Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0QEB9

Protein Details
Accession A0A1X0QEB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
321-349EMQLKKKNAPAPRTIKKRKKSDFETVEDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-340KKKNAPAPRTIKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
Amino Acid Sequences MTHCFNCNSTELETDQAKGIIYCEVCGMLQEENLIVNTLQYNTEGSKPIKTGQIINVENVNVGTQFVDSSYYIKNTIRNICNKLSLDNSHIEIAFRWYKMSLLHNLTKGKSILYTLSACVYISCRQANTPHLLMDFSDVLRIDVFKIGKIFMKMRKLYKIEIKLTDPSMYMHRFITQLKLKHPEIFSIAVRLLNRIKKDWIMEGRRPNNACGAAILLASRICGEPRDIKDVAKTVHSSVATINKRLKEISETQTAHLNIKEFKESWIDVEENPPVNKISKFVKEESEEINEFDSDEYILNENEIQDKTNVWDLMYNEYVKEMQLKKKNAPAPRTIKKRKKSDFETVEDALKSLDKKVTSKINLNALNNLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.21
4 0.19
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.13
30 0.16
31 0.2
32 0.21
33 0.24
34 0.25
35 0.27
36 0.31
37 0.31
38 0.32
39 0.33
40 0.41
41 0.38
42 0.38
43 0.38
44 0.32
45 0.3
46 0.26
47 0.2
48 0.11
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.16
60 0.17
61 0.21
62 0.25
63 0.34
64 0.38
65 0.44
66 0.48
67 0.48
68 0.53
69 0.5
70 0.46
71 0.42
72 0.38
73 0.35
74 0.32
75 0.3
76 0.25
77 0.25
78 0.22
79 0.18
80 0.21
81 0.21
82 0.18
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.23
88 0.24
89 0.27
90 0.31
91 0.35
92 0.38
93 0.38
94 0.38
95 0.34
96 0.28
97 0.22
98 0.2
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.17
113 0.2
114 0.24
115 0.26
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.15
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.19
138 0.21
139 0.29
140 0.32
141 0.35
142 0.41
143 0.42
144 0.43
145 0.47
146 0.48
147 0.45
148 0.43
149 0.42
150 0.38
151 0.37
152 0.34
153 0.26
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.26
166 0.32
167 0.31
168 0.35
169 0.35
170 0.29
171 0.26
172 0.26
173 0.22
174 0.18
175 0.17
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.22
186 0.25
187 0.29
188 0.32
189 0.37
190 0.44
191 0.47
192 0.5
193 0.5
194 0.45
195 0.41
196 0.35
197 0.29
198 0.2
199 0.17
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.14
212 0.17
213 0.23
214 0.23
215 0.23
216 0.25
217 0.28
218 0.27
219 0.23
220 0.22
221 0.17
222 0.21
223 0.2
224 0.18
225 0.17
226 0.25
227 0.24
228 0.27
229 0.31
230 0.28
231 0.3
232 0.3
233 0.29
234 0.25
235 0.29
236 0.3
237 0.35
238 0.34
239 0.34
240 0.39
241 0.39
242 0.35
243 0.3
244 0.28
245 0.21
246 0.22
247 0.24
248 0.19
249 0.2
250 0.22
251 0.21
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.18
256 0.2
257 0.23
258 0.22
259 0.22
260 0.21
261 0.19
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.22
266 0.27
267 0.31
268 0.32
269 0.37
270 0.38
271 0.4
272 0.41
273 0.4
274 0.33
275 0.3
276 0.29
277 0.23
278 0.2
279 0.17
280 0.14
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.15
295 0.2
296 0.2
297 0.16
298 0.19
299 0.19
300 0.24
301 0.26
302 0.25
303 0.19
304 0.2
305 0.2
306 0.17
307 0.24
308 0.24
309 0.31
310 0.39
311 0.45
312 0.49
313 0.57
314 0.64
315 0.64
316 0.65
317 0.66
318 0.67
319 0.72
320 0.78
321 0.8
322 0.84
323 0.85
324 0.9
325 0.89
326 0.9
327 0.87
328 0.87
329 0.84
330 0.81
331 0.78
332 0.69
333 0.63
334 0.52
335 0.44
336 0.34
337 0.29
338 0.23
339 0.2
340 0.23
341 0.22
342 0.24
343 0.31
344 0.4
345 0.43
346 0.5
347 0.53
348 0.57
349 0.61
350 0.61
351 0.62