Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8UM28

Protein Details
Accession A0A1V8UM28    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-112DKPTKSSKTVSKPVKPTKASHydrophilic
310-331AWEKRVTREEGRREKKRGKLAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-68SSDKPAPLKSALKKSKSETSEVKKDVEAGKEVKKSRDGKKK
286-328EGKKRVVPRNKLEGARLRRGVGKEAWEKRVTREEGRREKKRGK
391-415KTKKRSASGSKEAKAPKAKKARKSV
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAQDTRGSKRKSTDSTPVAVKKVKTAPSSDKPAPLKSALKKSKSETSEVKKDVEAGKEVKKSRDGKKKTVAPAVTPAIAKDEVELKTAETKVDKPTKSSKTVSKPVKPTKASKPTPVLEDHEADDDEAAAQLSADRTAELLAGFSSSEDEAEDDDGVPEDAGLALSTLPAIPDVKADLLRLTTNPSSKDPETTPGTIIISRLPHGFFEAQMRAYFVQFGAITHLRLARNKKTGKSKHFAFVEFASSNVADIVAKTMDKYLLFGHILQVKRVNDETVGDGAEFWRGEGKKRVVPRNKLEGARLRRGVGKEAWEKRVTREEGRREKKRGKLAEMGYEFEMPGVKGLEEVKGLEEVKGLEEVKGIETIAEVSEAVPEVEAIKAAPVEDAAVGEKTKKRSASGSKEAKAPKAKKARKSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.64
3 0.67
4 0.65
5 0.62
6 0.6
7 0.53
8 0.51
9 0.53
10 0.55
11 0.49
12 0.51
13 0.55
14 0.58
15 0.66
16 0.62
17 0.63
18 0.6
19 0.6
20 0.58
21 0.54
22 0.54
23 0.54
24 0.61
25 0.62
26 0.63
27 0.65
28 0.66
29 0.69
30 0.64
31 0.63
32 0.62
33 0.62
34 0.66
35 0.63
36 0.59
37 0.5
38 0.52
39 0.49
40 0.43
41 0.39
42 0.34
43 0.39
44 0.44
45 0.47
46 0.46
47 0.5
48 0.55
49 0.6
50 0.66
51 0.66
52 0.68
53 0.74
54 0.78
55 0.77
56 0.78
57 0.7
58 0.63
59 0.62
60 0.56
61 0.48
62 0.4
63 0.32
64 0.27
65 0.25
66 0.22
67 0.16
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.15
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.18
77 0.2
78 0.28
79 0.36
80 0.36
81 0.36
82 0.45
83 0.5
84 0.54
85 0.56
86 0.56
87 0.57
88 0.66
89 0.7
90 0.69
91 0.73
92 0.76
93 0.8
94 0.76
95 0.74
96 0.75
97 0.77
98 0.72
99 0.7
100 0.68
101 0.6
102 0.59
103 0.55
104 0.49
105 0.42
106 0.39
107 0.33
108 0.27
109 0.25
110 0.21
111 0.17
112 0.13
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.23
174 0.23
175 0.26
176 0.22
177 0.25
178 0.26
179 0.25
180 0.24
181 0.2
182 0.2
183 0.17
184 0.17
185 0.14
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.15
211 0.15
212 0.19
213 0.25
214 0.27
215 0.35
216 0.38
217 0.43
218 0.51
219 0.58
220 0.62
221 0.63
222 0.6
223 0.59
224 0.58
225 0.53
226 0.45
227 0.37
228 0.34
229 0.27
230 0.24
231 0.17
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.23
255 0.21
256 0.23
257 0.24
258 0.21
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.13
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.07
270 0.12
271 0.12
272 0.16
273 0.24
274 0.28
275 0.31
276 0.39
277 0.5
278 0.53
279 0.62
280 0.66
281 0.68
282 0.7
283 0.67
284 0.66
285 0.65
286 0.63
287 0.62
288 0.56
289 0.48
290 0.47
291 0.46
292 0.45
293 0.38
294 0.39
295 0.4
296 0.44
297 0.48
298 0.47
299 0.47
300 0.47
301 0.53
302 0.5
303 0.49
304 0.52
305 0.57
306 0.64
307 0.73
308 0.77
309 0.76
310 0.8
311 0.8
312 0.81
313 0.77
314 0.73
315 0.72
316 0.66
317 0.67
318 0.61
319 0.55
320 0.47
321 0.4
322 0.34
323 0.25
324 0.22
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.16
377 0.21
378 0.26
379 0.31
380 0.33
381 0.34
382 0.42
383 0.52
384 0.57
385 0.63
386 0.67
387 0.65
388 0.71
389 0.73
390 0.72
391 0.72
392 0.67
393 0.66
394 0.67
395 0.73