FuNGI

A0A1V8SUJ9

Protein Details

Accession

A0A1V8SUJ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
998-1021	DSPDHTSSTKPRRKPTSRPTALSK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1250-1255	RMKERR

Subcellular Location(s)

cyto 9, cysk 9, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MDDLNPVRVMNIFRKISAQDVELFGMDPASGGRPENMLWTFVPAPPVAIRPSVAQEAASTEDDITNKLGDILHVNSLIRAGLAQGQSISKITEMWEYLQVQVAMYINGGLPGLSKDSAYGKMMRGFEQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLSIEEVAVPTRVAVNMTYPEKVNAQNIDKLKACIMRGSRHHPGANWVIKGADGRRLALKMAASKSDLKRVEEKLVIGDIVERHLEDGDIVLFNRQPSLHKLSILAHRAKIRPWRTFRLNECVCNPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEAMELMGVKHNLATPKNGAPIIAAIQDFITAAYLMSRKDKFFNRRQFEQCVSYMYNGMTAKDPYTGKEYPIHIPPPAIIRPQQQWTGKQVWSMLIKPHPDYPVNINLEAKCKQYTAPRTPGTIPDMVENDAYLVIRNSEVMCGVMDKATVGDGKKDSVFYVIWRDFRPEYAAEAMNRLSKLSARWLGEQGFSIGINDVYPSEQLRLRKAQLVGTAYAKCVKLIEQFKRGELQRDPGCDEEMTMENQMSGILSKVRQECGDACFAELSVFNAPLTMATCGSKGSLINVSQMVAVVGQQIIGGKRVLDGFQDRTLPHFAKASRDPPAKGFVLNSFFSGLNPTEFIFHAMSGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSAQYDNTVRTSNGSVVQMKFGDDGLDPLDMEGSAKPVNFERTYAHALSSTWDNSERGLTQKKVKKIVTTRIEAERKGLDRICEQDQSILPYEYEEDKPERTDQLESIRSFLTTVSDFIADKSAKIASTQRRNPADTSHIFKLSRTALDRFLHLCFQKFEKSKVEPHHAVGAVGAHSIGEPGTQMTLKTFHFAGVAGMSITQGVPRIKEIINASKVISTPVISCSLDSPYEAIAARMASALIQKTYMRDIVAYIEDCWGQDGGWINMRVDWTAVRNLGLRISLEHITTAIEGTKGMKALGVTALHHGNSHIRVYIDSPDHTSSTKPRRKPTSRPTALSKARDLAGEPPLAETGSDLFLQIQQLKRRLPGVVISGYPDAHRAIMKRDDRPDATGREPIQVLVEGYGFRHCLTTSGINGLSTYTNHIPETLSVLGIEAARSTIIREISQVMGGMDIDPRHMQLLADVMTFKGEVLGITRFGLAKMRESVLQLASFEKTAEHLYEAGVKGKEDRIEGVSECIIMGQTMGIGTGGVKVVRPVKIAEGLGQRAMKGETFTDGWKSVAKAREARMKERRERILGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.38
4	0.36
5	0.32
6	0.26
7	0.27
8	0.27
9	0.24
10	0.23
11	0.18
12	0.15
13	0.13
14	0.09
15	0.08
16	0.09
17	0.1
18	0.1
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.2
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.24
27	0.24
28	0.24
29	0.27
30	0.2
31	0.21
32	0.21
33	0.24
34	0.21
35	0.2
36	0.2
37	0.2
38	0.24
39	0.25
40	0.24
41	0.21
42	0.19
43	0.2
44	0.23
45	0.22
46	0.18
47	0.15
48	0.18
49	0.18
50	0.19
51	0.17
52	0.14
53	0.13
54	0.13
55	0.13
56	0.11
57	0.14
58	0.15
59	0.17
60	0.18
61	0.18
62	0.17
63	0.17
64	0.16
65	0.12
66	0.1
67	0.08
68	0.12
69	0.12
70	0.13
71	0.14
72	0.14
73	0.16
74	0.17
75	0.16
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.15
80	0.15
81	0.17
82	0.22
83	0.22
84	0.23
85	0.26
86	0.24
87	0.2
88	0.21
89	0.19
90	0.13
91	0.12
92	0.12
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.06
97	0.06
98	0.07
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.11
103	0.14
104	0.17
105	0.19
106	0.21
107	0.22
108	0.28
109	0.3
110	0.32
111	0.35
112	0.38
113	0.42
114	0.48
115	0.51
116	0.5
117	0.58
118	0.61
119	0.62
120	0.65
121	0.68
122	0.69
123	0.67
124	0.66
125	0.68
126	0.7
127	0.7
128	0.69
129	0.68
130	0.58
131	0.55
132	0.51
133	0.45
134	0.37
135	0.33
136	0.34
137	0.26
138	0.26
139	0.27
140	0.29
141	0.29
142	0.3
143	0.28
144	0.22
145	0.22
146	0.22
147	0.21
148	0.18
149	0.15
150	0.14
151	0.13
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.11
161	0.16
162	0.19
163	0.2
164	0.2
165	0.21
166	0.24
167	0.26
168	0.27
169	0.28
170	0.29
171	0.34
172	0.36
173	0.39
174	0.38
175	0.37
176	0.36
177	0.34
178	0.31
179	0.3
180	0.32
181	0.36
182	0.4
183	0.47
184	0.51
185	0.53
186	0.54
187	0.49
188	0.51
189	0.52
190	0.52
191	0.44
192	0.37
193	0.31
194	0.29
195	0.32
196	0.27
197	0.25
198	0.2
199	0.21
200	0.24
201	0.24
202	0.24
203	0.23
204	0.25
205	0.24
206	0.25
207	0.26
208	0.25
209	0.32
210	0.34
211	0.4
212	0.41
213	0.38
214	0.42
215	0.44
216	0.47
217	0.42
218	0.4
219	0.33
220	0.31
221	0.27
222	0.2
223	0.19
224	0.14
225	0.13
226	0.13
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.07
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.12
240	0.12
241	0.13
242	0.18
243	0.26
244	0.27
245	0.26
246	0.28
247	0.32
248	0.39
249	0.44
250	0.41
251	0.37
252	0.42
253	0.42
254	0.46
255	0.5
256	0.5
257	0.52
258	0.56
259	0.61
260	0.63
261	0.69
262	0.69
263	0.7
264	0.67
265	0.62
266	0.59
267	0.55
268	0.48
269	0.42
270	0.38
271	0.3
272	0.27
273	0.23
274	0.22
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.14
279	0.11
280	0.1
281	0.11
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.11
304	0.15
305	0.16
306	0.18
307	0.19
308	0.22
309	0.25
310	0.25
311	0.22
312	0.19
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.12
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.04
324	0.04
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.14
329	0.16
330	0.17
331	0.23
332	0.32
333	0.39
334	0.48
335	0.58
336	0.59
337	0.66
338	0.69
339	0.7
340	0.66
341	0.61
342	0.52
343	0.46
344	0.4
345	0.33
346	0.29
347	0.23
348	0.23
349	0.19
350	0.19
351	0.16
352	0.15
353	0.15
354	0.18
355	0.18
356	0.15
357	0.22
358	0.21
359	0.22
360	0.26
361	0.28
362	0.28
363	0.32
364	0.33
365	0.27
366	0.26
367	0.25
368	0.25
369	0.25
370	0.24
371	0.22
372	0.24
373	0.28
374	0.32
375	0.38
376	0.36
377	0.37
378	0.4
379	0.42
380	0.39
381	0.36
382	0.33
383	0.29
384	0.29
385	0.27
386	0.26
387	0.25
388	0.27
389	0.27
390	0.3
391	0.29
392	0.28
393	0.28
394	0.28
395	0.32
396	0.32
397	0.31
398	0.3
399	0.28
400	0.31
401	0.31
402	0.28
403	0.21
404	0.19
405	0.2
406	0.26
407	0.34
408	0.37
409	0.44
410	0.44
411	0.46
412	0.47
413	0.48
414	0.43
415	0.37
416	0.29
417	0.23
418	0.23
419	0.21
420	0.19
421	0.15
422	0.12
423	0.1
424	0.09
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.1
445	0.1
446	0.12
447	0.13
448	0.13
449	0.12
450	0.13
451	0.13
452	0.11
453	0.18
454	0.2
455	0.22
456	0.22
457	0.25
458	0.24
459	0.24
460	0.26
461	0.18
462	0.18
463	0.18
464	0.2
465	0.16
466	0.18
467	0.18
468	0.17
469	0.17
470	0.15
471	0.12
472	0.11
473	0.12
474	0.16
475	0.21
476	0.2
477	0.22
478	0.25
479	0.25
480	0.25
481	0.24
482	0.18
483	0.14
484	0.12
485	0.1
486	0.08
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.07
495	0.1
496	0.12
497	0.16
498	0.2
499	0.21
500	0.25
501	0.26
502	0.26
503	0.27
504	0.28
505	0.25
506	0.24
507	0.23
508	0.19
509	0.21
510	0.19
511	0.15
512	0.13
513	0.13
514	0.18
515	0.25
516	0.29
517	0.34
518	0.34
519	0.35
520	0.4
521	0.4
522	0.38
523	0.31
524	0.34
525	0.29
526	0.31
527	0.32
528	0.27
529	0.28
530	0.22
531	0.21
532	0.16
533	0.14
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.06
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.1
546	0.11
547	0.13
548	0.13
549	0.14
550	0.15
551	0.16
552	0.19
553	0.15
554	0.14
555	0.13
556	0.13
557	0.11
558	0.1
559	0.09
560	0.06
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.07
576	0.09
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.08
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.03
589	0.03
590	0.04
591	0.05
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.06
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.1
600	0.11
601	0.13
602	0.15
603	0.14
604	0.16
605	0.19
606	0.19
607	0.17
608	0.18
609	0.17
610	0.2
611	0.24
612	0.24
613	0.28
614	0.3
615	0.3
616	0.28
617	0.32
618	0.27
619	0.24
620	0.22
621	0.17
622	0.18
623	0.18
624	0.17
625	0.15
626	0.14
627	0.14
628	0.15
629	0.12
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.1
636	0.09
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.08
658	0.14
659	0.14
660	0.18
661	0.18
662	0.18
663	0.18
664	0.18
665	0.2
666	0.17
667	0.18
668	0.15
669	0.15
670	0.16
671	0.16
672	0.15
673	0.12
674	0.11
675	0.1
676	0.1
677	0.11
678	0.09
679	0.09
680	0.11
681	0.11
682	0.12
683	0.14
684	0.16
685	0.15
686	0.17
687	0.15
688	0.15
689	0.14
690	0.11
691	0.11
692	0.07
693	0.08
694	0.07
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.07
706	0.08
707	0.13
708	0.13
709	0.14
710	0.14
711	0.18
712	0.22
713	0.22
714	0.21
715	0.17
716	0.17
717	0.17
718	0.18
719	0.14
720	0.11
721	0.12
722	0.11
723	0.11
724	0.13
725	0.12
726	0.14
727	0.18
728	0.2
729	0.28
730	0.33
731	0.38
732	0.44
733	0.45
734	0.48
735	0.5
736	0.58
737	0.55
738	0.53
739	0.52
740	0.53
741	0.54
742	0.47
743	0.42
744	0.36
745	0.31
746	0.31
747	0.29
748	0.22
749	0.21
750	0.24
751	0.25
752	0.23
753	0.21
754	0.21
755	0.21
756	0.22
757	0.22
758	0.19
759	0.15
760	0.14
761	0.16
762	0.15
763	0.15
764	0.15
765	0.14
766	0.15
767	0.17
768	0.18
769	0.18
770	0.17
771	0.17
772	0.17
773	0.22
774	0.26
775	0.25
776	0.25
777	0.24
778	0.22
779	0.21
780	0.19
781	0.14
782	0.09
783	0.1
784	0.09
785	0.09
786	0.09
787	0.1
788	0.15
789	0.12
790	0.12
791	0.12
792	0.12
793	0.11
794	0.13
795	0.2
796	0.23
797	0.33
798	0.39
799	0.46
800	0.49
801	0.51
802	0.51
803	0.47
804	0.46
805	0.39
806	0.4
807	0.35
808	0.35
809	0.33
810	0.32
811	0.33
812	0.28
813	0.29
814	0.26
815	0.25
816	0.27
817	0.27
818	0.29
819	0.27
820	0.26
821	0.27
822	0.24
823	0.24
824	0.2
825	0.22
826	0.29
827	0.29
828	0.32
829	0.34
830	0.36
831	0.42
832	0.46
833	0.52
834	0.46
835	0.45
836	0.47
837	0.4
838	0.37
839	0.3
840	0.24
841	0.16
842	0.13
843	0.11
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.04
848	0.03
849	0.03
850	0.04
851	0.05
852	0.05
853	0.05
854	0.07
855	0.09
856	0.1
857	0.12
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.11
862	0.1
863	0.08
864	0.08
865	0.06
866	0.06
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.04
871	0.08
872	0.08
873	0.09
874	0.1
875	0.14
876	0.14
877	0.18
878	0.22
879	0.26
880	0.28
881	0.29
882	0.28
883	0.26
884	0.26
885	0.24
886	0.2
887	0.13
888	0.11
889	0.12
890	0.15
891	0.13
892	0.14
893	0.13
894	0.15
895	0.14
896	0.14
897	0.13
898	0.1
899	0.12
900	0.11
901	0.1
902	0.09
903	0.08
904	0.08
905	0.07
906	0.07
907	0.06
908	0.08
909	0.09
910	0.08
911	0.1
912	0.1
913	0.12
914	0.14
915	0.15
916	0.12
917	0.12
918	0.12
919	0.13
920	0.15
921	0.14
922	0.13
923	0.13
924	0.13
925	0.12
926	0.13
927	0.1
928	0.08
929	0.09
930	0.11
931	0.11
932	0.16
933	0.17
934	0.16
935	0.17
936	0.18
937	0.16
938	0.14
939	0.14
940	0.12
941	0.14
942	0.14
943	0.14
944	0.15
945	0.16
946	0.16
947	0.16
948	0.13
949	0.12
950	0.15
951	0.15
952	0.13
953	0.13
954	0.12
955	0.12
956	0.11
957	0.11
958	0.08
959	0.06
960	0.07
961	0.08
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.09
966	0.09
967	0.1
968	0.13
969	0.12
970	0.11
971	0.14
972	0.16
973	0.15
974	0.15
975	0.15
976	0.16
977	0.17
978	0.17
979	0.16
980	0.15
981	0.15
982	0.17
983	0.22
984	0.21
985	0.2
986	0.23
987	0.23
988	0.24
989	0.24
990	0.25
991	0.29
992	0.37
993	0.44
994	0.47
995	0.55
996	0.65
997	0.72
998	0.8
999	0.82
1000	0.82
1001	0.82
1002	0.8
1003	0.79
1004	0.79
1005	0.78
1006	0.72
1007	0.64
1008	0.56
1009	0.49
1010	0.44
1011	0.37
1012	0.31
1013	0.27
1014	0.24
1015	0.21
1016	0.18
1017	0.18
1018	0.17
1019	0.15
1020	0.12
1021	0.09
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.08
1025	0.08
1026	0.1
1027	0.13
1028	0.17
1029	0.21
1030	0.26
1031	0.31
1032	0.33
1033	0.35
1034	0.37
1035	0.35
1036	0.32
1037	0.31
1038	0.29
1039	0.27
1040	0.25
1041	0.25
1042	0.24
1043	0.23
1044	0.22
1045	0.19
1046	0.15
1047	0.14
1048	0.16
1049	0.14
1050	0.19
1051	0.28
1052	0.34
1053	0.39
1054	0.44
1055	0.5
1056	0.5
1057	0.54
1058	0.54
1059	0.5
1060	0.47
1061	0.47
1062	0.42
1063	0.39
1064	0.37
1065	0.32
1066	0.27
1067	0.23
1068	0.2
1069	0.15
1070	0.14
1071	0.1
1072	0.11
1073	0.12
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.16
1080	0.19
1081	0.19
1082	0.22
1083	0.23
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.21
1087	0.18
1088	0.14
1089	0.19
1090	0.17
1091	0.19
1092	0.19
1093	0.19
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.23
1097	0.17
1098	0.15
1099	0.12
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.12
1103	0.12
1104	0.07
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.08
1109	0.1
1110	0.12
1111	0.12
1112	0.14
1113	0.16
1114	0.17
1115	0.18
1116	0.17
1117	0.13
1118	0.12
1119	0.12
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.1
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.12
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.12
1129	0.1
1130	0.15
1131	0.13
1132	0.14
1133	0.13
1134	0.12
1135	0.13
1136	0.13
1137	0.12
1138	0.08
1139	0.07
1140	0.06
1141	0.09
1142	0.1
1143	0.11
1144	0.11
1145	0.13
1146	0.12
1147	0.13
1148	0.19
1149	0.17
1150	0.2
1151	0.23
1152	0.24
1153	0.25
1154	0.27
1155	0.3
1156	0.27
1157	0.27
1158	0.23
1159	0.21
1160	0.21
1161	0.19
1162	0.17
1163	0.14
1164	0.13
1165	0.14
1166	0.15
1167	0.14
1168	0.13
1169	0.14
1170	0.2
1171	0.21
1172	0.24
1173	0.23
1174	0.22
1175	0.24
1176	0.27
1177	0.29
1178	0.25
1179	0.26
1180	0.23
1181	0.26
1182	0.26
1183	0.26
1184	0.23
1185	0.2
1186	0.18
1187	0.15
1188	0.13
1189	0.09
1190	0.09
1191	0.05
1192	0.05
1193	0.05
1194	0.05
1195	0.04
1196	0.04
1197	0.05
1198	0.06
1199	0.07
1200	0.07
1201	0.08
1202	0.12
1203	0.18
1204	0.2
1205	0.22
1206	0.22
1207	0.25
1208	0.3
1209	0.3
1210	0.33
1211	0.34
1212	0.34
1213	0.38
1214	0.37
1215	0.33
1216	0.3
1217	0.3
1218	0.25
1219	0.2
1220	0.18
1221	0.17
1222	0.18
1223	0.2
1224	0.23
1225	0.22
1226	0.22
1227	0.24
1228	0.25
1229	0.28
1230	0.32
1231	0.37
1232	0.39
1233	0.45
1234	0.54
1235	0.56
1236	0.64
1237	0.67
1238	0.71
1239	0.74
1240	0.77
1241	0.79

A0A1V8SUJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer