Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8V7N8

Protein Details
Accession A0A1V8V7N8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-321EEQPYRKTARHRSRSPFRRPVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-195RKRRYDDRGRGSGGRG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDGDMDIDMDIDMEDPDLARLRAQAEAINAQHLAVQQVGDTDSMNGVQQAPEEGEVDPDGIVRNKIHLRGLDNLTTARIEAAVREYCDMTLYGKLQWIDDTSANLVFDTDDAAASAMAALAEVEESDALALRAVKAFNELPETQLQMRYATESDVKVKGAKDRSRFYLMNPEYDPENRIRKRRYDDRGRGSGGRGGYNNKRPRMDRGYSDVDERLARRGSGQGTPFNEDLYDDAPSPRPAPLRDSIPRRDSYASSEGHGRTLRQYEPTLDLLAGKSNGRLQRDRSASPARDGDGRFGFSEEQPYRKTARHRSRSPFRRPVSRDQDNRNTLEQRRKELFPSRPSSALTNGTAKPDLFDRTAATNSAKELFPDKAQHKRQDARVVGHNELATAIGKYHLDGVDESPHTYDQAGPDRASGRAEKPKAGRDLFARINGGSGNGDGRLRQGDQVAVEGFSFKGAGAEKADSDFSIRGASAAKGSGLARELFPVKTGVQVNGKPDLFEGRLGGRTNGRRRAEDLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.08
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.2
18 0.21
19 0.2
20 0.17
21 0.12
22 0.11
23 0.09
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.11
47 0.11
48 0.14
49 0.13
50 0.19
51 0.22
52 0.25
53 0.29
54 0.3
55 0.32
56 0.37
57 0.42
58 0.38
59 0.36
60 0.34
61 0.31
62 0.27
63 0.24
64 0.16
65 0.13
66 0.1
67 0.09
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.17
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.13
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.18
126 0.17
127 0.18
128 0.19
129 0.22
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.25
146 0.31
147 0.36
148 0.4
149 0.43
150 0.47
151 0.51
152 0.5
153 0.46
154 0.48
155 0.42
156 0.41
157 0.37
158 0.33
159 0.28
160 0.29
161 0.29
162 0.23
163 0.32
164 0.32
165 0.39
166 0.43
167 0.48
168 0.56
169 0.64
170 0.69
171 0.7
172 0.75
173 0.75
174 0.76
175 0.72
176 0.65
177 0.57
178 0.5
179 0.4
180 0.33
181 0.26
182 0.26
183 0.29
184 0.37
185 0.42
186 0.44
187 0.46
188 0.46
189 0.52
190 0.55
191 0.52
192 0.46
193 0.46
194 0.48
195 0.45
196 0.45
197 0.37
198 0.3
199 0.28
200 0.25
201 0.22
202 0.15
203 0.14
204 0.13
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.21
209 0.22
210 0.23
211 0.27
212 0.26
213 0.23
214 0.2
215 0.16
216 0.15
217 0.11
218 0.1
219 0.07
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.14
226 0.13
227 0.17
228 0.19
229 0.24
230 0.3
231 0.35
232 0.39
233 0.41
234 0.41
235 0.4
236 0.39
237 0.33
238 0.32
239 0.31
240 0.26
241 0.22
242 0.26
243 0.23
244 0.24
245 0.24
246 0.18
247 0.16
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.17
252 0.16
253 0.19
254 0.19
255 0.17
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.08
262 0.07
263 0.11
264 0.14
265 0.17
266 0.2
267 0.22
268 0.29
269 0.33
270 0.34
271 0.35
272 0.4
273 0.38
274 0.38
275 0.36
276 0.29
277 0.3
278 0.29
279 0.27
280 0.21
281 0.21
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.14
286 0.22
287 0.19
288 0.21
289 0.21
290 0.23
291 0.25
292 0.28
293 0.35
294 0.38
295 0.47
296 0.54
297 0.62
298 0.69
299 0.77
300 0.84
301 0.86
302 0.85
303 0.79
304 0.79
305 0.76
306 0.77
307 0.75
308 0.75
309 0.72
310 0.7
311 0.75
312 0.69
313 0.67
314 0.61
315 0.57
316 0.53
317 0.55
318 0.5
319 0.48
320 0.48
321 0.46
322 0.47
323 0.5
324 0.53
325 0.51
326 0.54
327 0.5
328 0.47
329 0.47
330 0.44
331 0.38
332 0.34
333 0.28
334 0.27
335 0.25
336 0.26
337 0.25
338 0.23
339 0.2
340 0.19
341 0.2
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.18
347 0.19
348 0.18
349 0.16
350 0.16
351 0.18
352 0.16
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.18
357 0.24
358 0.28
359 0.35
360 0.43
361 0.49
362 0.55
363 0.6
364 0.63
365 0.66
366 0.65
367 0.6
368 0.6
369 0.58
370 0.51
371 0.47
372 0.4
373 0.3
374 0.26
375 0.22
376 0.14
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.11
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.18
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.16
395 0.15
396 0.22
397 0.24
398 0.23
399 0.25
400 0.26
401 0.27
402 0.28
403 0.26
404 0.25
405 0.32
406 0.35
407 0.39
408 0.42
409 0.48
410 0.53
411 0.52
412 0.49
413 0.42
414 0.48
415 0.45
416 0.44
417 0.39
418 0.31
419 0.3
420 0.26
421 0.24
422 0.16
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.11
427 0.1
428 0.12
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.16
433 0.17
434 0.17
435 0.19
436 0.18
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.07
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.17
451 0.18
452 0.15
453 0.17
454 0.15
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.13
465 0.13
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.18
471 0.2
472 0.18
473 0.19
474 0.19
475 0.17
476 0.22
477 0.24
478 0.25
479 0.3
480 0.33
481 0.36
482 0.41
483 0.41
484 0.35
485 0.34
486 0.35
487 0.29
488 0.27
489 0.26
490 0.22
491 0.26
492 0.28
493 0.3
494 0.32
495 0.41
496 0.49
497 0.56
498 0.57
499 0.55