Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TVF6

Protein Details
Accession A0A1V8TVF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-49AQHAARKEEKKSHKPVKEFSIGHydrophilic
306-333QTYSTTKPPPKAKPKRKPKQPEVFDPSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-324KPPPKAKPKRKPK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, nucl 9, cyto 8, plas 4, mito 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSGSAANSGPNSNAPPDPSKFSAEQKVAQHAARKEEKKSHKPVKEFSIGTLTLDEVAQALRLVPLVNTFLNDVVFICIDCEAWEFDSQEITEIGVAVLDSRDLSQAPSQAREPAQAYDNILTKIKFAHYRPVEYALHGNKRHVPGCPEAFGFGTSTWIKLGDGAKILSRIFTDPARLAEAADFTTDYTFGSRPIVFVAHGPGGDIAFMQTLGFDLKKAHNIAAHVDTEKVVVKNIGGLVTLLASVEINPVNLHNAGNDAAYTLQAMIRAAVLEWAEPKSVAKRHELLTKPDEPPEELTAAADQAAQTYSTTKPPPKAKPKRKPKQPEVFDPSIVAPLAWGGTALPGDEIKLAIPFKAAKNAAFVQRERDKVAKDAAKAQKAADRAEMRAKNPNGGPFIEMPSQQVMGAKVAPKKICRFFQIGDCRFGMNCRYVHELVDQTKLAASVSLLELNPESDVGAASGAVNLQRTAVSADNDYGKKTDEIKRLSLRVWEEKTLSDSEDSEVVFKGRKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.32
4 0.37
5 0.38
6 0.4
7 0.41
8 0.45
9 0.5
10 0.48
11 0.5
12 0.48
13 0.53
14 0.51
15 0.51
16 0.52
17 0.46
18 0.51
19 0.55
20 0.55
21 0.55
22 0.61
23 0.69
24 0.71
25 0.78
26 0.8
27 0.79
28 0.82
29 0.82
30 0.8
31 0.78
32 0.69
33 0.61
34 0.58
35 0.49
36 0.43
37 0.36
38 0.27
39 0.19
40 0.18
41 0.15
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.11
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.25
97 0.25
98 0.27
99 0.27
100 0.24
101 0.25
102 0.23
103 0.25
104 0.23
105 0.25
106 0.23
107 0.23
108 0.21
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.31
115 0.33
116 0.38
117 0.39
118 0.43
119 0.4
120 0.35
121 0.41
122 0.38
123 0.42
124 0.39
125 0.4
126 0.4
127 0.44
128 0.44
129 0.39
130 0.36
131 0.35
132 0.37
133 0.36
134 0.31
135 0.27
136 0.26
137 0.23
138 0.2
139 0.13
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.16
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.14
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.08
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.11
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.11
266 0.14
267 0.16
268 0.19
269 0.21
270 0.24
271 0.32
272 0.34
273 0.35
274 0.37
275 0.41
276 0.39
277 0.38
278 0.36
279 0.29
280 0.29
281 0.26
282 0.21
283 0.15
284 0.14
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.07
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.08
296 0.12
297 0.16
298 0.19
299 0.26
300 0.34
301 0.43
302 0.53
303 0.63
304 0.7
305 0.77
306 0.85
307 0.89
308 0.92
309 0.93
310 0.93
311 0.92
312 0.87
313 0.87
314 0.84
315 0.77
316 0.66
317 0.56
318 0.46
319 0.36
320 0.3
321 0.19
322 0.1
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.04
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.09
341 0.12
342 0.12
343 0.19
344 0.2
345 0.18
346 0.23
347 0.26
348 0.31
349 0.33
350 0.33
351 0.34
352 0.38
353 0.4
354 0.39
355 0.4
356 0.35
357 0.33
358 0.41
359 0.37
360 0.33
361 0.41
362 0.44
363 0.45
364 0.44
365 0.42
366 0.38
367 0.36
368 0.36
369 0.34
370 0.29
371 0.27
372 0.36
373 0.38
374 0.36
375 0.44
376 0.43
377 0.41
378 0.41
379 0.43
380 0.36
381 0.34
382 0.34
383 0.26
384 0.3
385 0.27
386 0.24
387 0.22
388 0.2
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.14
393 0.13
394 0.15
395 0.18
396 0.2
397 0.26
398 0.29
399 0.33
400 0.4
401 0.46
402 0.48
403 0.49
404 0.51
405 0.48
406 0.54
407 0.59
408 0.55
409 0.51
410 0.47
411 0.44
412 0.38
413 0.38
414 0.31
415 0.26
416 0.24
417 0.23
418 0.29
419 0.28
420 0.3
421 0.32
422 0.34
423 0.31
424 0.34
425 0.31
426 0.24
427 0.25
428 0.23
429 0.19
430 0.13
431 0.11
432 0.08
433 0.1
434 0.12
435 0.11
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.11
441 0.09
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.12
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.19
461 0.25
462 0.26
463 0.27
464 0.25
465 0.24
466 0.25
467 0.3
468 0.37
469 0.39
470 0.43
471 0.5
472 0.56
473 0.57
474 0.56
475 0.56
476 0.54
477 0.55
478 0.55
479 0.51
480 0.46
481 0.44
482 0.46
483 0.41
484 0.36
485 0.28
486 0.25
487 0.22
488 0.23
489 0.21
490 0.18
491 0.17
492 0.17