FuNGI

A0A1V8US73

Protein Details

Accession

A0A1V8US73

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
66-88	RAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
62-130	RGRGRAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEKEEADRKREESDRKAKEARAKFGGSRGRGDGRGRGRLRGGYMG
134-134	R
331-339	RRRGKGKQR

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 8, cyto_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRRPPPRPPVVPSPPSTSAPTPAASPPTQVDLASQPSTSHPSTPAPPVNSTIPTASTSARGRGRAPVAKPKFTGRRSNKSRAELEKEEADRKREESDRKAKEARAKFGGSRGRGDGRGRGRLRGGYMGEGERRKGEGTAVMSGPFSLGEAVAEVKGGGRGWTSGSGGGGGSGGGTSSGVGGGGGGSGGGGGGSGGGGGSGGGGGSSGASGSRSGVKQEPGAGGTSHRDVQMMDSRTVIKSEDGGYISSGDDEDDKAAGGRRNIDDLALVDLTADDDTSGAAPGGFAPVRIQRVEHRDRALGLKEDAAKVADTSALVVEANDIPSSPTLRRRGKGKQRAKDVEIVSEQHAYQGVYSDSSSEGERRPRIKPEPTDDDDDRPATPPGQAPTASMLPPQSPPSSPEARKKAKDRVKQPSFSTQDRPEFETNEDALEWDLREKDLRILRDELGTPAPSTATQQTGEDAEMPDASATDPRQDKVYLFQFPPILPDLKPITVKPDPDGPPSTSTAHAPPPTNPAGFVGKLNIHASGRATLDWGGVPMEMGMGIEASFLQDVIIAELEKKRQDAVEGEEGIEGKEKVVGGRAMGMGQVKGKFVVVPSWEGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.72
3	0.66
4	0.61
5	0.59
6	0.5
7	0.45
8	0.41
9	0.38
10	0.32
11	0.31
12	0.34
13	0.29
14	0.3
15	0.27
16	0.28
17	0.28
18	0.26
19	0.24
20	0.23
21	0.28
22	0.26
23	0.25
24	0.21
25	0.23
26	0.29
27	0.28
28	0.26
29	0.23
30	0.27
31	0.3
32	0.38
33	0.42
34	0.4
35	0.4
36	0.42
37	0.43
38	0.4
39	0.39
40	0.32
41	0.27
42	0.25
43	0.24
44	0.21
45	0.23
46	0.23
47	0.29
48	0.32
49	0.32
50	0.32
51	0.37
52	0.45
53	0.46
54	0.49
55	0.53
56	0.56
57	0.59
58	0.6
59	0.62
60	0.64
61	0.63
62	0.68
63	0.67
64	0.71
65	0.74
66	0.82
67	0.81
68	0.79
69	0.8
70	0.78
71	0.77
72	0.7
73	0.66
74	0.63
75	0.59
76	0.6
77	0.55
78	0.51
79	0.45
80	0.42
81	0.44
82	0.43
83	0.47
84	0.5
85	0.56
86	0.59
87	0.64
88	0.68
89	0.67
90	0.69
91	0.69
92	0.65
93	0.61
94	0.58
95	0.52
96	0.54
97	0.57
98	0.5
99	0.46
100	0.44
101	0.41
102	0.42
103	0.43
104	0.43
105	0.41
106	0.48
107	0.46
108	0.45
109	0.44
110	0.42
111	0.42
112	0.4
113	0.35
114	0.27
115	0.28
116	0.28
117	0.31
118	0.3
119	0.29
120	0.25
121	0.25
122	0.23
123	0.21
124	0.18
125	0.17
126	0.18
127	0.2
128	0.19
129	0.19
130	0.18
131	0.17
132	0.16
133	0.11
134	0.09
135	0.05
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.08
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.07
158	0.05
159	0.04
160	0.03
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.02
173	0.02
174	0.02
175	0.02
176	0.02
177	0.02
178	0.02
179	0.02
180	0.02
181	0.02
182	0.02
183	0.02
184	0.02
185	0.02
186	0.02
187	0.02
188	0.02
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.02
195	0.02
196	0.02
197	0.03
198	0.04
199	0.05
200	0.08
201	0.09
202	0.12
203	0.15
204	0.16
205	0.16
206	0.19
207	0.19
208	0.16
209	0.17
210	0.14
211	0.13
212	0.14
213	0.15
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.14
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.2
223	0.21
224	0.21
225	0.21
226	0.18
227	0.11
228	0.1
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.08
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.08
246	0.1
247	0.1
248	0.13
249	0.14
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.13
254	0.11
255	0.12
256	0.09
257	0.08
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.05
273	0.05
274	0.04
275	0.06
276	0.09
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.15
281	0.23
282	0.28
283	0.31
284	0.3
285	0.29
286	0.3
287	0.32
288	0.29
289	0.23
290	0.18
291	0.17
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.13
296	0.11
297	0.09
298	0.09
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.08
314	0.09
315	0.15
316	0.23
317	0.28
318	0.31
319	0.37
320	0.47
321	0.56
322	0.65
323	0.69
324	0.68
325	0.73
326	0.76
327	0.72
328	0.69
329	0.59
330	0.52
331	0.44
332	0.38
333	0.29
334	0.25
335	0.22
336	0.15
337	0.15
338	0.11
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.12
350	0.17
351	0.23
352	0.26
353	0.28
354	0.35
355	0.41
356	0.47
357	0.5
358	0.52
359	0.55
360	0.55
361	0.59
362	0.53
363	0.5
364	0.44
365	0.39
366	0.32
367	0.25
368	0.22
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.14
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.17
377	0.18
378	0.17
379	0.15
380	0.15
381	0.13
382	0.15
383	0.17
384	0.15
385	0.14
386	0.17
387	0.22
388	0.29
389	0.33
390	0.4
391	0.47
392	0.53
393	0.59
394	0.63
395	0.68
396	0.69
397	0.73
398	0.74
399	0.76
400	0.76
401	0.75
402	0.72
403	0.72
404	0.68
405	0.64
406	0.61
407	0.56
408	0.55
409	0.52
410	0.54
411	0.46
412	0.42
413	0.4
414	0.37
415	0.3
416	0.24
417	0.21
418	0.16
419	0.14
420	0.13
421	0.11
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.17
428	0.21
429	0.23
430	0.25
431	0.28
432	0.28
433	0.3
434	0.3
435	0.25
436	0.23
437	0.22
438	0.18
439	0.15
440	0.15
441	0.12
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.16
450	0.14
451	0.13
452	0.11
453	0.1
454	0.1
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.15
461	0.17
462	0.17
463	0.2
464	0.21
465	0.21
466	0.26
467	0.31
468	0.31
469	0.29
470	0.32
471	0.32
472	0.31
473	0.33
474	0.29
475	0.25
476	0.19
477	0.23
478	0.24
479	0.25
480	0.27
481	0.24
482	0.29
483	0.31
484	0.33
485	0.3
486	0.35
487	0.35
488	0.39
489	0.42
490	0.37
491	0.37
492	0.38
493	0.38
494	0.3
495	0.3
496	0.28
497	0.31
498	0.32
499	0.31
500	0.3
501	0.34
502	0.37
503	0.34
504	0.32
505	0.28
506	0.28
507	0.27
508	0.26
509	0.23
510	0.2
511	0.23
512	0.24
513	0.23
514	0.19
515	0.2
516	0.21
517	0.2
518	0.2
519	0.17
520	0.18
521	0.15
522	0.16
523	0.14
524	0.13
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.09
545	0.08
546	0.11
547	0.15
548	0.19
549	0.2
550	0.2
551	0.21
552	0.21
553	0.24
554	0.25
555	0.29
556	0.33
557	0.32
558	0.32
559	0.31
560	0.3
561	0.28
562	0.27
563	0.2
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.12
568	0.17
569	0.17
570	0.15
571	0.18
572	0.18
573	0.16
574	0.18
575	0.19
576	0.16
577	0.19
578	0.2
579	0.18
580	0.18
581	0.18
582	0.17
583	0.17
584	0.21
585	0.2

A0A1V8US73

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer