Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8UV40

Protein Details
Accession A0A1V8UV40    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
496-522PIPETERHWKRRRQKPRVRRHNGGGRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
480-552RRPPTRPRWSRPPPPLPIPETERHWKRRRQKPRVRRHNGGGRDRGSDRRPDRDYDRRAVRRDDDDRRRDTRRG
560-564RRRGG
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, pero 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013320  ConA-like_dom_sf  
IPR000757  GH16  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004553  F:hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00722  Glyco_hydro_16  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51762  GH16_2  
PS50102  RRM  
CDD cd02181  GH16_fungal_Lam16A_glucanase  
cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MSTTGWAQYVLGDDFMADGKFFDQFSFFTAGDPTHGFVDYVDQSSASDGGLINVTSSSVYMGVDYTNVATSAGRQSVRITSNKSYNSGLVILDLEHMPGGICGTWPAFWMVGPDWPSNGEIDIIEGVNDQTVNDMTLHTGPGCTISDNGGFSGVITTKNCDVNAAGQDTNAGCQIKTDNMNTYGTGFNANKGGVYATEWTDSAISIFFFPRGSIPSDISSGSPDPSGWGKPLASFQGGCDISSTFKEQQIVFDTTFCGDWAGNTWSSSSCSSKAATCNAFVQNNPSAFADAYWTVNSLKVYQAGAGGPSTVVPTSTVYSAPMTSTVAVSTTSTVAEPTSIPVSSIEPPAPTLQPTTFSSTTKPAWSSRIWTGHHTPVMRNASVTYSAGNATDAYAPTASGTATGLPFGTAPLGTAPVGTAAIETALSSVTFTPGFTMPYLTITSSSTVAVDTLPTSATAAIETATGASAGITSSPTILARRPPTRPRWSRPPPPLPIPETERHWKRRRQKPRVRRHNGGGRDRGSDRRPDRDYDRRAVRRDDDDRRRDTRRGDRDLFDDRRRGGARDGARDDRRGGDQDRDRTRALERDDMKQLEQQSRQKSASPERKPKEPTPDLTDVAPVTTRKRRLNQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPSRLQAFMAQPGNQANPNALKPSTARQSKRLFVYNLPAIATDDSVSDFFNLQLNGLNVTRGADPCISAQMNKGSGYALLEFKTSEDATNAMALNGITMEPEAMDTTNGATNGDAHKGLDIRRPKDYIVPAVTDETANEAGILSNIVPDTQNKISITNIPLYLDEAQMQELLQSFGELKSFILVKDTSSEQSRGIAFCEYMDPSVTDAAVDSLHGMELGDAALRVKRASIGIQQVNSEMSVNAMSLIAGTELKEGADTGRVLCLMNMITPEELMDAEESEEILEDIKEECSKYGNLLETKMPRGSSGNRQAAGIGKIYVKYEDSASAQKALAALAGRKFADRTVVVTYFGEEYFDVGAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.08
5 0.07
6 0.08
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.18
14 0.18
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.11
34 0.1
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.15
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.28
64 0.34
65 0.37
66 0.38
67 0.4
68 0.48
69 0.5
70 0.5
71 0.46
72 0.42
73 0.39
74 0.34
75 0.27
76 0.2
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.13
97 0.13
98 0.17
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.18
105 0.18
106 0.14
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.16
144 0.19
145 0.21
146 0.21
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.25
151 0.25
152 0.22
153 0.19
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.15
159 0.11
160 0.13
161 0.15
162 0.18
163 0.21
164 0.23
165 0.24
166 0.26
167 0.27
168 0.26
169 0.27
170 0.23
171 0.19
172 0.23
173 0.18
174 0.17
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.19
206 0.2
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.23
224 0.23
225 0.22
226 0.2
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.23
231 0.16
232 0.18
233 0.22
234 0.21
235 0.24
236 0.28
237 0.3
238 0.25
239 0.23
240 0.22
241 0.19
242 0.19
243 0.16
244 0.11
245 0.08
246 0.07
247 0.1
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.16
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.23
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.28
265 0.3
266 0.3
267 0.27
268 0.29
269 0.28
270 0.27
271 0.26
272 0.22
273 0.19
274 0.18
275 0.18
276 0.15
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.15
336 0.15
337 0.13
338 0.14
339 0.12
340 0.15
341 0.17
342 0.23
343 0.22
344 0.22
345 0.24
346 0.26
347 0.27
348 0.26
349 0.27
350 0.21
351 0.24
352 0.24
353 0.27
354 0.29
355 0.34
356 0.33
357 0.35
358 0.38
359 0.39
360 0.42
361 0.39
362 0.33
363 0.34
364 0.37
365 0.32
366 0.27
367 0.23
368 0.21
369 0.21
370 0.2
371 0.13
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.08
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.12
466 0.18
467 0.22
468 0.28
469 0.35
470 0.43
471 0.53
472 0.6
473 0.62
474 0.67
475 0.72
476 0.75
477 0.78
478 0.77
479 0.71
480 0.69
481 0.67
482 0.58
483 0.53
484 0.49
485 0.42
486 0.38
487 0.42
488 0.43
489 0.47
490 0.52
491 0.57
492 0.62
493 0.7
494 0.77
495 0.8
496 0.84
497 0.86
498 0.9
499 0.93
500 0.91
501 0.86
502 0.83
503 0.8
504 0.78
505 0.74
506 0.69
507 0.59
508 0.54
509 0.51
510 0.47
511 0.4
512 0.4
513 0.36
514 0.37
515 0.37
516 0.38
517 0.43
518 0.48
519 0.51
520 0.5
521 0.57
522 0.55
523 0.56
524 0.56
525 0.52
526 0.5
527 0.52
528 0.55
529 0.55
530 0.55
531 0.58
532 0.6
533 0.61
534 0.57
535 0.57
536 0.57
537 0.56
538 0.57
539 0.55
540 0.52
541 0.52
542 0.57
543 0.56
544 0.49
545 0.44
546 0.36
547 0.38
548 0.37
549 0.34
550 0.28
551 0.28
552 0.28
553 0.31
554 0.34
555 0.36
556 0.36
557 0.37
558 0.36
559 0.31
560 0.29
561 0.27
562 0.24
563 0.25
564 0.29
565 0.36
566 0.4
567 0.41
568 0.4
569 0.38
570 0.38
571 0.35
572 0.33
573 0.33
574 0.3
575 0.31
576 0.35
577 0.35
578 0.34
579 0.32
580 0.32
581 0.3
582 0.34
583 0.36
584 0.36
585 0.4
586 0.4
587 0.4
588 0.42
589 0.46
590 0.5
591 0.53
592 0.59
593 0.57
594 0.64
595 0.67
596 0.67
597 0.67
598 0.62
599 0.57
600 0.54
601 0.55
602 0.48
603 0.42
604 0.38
605 0.28
606 0.23
607 0.21
608 0.14
609 0.15
610 0.2
611 0.26
612 0.31
613 0.36
614 0.44
615 0.52
616 0.62
617 0.66
618 0.69
619 0.73
620 0.72
621 0.69
622 0.61
623 0.52
624 0.45
625 0.37
626 0.29
627 0.2
628 0.18
629 0.2
630 0.2
631 0.19
632 0.16
633 0.13
634 0.12
635 0.12
636 0.09
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.11
642 0.12
643 0.13
644 0.16
645 0.16
646 0.19
647 0.21
648 0.22
649 0.25
650 0.27
651 0.31
652 0.29
653 0.31
654 0.3
655 0.28
656 0.27
657 0.24
658 0.22
659 0.22
660 0.23
661 0.2
662 0.2
663 0.2
664 0.21
665 0.2
666 0.18
667 0.15
668 0.15
669 0.15
670 0.17
671 0.15
672 0.15
673 0.15
674 0.21
675 0.28
676 0.34
677 0.35
678 0.41
679 0.47
680 0.5
681 0.53
682 0.53
683 0.47
684 0.41
685 0.46
686 0.41
687 0.36
688 0.31
689 0.27
690 0.22
691 0.2
692 0.17
693 0.11
694 0.08
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.08
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.11
705 0.11
706 0.12
707 0.12
708 0.12
709 0.09
710 0.11
711 0.12
712 0.1
713 0.12
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.16
718 0.15
719 0.14
720 0.16
721 0.17
722 0.19
723 0.18
724 0.18
725 0.14
726 0.14
727 0.15
728 0.14
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.14
735 0.12
736 0.11
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.13
741 0.12
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.06
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.03
752 0.04
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.07
758 0.09
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.1
763 0.12
764 0.13
765 0.12
766 0.11
767 0.12
768 0.14
769 0.17
770 0.22
771 0.28
772 0.29
773 0.34
774 0.35
775 0.35
776 0.4
777 0.42
778 0.41
779 0.36
780 0.35
781 0.31
782 0.31
783 0.31
784 0.24
785 0.2
786 0.16
787 0.14
788 0.12
789 0.1
790 0.09
791 0.08
792 0.08
793 0.09
794 0.05
795 0.05
796 0.05
797 0.06
798 0.07
799 0.08
800 0.14
801 0.15
802 0.19
803 0.18
804 0.19
805 0.21
806 0.25
807 0.27
808 0.25
809 0.24
810 0.21
811 0.2
812 0.22
813 0.22
814 0.17
815 0.16
816 0.13
817 0.13
818 0.12
819 0.11
820 0.1
821 0.09
822 0.09
823 0.08
824 0.08
825 0.08
826 0.08
827 0.09
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.1
832 0.09
833 0.12
834 0.12
835 0.12
836 0.15
837 0.18
838 0.18
839 0.21
840 0.23
841 0.2
842 0.23
843 0.24
844 0.21
845 0.2
846 0.19
847 0.15
848 0.15
849 0.17
850 0.15
851 0.13
852 0.14
853 0.13
854 0.12
855 0.13
856 0.12
857 0.09
858 0.08
859 0.08
860 0.07
861 0.07
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.05
867 0.04
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.04
872 0.05
873 0.07
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.1
878 0.11
879 0.15
880 0.2
881 0.28
882 0.32
883 0.33
884 0.34
885 0.33
886 0.32
887 0.29
888 0.23
889 0.14
890 0.1
891 0.09
892 0.08
893 0.08
894 0.07
895 0.06
896 0.05
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.1
908 0.1
909 0.1
910 0.12
911 0.12
912 0.12
913 0.12
914 0.13
915 0.1
916 0.11
917 0.12
918 0.12
919 0.12
920 0.11
921 0.12
922 0.1
923 0.09
924 0.09
925 0.08
926 0.07
927 0.08
928 0.08
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.06
933 0.07
934 0.06
935 0.06
936 0.07
937 0.09
938 0.11
939 0.12
940 0.12
941 0.15
942 0.16
943 0.18
944 0.21
945 0.26
946 0.26
947 0.29
948 0.35
949 0.36
950 0.41
951 0.41
952 0.36
953 0.32
954 0.35
955 0.38
956 0.42
957 0.48
958 0.5
959 0.48
960 0.48
961 0.47
962 0.47
963 0.43
964 0.34
965 0.26
966 0.21
967 0.21
968 0.23
969 0.23
970 0.2
971 0.19
972 0.19
973 0.2
974 0.21
975 0.26
976 0.26
977 0.27
978 0.26
979 0.25
980 0.24
981 0.2
982 0.19
983 0.16
984 0.18
985 0.18
986 0.22
987 0.22
988 0.23
989 0.24
990 0.22
991 0.26
992 0.23
993 0.23
994 0.26
995 0.27
996 0.28
997 0.27
998 0.28
999 0.23
1000 0.22
1001 0.21
1002 0.13
1003 0.14