Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TWF8

Protein Details
Accession A0A1V8TWF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MAVGKNKRLSKGKKGLKKRTDPFAKKDWFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-21KNKRLSKGKKGLKKRTD
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002637  Ham1p-like  
IPR027502  ITPase  
IPR029001  ITPase-like_fam  
IPR027500  Ribosomal_S1/3_euk  
IPR001593  Ribosomal_S3Ae  
IPR018281  Ribosomal_S3Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035870  F:dITP diphosphatase activity  
GO:0036220  F:ITP diphosphatase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0036222  F:XTP diphosphatase activity  
GO:0009204  P:deoxyribonucleoside triphosphate catabolic process  
GO:0009117  P:nucleotide metabolic process  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01725  Ham1p_like  
PF01015  Ribosomal_S3Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01191  RIBOSOMAL_S3AE  
CDD cd00515  HAM1  
Amino Acid Sequences MAVGKNKRLSKGKKGLKKRTDPFAKKDWFSVKAPSTFAVRDVGKTLVNRTTGLKNANDSLKGRIFEASLADLQKDEDHSFRKIKLRVDEVQGKNCLTNFHGLDITSDKLRSLVRKWQSLIEANVVVKTTDDYLLRLFCIAFTQRRPNQIKKATYARASQIRAIRKKMKDIMQKEAQSCTLSQLVTKLIPEVIGREIQKSTQGIYPLQHVHVRKVKLLKAPKFDLGNLLSLHGESDTNEAGQKVEREFKETVLEEVPCLSKNSSLAASMAPKTLNFITGNANKLAEVQAILTSTPVQLKSQALDVVEIQGTIEEISRDKARRAVDEVKGPVLVEDTCLCFDAFDELPGPYVKWFLKALGVQQFHKLLAGFEDKSAQAGKIVEARGPTSFGWDACFEYEGQTYAEMPKAEKNQISHRGKALAKLVEWLSKEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.88
3 0.89
4 0.92
5 0.88
6 0.88
7 0.89
8 0.87
9 0.83
10 0.82
11 0.8
12 0.71
13 0.71
14 0.67
15 0.61
16 0.55
17 0.57
18 0.53
19 0.49
20 0.49
21 0.43
22 0.4
23 0.36
24 0.34
25 0.32
26 0.26
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.24
31 0.25
32 0.28
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.31
38 0.32
39 0.35
40 0.33
41 0.31
42 0.35
43 0.38
44 0.38
45 0.35
46 0.37
47 0.37
48 0.35
49 0.33
50 0.29
51 0.26
52 0.22
53 0.23
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.16
63 0.18
64 0.2
65 0.25
66 0.29
67 0.33
68 0.39
69 0.41
70 0.46
71 0.48
72 0.52
73 0.52
74 0.56
75 0.62
76 0.58
77 0.6
78 0.56
79 0.5
80 0.45
81 0.4
82 0.34
83 0.25
84 0.27
85 0.21
86 0.2
87 0.21
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.14
96 0.17
97 0.19
98 0.21
99 0.28
100 0.33
101 0.38
102 0.4
103 0.42
104 0.44
105 0.44
106 0.42
107 0.36
108 0.32
109 0.26
110 0.25
111 0.22
112 0.17
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.2
129 0.29
130 0.32
131 0.42
132 0.49
133 0.53
134 0.59
135 0.64
136 0.63
137 0.6
138 0.65
139 0.6
140 0.57
141 0.53
142 0.49
143 0.47
144 0.45
145 0.44
146 0.41
147 0.45
148 0.46
149 0.5
150 0.53
151 0.49
152 0.54
153 0.56
154 0.58
155 0.59
156 0.58
157 0.59
158 0.58
159 0.6
160 0.54
161 0.49
162 0.42
163 0.34
164 0.3
165 0.24
166 0.18
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.2
195 0.18
196 0.22
197 0.27
198 0.28
199 0.27
200 0.31
201 0.33
202 0.36
203 0.44
204 0.44
205 0.44
206 0.45
207 0.45
208 0.42
209 0.38
210 0.35
211 0.27
212 0.25
213 0.19
214 0.17
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.16
231 0.16
232 0.2
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.23
237 0.23
238 0.19
239 0.19
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.13
263 0.18
264 0.21
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.12
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.15
287 0.15
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.09
302 0.14
303 0.15
304 0.17
305 0.21
306 0.23
307 0.26
308 0.32
309 0.37
310 0.36
311 0.42
312 0.43
313 0.39
314 0.37
315 0.34
316 0.27
317 0.21
318 0.16
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.09
336 0.14
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.15
341 0.2
342 0.21
343 0.26
344 0.3
345 0.33
346 0.32
347 0.35
348 0.36
349 0.31
350 0.31
351 0.25
352 0.17
353 0.18
354 0.22
355 0.18
356 0.18
357 0.21
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.17
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.2
371 0.22
372 0.2
373 0.2
374 0.21
375 0.19
376 0.21
377 0.2
378 0.21
379 0.2
380 0.21
381 0.15
382 0.16
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.18
390 0.17
391 0.17
392 0.23
393 0.28
394 0.34
395 0.36
396 0.39
397 0.45
398 0.55
399 0.59
400 0.57
401 0.56
402 0.57
403 0.55
404 0.56
405 0.54
406 0.48
407 0.42
408 0.43
409 0.41
410 0.39