Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YGA4

Protein Details
Accession I4YGA4    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MTDVVSFKKPSKKGRPAALRQKSPPKDNSREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-57KKPSKKGRPAALRQKSPPKDNSRESHEKSSVATVKDRRSAVKGVGKKRQR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG wse:WALSEDRAFT_59720  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MTDVVSFKKPSKKGRPAALRQKSPPKDNSRESHEKSSVATVKDRRSAVKGVGKKRQRETSKGEDSDNDQSGGGVVDVAWSATNSNDNTMNRNTAVVDLDAETIDGPNLKKYKEGDEVDAQDLEDDGMYKGLNSYTSHLKKKPDSSMSDKFKAGPVRAPTNIRQITITDFQPDVCKDYKETGWCGYGDTCKFLHDRSDYMAGWQLDQAWNKMQAQKSGAAAFEDDSDDSEDEDLPFACLITREPFVDPVVTKCGHYFEKKAALKRYQKTPKCYACGTPTGGIFNKPKHLIKKLQERAAKEEAEAQEADSDDNGIEGLEERNETSEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.85
3 0.86
4 0.9
5 0.9
6 0.87
7 0.86
8 0.88
9 0.85
10 0.83
11 0.82
12 0.8
13 0.79
14 0.79
15 0.77
16 0.76
17 0.78
18 0.76
19 0.76
20 0.69
21 0.6
22 0.53
23 0.55
24 0.51
25 0.43
26 0.45
27 0.42
28 0.46
29 0.51
30 0.51
31 0.46
32 0.45
33 0.46
34 0.46
35 0.48
36 0.5
37 0.52
38 0.6
39 0.65
40 0.68
41 0.73
42 0.75
43 0.73
44 0.72
45 0.71
46 0.72
47 0.74
48 0.68
49 0.62
50 0.54
51 0.53
52 0.52
53 0.45
54 0.35
55 0.25
56 0.22
57 0.21
58 0.18
59 0.13
60 0.06
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.09
70 0.09
71 0.11
72 0.16
73 0.17
74 0.21
75 0.23
76 0.25
77 0.21
78 0.22
79 0.2
80 0.16
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.11
94 0.14
95 0.14
96 0.17
97 0.19
98 0.25
99 0.31
100 0.33
101 0.32
102 0.35
103 0.37
104 0.36
105 0.34
106 0.28
107 0.19
108 0.17
109 0.13
110 0.08
111 0.06
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.19
122 0.24
123 0.29
124 0.33
125 0.37
126 0.41
127 0.46
128 0.5
129 0.47
130 0.47
131 0.5
132 0.57
133 0.58
134 0.56
135 0.51
136 0.44
137 0.42
138 0.4
139 0.32
140 0.28
141 0.25
142 0.27
143 0.29
144 0.31
145 0.3
146 0.36
147 0.36
148 0.31
149 0.28
150 0.24
151 0.25
152 0.25
153 0.23
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.16
164 0.18
165 0.18
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.16
172 0.18
173 0.16
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.19
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.22
184 0.2
185 0.21
186 0.25
187 0.2
188 0.19
189 0.18
190 0.16
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.22
198 0.23
199 0.22
200 0.24
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.22
205 0.17
206 0.16
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.2
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.21
240 0.23
241 0.26
242 0.27
243 0.27
244 0.37
245 0.42
246 0.48
247 0.52
248 0.57
249 0.63
250 0.66
251 0.72
252 0.73
253 0.75
254 0.76
255 0.78
256 0.77
257 0.73
258 0.7
259 0.65
260 0.6
261 0.58
262 0.54
263 0.46
264 0.39
265 0.38
266 0.36
267 0.36
268 0.35
269 0.33
270 0.37
271 0.4
272 0.45
273 0.48
274 0.54
275 0.58
276 0.62
277 0.7
278 0.72
279 0.75
280 0.74
281 0.71
282 0.71
283 0.67
284 0.59
285 0.48
286 0.47
287 0.39
288 0.37
289 0.33
290 0.26
291 0.22
292 0.22
293 0.21
294 0.14
295 0.13
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1