.21
299	0.23
300	0.26
301	0.25
302	0.27
303	0.28
304	0.26
305	0.24
306	0.22
307	0.22
308	0.17
309	0.15
310	0.13
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.09
316	0.1
317	0.11
318	0.1
319	0.15
320	0.18
321	0.21
322	0.25
323	0.27
324	0.29
325	0.3
326	0.31
327	0.27
328	0.32
329	0.29
330	0.27
331	0.26
332	0.24
333	0.23
334	0.21
335	0.22
336	0.15
337	0.14
338	0.13
339	0.11
340	0.13
341	0.15
342	0.16
343	0.19
344	0.21
345	0.21
346	0.2
347	0.2
348	0.19
349	0.21
350	0.22
351	0.18
352	0.18
353	0.18
354	0.2
355	0.2
356	0.17
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.09
361	0.1
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.09
369	0.1
370	0.14
371	0.14
372	0.14
373	0.15
374	0.14
375	0.14
376	0.11
377	0.09
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.02
402	0.02
403	0.03
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.09
408	0.11
409	0.13
410	0.16
411	0.17
412	0.22
413	0.25
414	0.26
415	0.27
416	0.29
417	0.31
418	0.31
419	0.29
420	0.24
421	0.23
422	0.21
423	0.18
424	0.15
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.11
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.13
435	0.12
436	0.14
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.19
441	0.21
442	0.19
443	0.25
444	0.3
445	0.38
446	0.47
447	0.56
448	0.63
449	0.69
450	0.79
451	0.85
452	0.88
453	0.9
454	0.91
455	0.92
456	0.91
457	0.93
458	0.93
459	0.93
460	0.92
461	0.92
462	0.91
463	0.89
464	0.86
465	0.81
466	0.75
467	0.68
468	0.64
469	0.54
470	0.46
471	0.38
472	0.33
473	0.28
474	0.23
475	0.19
476	0.15
477	0.14
478	0.12
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.13
484	0.14
485	0.13
486	0.16
487	0.18
488	0.16
489	0.16
490	0.16
491	0.15
492	0.17
493	0.19
494	0.21
495	0.21
496	0.25
497	0.25
498	0.25
499	0.25
500	0.23
501	0.22
502	0.21
503	0.2
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.14
509	0.13
510	0.1
511	0.09
512	0.1
513	0.12
514	0.12
515	0.11
516	0.11
517	0.13
518	0.19
519	0.21
520	0.25
521	0.25
522	0.3
523	0.37
524	0.47
525	0.49
526	0.48
527	0.53
528	0.58
529	0.62
530	0.67
531	0.64
532	0.61
533	0.63
534	0.65
535	0.63
536	0.61
537	0.6
538	0.54
539	0.53
540	0.5
541	0.5
542	0.51
543	0.47
544	0.41
545	0.38
546	0.36
547	0.32
548	0.28
549	0.3
550	0.29
551	0.29
552	0.32
553	0.37
554	0.42
555	0.49
556	0.54
557	0.51
558	0.54
559	0.61
560	0.65
561	0.69
562	0.72
563	0.76
564	0.76
565	0.77
566	0.73
567	0.65
568	0.6
569	0.59
570	0.59
571	0.59
572	0.58
573	0.61
574	0.62
575	0.69
576	0.71
577	0.67
578	0.6
579	0.56
580	0.55
581	0.48
582	0.49
583	0.45
584	0.42
585	0.4
586	0.38
587	0.32
588	0.31
589	0.31
590	0.29
591	0.27
592	0.26
593	0.23
594	0.23
595	0.21
596	0.2
597	0.19
598	0.16
599	0.16
600	0.13
601	0.12
602	0.12
603	0.12
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.11
608	0.11
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.11
613	0.1
614	0.1
615	0.17
616	0.18
617	0.2
618	0.24
619	0.26
620	0.27
621	0.33
622	0.41
623	0.39
624	0.46
625	0.48
626	0.53
627	0.56
628	0.63
629	0.57
630	0.51
631	0.48
632	0.43
633	0.36
634	0.28
635	0.24
636	0.18
637	0.2
638	0.2
639	0.22
640	0.24
641	0.27
642	0.29
643	0.28
644	0.29
645	0.29
646	0.3
647	0.28
648	0.28
649	0.31
650	0.32
651	0.35
652	0.35
653	0.38
654	0.41
655	0.41
656	0.4
657	0.35

A0A1V8UD55

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer