Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8U379

Protein Details
Accession A0A1V8U379    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-38YPDLETSQPRKKRKISPAQCEVIDHydrophilic
101-128DEALSPKKKKTKRDPDEEKRLRRWRKAABasic
179-199KVPSCNCPHARKKHQCKHIAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-95KRRKKVGTLAKSGKAR
105-128SPKKKKTKRDPDEEKRLRRWRKAA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MGIPGTAPLGATGGYPDLETSQPRKKRKISPAQCEVIDLTEATTPRKEAEAAPSHTYTDSYAPASSLYPVDAQGDDAPLKRRKKVGTLAKSGKARMVGDVDEALSPKKKKTKRDPDEEKRLRRWRKAAPGAFLEVKQRALTQRMFALDRQRDISNPDHPIEIIKLAGTTGNVYEIRVDKVPSCNCPHARKKHQCKHIAYCLSRVLRVRPELEYQLAFISSELREIFAAAPPLPSETADESAKDGNRKEVEGECPICYSDFEPTSKESIVYCKASCGNNVHKECMKQWAASNRGGAVTCPLCRSPWQADEGENLRTLATGGTVSAEGYVNLASQLGLSGRRDYSTYHSQWVRNEARRGNIAWDEDGVMDHEYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.1
5 0.12
6 0.17
7 0.23
8 0.32
9 0.4
10 0.49
11 0.58
12 0.65
13 0.73
14 0.79
15 0.84
16 0.85
17 0.86
18 0.87
19 0.84
20 0.75
21 0.67
22 0.56
23 0.46
24 0.37
25 0.26
26 0.18
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.17
36 0.25
37 0.32
38 0.35
39 0.39
40 0.39
41 0.39
42 0.37
43 0.36
44 0.28
45 0.22
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.22
65 0.28
66 0.32
67 0.35
68 0.4
69 0.42
70 0.48
71 0.56
72 0.59
73 0.61
74 0.67
75 0.7
76 0.7
77 0.7
78 0.63
79 0.55
80 0.48
81 0.39
82 0.31
83 0.27
84 0.2
85 0.18
86 0.18
87 0.16
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.16
92 0.16
93 0.21
94 0.29
95 0.34
96 0.44
97 0.55
98 0.65
99 0.7
100 0.79
101 0.85
102 0.86
103 0.92
104 0.92
105 0.88
106 0.87
107 0.87
108 0.84
109 0.81
110 0.78
111 0.75
112 0.76
113 0.79
114 0.73
115 0.67
116 0.61
117 0.58
118 0.52
119 0.44
120 0.37
121 0.28
122 0.24
123 0.2
124 0.19
125 0.17
126 0.2
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.21
132 0.22
133 0.29
134 0.27
135 0.27
136 0.28
137 0.27
138 0.25
139 0.27
140 0.29
141 0.25
142 0.26
143 0.25
144 0.22
145 0.22
146 0.22
147 0.19
148 0.16
149 0.1
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.17
167 0.19
168 0.21
169 0.24
170 0.29
171 0.33
172 0.4
173 0.48
174 0.51
175 0.61
176 0.67
177 0.75
178 0.77
179 0.81
180 0.82
181 0.8
182 0.77
183 0.76
184 0.73
185 0.63
186 0.57
187 0.54
188 0.46
189 0.42
190 0.36
191 0.3
192 0.26
193 0.28
194 0.26
195 0.23
196 0.25
197 0.24
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.11
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.16
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.21
232 0.22
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.25
237 0.28
238 0.29
239 0.23
240 0.23
241 0.23
242 0.2
243 0.18
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.17
249 0.18
250 0.21
251 0.2
252 0.2
253 0.16
254 0.18
255 0.22
256 0.24
257 0.22
258 0.22
259 0.26
260 0.26
261 0.29
262 0.31
263 0.35
264 0.42
265 0.44
266 0.46
267 0.45
268 0.46
269 0.44
270 0.46
271 0.4
272 0.32
273 0.35
274 0.4
275 0.41
276 0.41
277 0.41
278 0.33
279 0.33
280 0.31
281 0.25
282 0.22
283 0.2
284 0.19
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.22
289 0.28
290 0.28
291 0.29
292 0.32
293 0.31
294 0.32
295 0.37
296 0.37
297 0.33
298 0.28
299 0.24
300 0.2
301 0.18
302 0.17
303 0.1
304 0.08
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.1
323 0.12
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.2
329 0.26
330 0.33
331 0.34
332 0.39
333 0.44
334 0.47
335 0.5
336 0.57
337 0.59
338 0.58
339 0.63
340 0.59
341 0.6
342 0.6
343 0.58
344 0.54
345 0.5
346 0.44
347 0.37
348 0.34
349 0.29
350 0.25
351 0.24
352 0.19