Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TXG5

Protein Details
Accession A0A1V8TXG5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-47DSILDEPKPRKRLRRTPDEVKQQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-33K
542-584VAAGRGGRGGVRGGQPGRGGAQRGGPAQRGGAQQRGRGAPATR
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 11.5, nucl 5.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEDSLTSAFERLRVGADSIESIDSILDEPKPRKRLRRTPDEVKQQLEADFLTPSTSFSPQWLNKLQQRWDAPTNYSELFSLAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFYPFAPGGLDGVEATAAVEDEFLAAREVNGGRKAGKLDRVIDFAAEGGLLSLPPGFERGLSVPEKVEKADDEAAEEVERVLEEATEERNETDGVDGADQANDDGDDNTDDAGGDEEEVDALLPIEFPALAPHAPLLSARNKHGGREWAHMVDVNRDITNFKDLVPDMARTWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLEFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDSERGVVWEEVIIMLPEHVTLIMLSATVPNTFEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLAHYLWADKRMIKIVDENKQFLEKGWKDANDALSGRDKIIAAEAKAKEKEDAAVAAGRGGRGGVRGGQPGRGGAQRGGPAQRGGAQQRGRGAPATRGQGNIARTGRGGGRTSAAQDKTLWVHLVQHLKKEELLPCCIFVFSKKRCEENADALSNLDFSNAAEKSATHMILEKSLARLKTDDRDLPQIRRIRELLSRGIAVHHGGLLPIVKECVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKFDNKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVLLVSAGAEEAPPAGRLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQIKLSEADLAKVKREPCGTCDKDIEACHEASVMFEQYTQDLHLAMLGTPVGRRMFQPKRIIVFKNQSGVRTVGVLLREGASRGASAGVQTLEVAYKKKAKRQDADFLPFLPRFRRHFTALPQTDAEMDLRLTTVPVNDIEALTANHLQMDVNAIMRKDPTEWAKAKADLLQLCSSWTSSTWNELDHLKWLKAMTVRSLLDERHPPLMSDQNLQLLPDYQQRISVLKDLGFIDDNSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSSFVFQERTDSSPNLTPALEKGIETIIKISENVNRYQTLHQVILSSDDSNGFVSRPRFGLVEVVYEWARGMPFSRITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCRECKNAARIIGDPTLFAKMQSCQELIKRDICATASL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.19
15 0.25
16 0.34
17 0.43
18 0.51
19 0.6
20 0.69
21 0.76
22 0.8
23 0.85
24 0.86
25 0.87
26 0.9
27 0.91
28 0.85
29 0.78
30 0.71
31 0.62
32 0.53
33 0.44
34 0.35
35 0.25
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.27
46 0.28
47 0.36
48 0.41
49 0.46
50 0.5
51 0.58
52 0.61
53 0.6
54 0.62
55 0.62
56 0.63
57 0.59
58 0.55
59 0.49
60 0.48
61 0.4
62 0.36
63 0.29
64 0.22
65 0.19
66 0.16
67 0.18
68 0.15
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.24
73 0.27
74 0.29
75 0.31
76 0.36
77 0.37
78 0.38
79 0.39
80 0.39
81 0.39
82 0.39
83 0.35
84 0.34
85 0.3
86 0.29
87 0.31
88 0.27
89 0.24
90 0.23
91 0.21
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.21
107 0.26
108 0.29
109 0.35
110 0.4
111 0.44
112 0.51
113 0.59
114 0.6
115 0.59
116 0.59
117 0.58
118 0.54
119 0.5
120 0.46
121 0.37
122 0.32
123 0.28
124 0.26
125 0.19
126 0.15
127 0.17
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.22
158 0.26
159 0.27
160 0.33
161 0.33
162 0.35
163 0.37
164 0.39
165 0.37
166 0.33
167 0.28
168 0.21
169 0.16
170 0.11
171 0.08
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.11
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.23
189 0.24
190 0.21
191 0.22
192 0.17
193 0.21
194 0.24
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.18
200 0.17
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.12
261 0.17
262 0.21
263 0.23
264 0.31
265 0.32
266 0.34
267 0.38
268 0.42
269 0.38
270 0.41
271 0.43
272 0.35
273 0.35
274 0.36
275 0.31
276 0.28
277 0.27
278 0.23
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.2
284 0.16
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.2
289 0.21
290 0.22
291 0.19
292 0.25
293 0.25
294 0.22
295 0.24
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.2
300 0.18
301 0.21
302 0.22
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.2
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.1
345 0.11
346 0.17
347 0.19
348 0.21
349 0.23
350 0.26
351 0.26
352 0.3
353 0.37
354 0.38
355 0.46
356 0.47
357 0.51
358 0.52
359 0.53
360 0.58
361 0.49
362 0.43
363 0.4
364 0.4
365 0.33
366 0.3
367 0.3
368 0.19
369 0.18
370 0.16
371 0.09
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.1
454 0.1
455 0.15
456 0.19
457 0.24
458 0.27
459 0.31
460 0.36
461 0.37
462 0.42
463 0.39
464 0.41
465 0.45
466 0.52
467 0.51
468 0.51
469 0.49
470 0.45
471 0.45
472 0.38
473 0.31
474 0.27
475 0.32
476 0.29
477 0.32
478 0.32
479 0.31
480 0.32
481 0.33
482 0.28
483 0.21
484 0.19
485 0.19
486 0.18
487 0.17
488 0.22
489 0.26
490 0.33
491 0.34
492 0.34
493 0.31
494 0.32
495 0.31
496 0.25
497 0.29
498 0.22
499 0.25
500 0.27
501 0.27
502 0.28
503 0.3
504 0.31
505 0.24
506 0.23
507 0.19
508 0.2
509 0.2
510 0.18
511 0.16
512 0.15
513 0.12
514 0.15
515 0.15
516 0.11
517 0.18
518 0.19
519 0.22
520 0.23
521 0.23
522 0.2
523 0.19
524 0.19
525 0.13
526 0.12
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.05
537 0.06
538 0.07
539 0.08
540 0.12
541 0.13
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.16
546 0.14
547 0.14
548 0.12
549 0.14
550 0.14
551 0.16
552 0.18
553 0.17
554 0.15
555 0.15
556 0.18
557 0.18
558 0.18
559 0.23
560 0.23
561 0.24
562 0.27
563 0.27
564 0.24
565 0.23
566 0.22
567 0.2
568 0.22
569 0.24
570 0.21
571 0.2
572 0.21
573 0.22
574 0.22
575 0.24
576 0.2
577 0.18
578 0.17
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.17
583 0.11
584 0.12
585 0.12
586 0.14
587 0.18
588 0.17
589 0.15
590 0.15
591 0.16
592 0.15
593 0.16
594 0.14
595 0.09
596 0.11
597 0.14
598 0.22
599 0.22
600 0.25
601 0.25
602 0.25
603 0.26
604 0.26
605 0.27
606 0.21
607 0.24
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.19
612 0.16
613 0.15
614 0.21
615 0.21
616 0.29
617 0.31
618 0.33
619 0.34
620 0.4
621 0.39
622 0.38
623 0.4
624 0.32
625 0.3
626 0.28
627 0.26
628 0.21
629 0.18
630 0.1
631 0.05
632 0.04
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.08
638 0.1
639 0.13
640 0.13
641 0.09
642 0.11
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.11
647 0.11
648 0.14
649 0.14
650 0.12
651 0.13
652 0.14
653 0.18
654 0.21
655 0.22
656 0.21
657 0.3
658 0.32
659 0.33
660 0.38
661 0.38
662 0.35
663 0.36
664 0.35
665 0.28
666 0.3
667 0.3
668 0.27
669 0.23
670 0.23
671 0.2
672 0.19
673 0.17
674 0.13
675 0.1
676 0.08
677 0.06
678 0.05
679 0.06
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.09
696 0.08
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.08
701 0.08
702 0.1
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.08
707 0.07
708 0.06
709 0.07
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.1
719 0.13
720 0.17
721 0.19
722 0.2
723 0.22
724 0.23
725 0.27
726 0.34
727 0.32
728 0.34
729 0.35
730 0.34
731 0.36
732 0.35
733 0.32
734 0.24
735 0.23
736 0.18
737 0.16
738 0.16
739 0.11
740 0.11
741 0.09
742 0.08
743 0.09
744 0.11
745 0.11
746 0.12
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.12
752 0.1
753 0.09
754 0.08
755 0.07
756 0.06
757 0.05
758 0.04
759 0.03
760 0.03
761 0.02
762 0.02
763 0.02
764 0.03
765 0.03
766 0.03
767 0.04
768 0.05
769 0.05
770 0.07
771 0.07
772 0.09
773 0.13
774 0.13
775 0.14
776 0.18
777 0.19
778 0.19
779 0.2
780 0.2
781 0.2
782 0.22
783 0.21
784 0.2
785 0.25
786 0.3
787 0.32
788 0.38
789 0.36
790 0.39
791 0.39
792 0.37
793 0.32
794 0.26
795 0.22
796 0.15
797 0.14
798 0.09
799 0.08
800 0.06
801 0.06
802 0.07
803 0.07
804 0.07
805 0.09
806 0.11
807 0.13
808 0.14
809 0.15
810 0.15
811 0.16
812 0.18
813 0.17
814 0.2
815 0.2
816 0.21
817 0.22
818 0.2
819 0.19
820 0.18
821 0.17
822 0.15
823 0.15
824 0.18
825 0.19
826 0.19
827 0.2
828 0.22
829 0.23
830 0.21
831 0.19
832 0.21
833 0.18
834 0.19
835 0.24
836 0.21
837 0.21
838 0.24
839 0.24
840 0.23
841 0.27
842 0.26
843 0.25
844 0.36
845 0.37
846 0.36
847 0.38
848 0.35
849 0.35
850 0.34
851 0.35
852 0.27
853 0.24
854 0.21
855 0.19
856 0.17
857 0.13
858 0.14
859 0.1
860 0.07
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.09
865 0.09
866 0.08
867 0.07
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.1
880 0.19
881 0.27
882 0.34
883 0.42
884 0.45
885 0.5
886 0.56
887 0.57
888 0.56
889 0.57
890 0.53
891 0.52
892 0.49
893 0.44
894 0.4
895 0.38
896 0.3
897 0.23
898 0.2
899 0.15
900 0.14
901 0.13
902 0.11
903 0.11
904 0.11
905 0.11
906 0.1
907 0.08
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.07
912 0.07
913 0.08
914 0.07
915 0.07
916 0.07
917 0.07
918 0.08
919 0.1
920 0.11
921 0.13
922 0.21
923 0.24
924 0.31
925 0.4
926 0.47
927 0.54
928 0.59
929 0.66
930 0.66
931 0.69
932 0.64
933 0.57
934 0.53
935 0.46
936 0.41
937 0.36
938 0.34
939 0.33
940 0.38
941 0.41
942 0.42
943 0.46
944 0.52
945 0.57
946 0.53
947 0.52
948 0.45
949 0.41
950 0.37
951 0.32
952 0.25
953 0.15
954 0.12
955 0.09
956 0.08
957 0.08
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.08
962 0.08
963 0.1
964 0.1
965 0.1
966 0.1
967 0.11
968 0.1
969 0.11
970 0.12
971 0.1
972 0.1
973 0.1
974 0.1
975 0.08
976 0.12
977 0.1
978 0.11
979 0.13
980 0.13
981 0.14
982 0.15
983 0.16
984 0.13
985 0.18
986 0.2
987 0.27
988 0.29
989 0.33
990 0.37
991 0.37
992 0.37
993 0.36
994 0.38
995 0.31
996 0.33
997 0.3
998 0.26
999 0.26
1000 0.25
1001 0.21
1002 0.16
1003 0.14
1004 0.15
1005 0.14
1006 0.19
1007 0.19
1008 0.19
1009 0.2
1010 0.21
1011 0.22
1012 0.25
1013 0.27
1014 0.22
1015 0.24
1016 0.23
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.28
1020 0.25
1021 0.28
1022 0.28
1023 0.29
1024 0.32
1025 0.29
1026 0.3
1027 0.35
1028 0.33
1029 0.33
1030 0.33
1031 0.3
1032 0.31
1033 0.38
1034 0.35
1035 0.32
1036 0.31
1037 0.3
1038 0.3
1039 0.29
1040 0.26
1041 0.2
1042 0.2
1043 0.23
1044 0.25
1045 0.2
1046 0.23
1047 0.24
1048 0.25
1049 0.26
1050 0.28
1051 0.23
1052 0.21
1053 0.24
1054 0.22
1055 0.23
1056 0.22
1057 0.21
1058 0.19
1059 0.21
1060 0.21
1061 0.2
1062 0.2
1063 0.18
1064 0.18
1065 0.2
1066 0.21
1067 0.21
1068 0.21
1069 0.24
1070 0.24
1071 0.25
1072 0.27
1073 0.27
1074 0.25
1075 0.22
1076 0.21
1077 0.17
1078 0.17
1079 0.16
1080 0.13
1081 0.11
1082 0.08
1083 0.07
1084 0.07
1085 0.07
1086 0.06
1087 0.05
1088 0.04
1089 0.04
1090 0.05
1091 0.04
1092 0.04
1093 0.05
1094 0.06
1095 0.06
1096 0.06
1097 0.06
1098 0.06
1099 0.06
1100 0.06
1101 0.06
1102 0.05
1103 0.05
1104 0.05
1105 0.05
1106 0.06
1107 0.07
1108 0.07
1109 0.1
1110 0.13
1111 0.17
1112 0.21
1113 0.22
1114 0.25
1115 0.29
1116 0.31
1117 0.29
1118 0.27
1119 0.24
1120 0.21
1121 0.26
1122 0.23
1123 0.17
1124 0.17
1125 0.2
1126 0.2
1127 0.2
1128 0.2
1129 0.15
1130 0.15
1131 0.16
1132 0.17
1133 0.19
1134 0.22
1135 0.25
1136 0.27
1137 0.27
1138 0.29
1139 0.32
1140 0.36
1141 0.35
1142 0.33
1143 0.3
1144 0.28
1145 0.26
1146 0.27
1147 0.26
1148 0.2
1149 0.16
1150 0.15
1151 0.16
1152 0.16
1153 0.16
1154 0.12
1155 0.15
1156 0.17
1157 0.19
1158 0.19
1159 0.2
1160 0.19
1161 0.2
1162 0.26
1163 0.22
1164 0.24
1165 0.22
1166 0.23
1167 0.22
1168 0.21
1169 0.2
1170 0.15
1171 0.14
1172 0.11
1173 0.12
1174 0.14
1175 0.19
1176 0.21
1177 0.25
1178 0.25
1179 0.28
1180 0.31
1181 0.3
1182 0.27
1183 0.23
1184 0.2
1185 0.16
1186 0.17
1187 0.13
1188 0.11
1189 0.12
1190 0.1
1191 0.09
1192 0.1
1193 0.1
1194 0.11
1195 0.16
1196 0.17
1197 0.19
1198 0.27
1199 0.32
1200 0.39
1201 0.43
1202 0.44
1203 0.42
1204 0.46
1205 0.5
1206 0.5
1207 0.49
1208 0.45
1209 0.43
1210 0.45
1211 0.48
1212 0.42
1213 0.34
1214 0.29
1215 0.28
1216 0.25
1217 0.23
1218 0.2
1219 0.19
1220 0.24
1221 0.27
1222 0.27
1223 0.27
1224 0.33
1225 0.39
1226 0.41
1227 0.42
1228 0.39
1229 0.36
1230 0.38