Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6YHW2

Protein Details
Accession A0A1V6YHW2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-301TDFARPIREGRKRRRRHPSRPTVPQAPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-293PIREGRKRRRRHPSR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRAYSPETSPEHELKKGIPLNGQRPALLSLNVPVSPPRKRSSIKWAKDGDGGDTIPLDASQPNTSSSLAAIEAGQVEVTDHLSTISERLKECVRPLPKHPIPRLPIKDWIELYKRNEHPEGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSETSSVSWSVMYGMPGDPNSQRLNRNATETRIHCLWNHLIETASQQTGSLIIWDTGEYEILPYQMDPSGPETDDSRSEMSEGSQVSPEEPMSDSAKLRQAFQNRKIRLRLHGTRLPKDYTITLRMDKTTDFARPIREGRKRRRRHPSRPTVPQAPSTSDSESPSPPPGKEELRGRHADADDTHNADIEIQRNNAYPGSSNTIGSIHQRRWFLSLDRESSGFEPTMINQSEGLKERGKKRTWTPKPTGGFEPFYVHGPEAERSVVTARLARDVLDDEAVEEFVPRRGWRPVMH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.38
3 0.42
4 0.43
5 0.4
6 0.41
7 0.45
8 0.5
9 0.56
10 0.56
11 0.46
12 0.44
13 0.44
14 0.39
15 0.32
16 0.25
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.21
21 0.22
22 0.26
23 0.32
24 0.37
25 0.37
26 0.42
27 0.46
28 0.51
29 0.58
30 0.63
31 0.63
32 0.67
33 0.68
34 0.63
35 0.64
36 0.59
37 0.5
38 0.43
39 0.36
40 0.27
41 0.22
42 0.19
43 0.14
44 0.13
45 0.1
46 0.08
47 0.1
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.11
73 0.14
74 0.16
75 0.17
76 0.19
77 0.23
78 0.26
79 0.29
80 0.35
81 0.39
82 0.41
83 0.46
84 0.54
85 0.57
86 0.64
87 0.66
88 0.66
89 0.62
90 0.68
91 0.69
92 0.62
93 0.65
94 0.59
95 0.59
96 0.51
97 0.53
98 0.48
99 0.47
100 0.48
101 0.49
102 0.48
103 0.47
104 0.51
105 0.48
106 0.48
107 0.5
108 0.52
109 0.45
110 0.44
111 0.39
112 0.38
113 0.42
114 0.41
115 0.34
116 0.32
117 0.3
118 0.28
119 0.29
120 0.28
121 0.21
122 0.18
123 0.16
124 0.12
125 0.13
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.1
150 0.13
151 0.16
152 0.18
153 0.21
154 0.23
155 0.29
156 0.28
157 0.35
158 0.34
159 0.34
160 0.37
161 0.35
162 0.36
163 0.31
164 0.31
165 0.24
166 0.26
167 0.25
168 0.21
169 0.2
170 0.17
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.14
175 0.12
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.19
228 0.18
229 0.2
230 0.23
231 0.3
232 0.37
233 0.46
234 0.53
235 0.51
236 0.56
237 0.6
238 0.57
239 0.55
240 0.56
241 0.53
242 0.51
243 0.54
244 0.54
245 0.54
246 0.56
247 0.51
248 0.43
249 0.38
250 0.33
251 0.3
252 0.29
253 0.26
254 0.26
255 0.25
256 0.25
257 0.24
258 0.21
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.21
265 0.23
266 0.28
267 0.36
268 0.43
269 0.5
270 0.58
271 0.67
272 0.73
273 0.79
274 0.86
275 0.87
276 0.89
277 0.91
278 0.91
279 0.9
280 0.91
281 0.89
282 0.86
283 0.77
284 0.72
285 0.63
286 0.57
287 0.49
288 0.42
289 0.38
290 0.31
291 0.31
292 0.27
293 0.26
294 0.23
295 0.26
296 0.26
297 0.23
298 0.24
299 0.26
300 0.27
301 0.31
302 0.38
303 0.39
304 0.43
305 0.46
306 0.44
307 0.46
308 0.43
309 0.4
310 0.33
311 0.33
312 0.29
313 0.29
314 0.27
315 0.21
316 0.21
317 0.19
318 0.19
319 0.16
320 0.16
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.18
326 0.17
327 0.15
328 0.16
329 0.22
330 0.21
331 0.21
332 0.2
333 0.2
334 0.21
335 0.26
336 0.29
337 0.26
338 0.31
339 0.32
340 0.33
341 0.35
342 0.37
343 0.34
344 0.38
345 0.4
346 0.38
347 0.38
348 0.38
349 0.37
350 0.34
351 0.33
352 0.23
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.21
357 0.2
358 0.2
359 0.18
360 0.2
361 0.24
362 0.26
363 0.29
364 0.27
365 0.33
366 0.41
367 0.49
368 0.53
369 0.55
370 0.63
371 0.71
372 0.75
373 0.79
374 0.79
375 0.79
376 0.79
377 0.77
378 0.74
379 0.68
380 0.61
381 0.53
382 0.49
383 0.41
384 0.38
385 0.34
386 0.27
387 0.23
388 0.22
389 0.22
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.16
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.19
398 0.18
399 0.22
400 0.22
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.22
405 0.2
406 0.18
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.12
414 0.16
415 0.16
416 0.19
417 0.25