Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YI17

Protein Details
Accession I4YI17    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-48SDHPYNRPEERPKSKTKIPRPPKSESIEHydrophilic
92-120ARREHMLKYPKYKFRPNRKHDRIAKIGTRBasic
123-145QITKTAQKTQKNHKNLKTKTPLKHydrophilic
171-196RQLRRNVKVRGERRKRCKQEEEVRTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-41PKSKTKIPRP
104-110KFRPNRK
177-185VKVRGERRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG wse:WALSEDRAFT_27096  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MENHDKDYKDDDTASISSEISDHPYNRPEERPKSKTKIPRPPKSESIEEMKNTAGTDMSKLNQTELSKMIGIKWRSENIQVKHIYQEKANEARREHMLKYPKYKFRPNRKHDRIAKIGTRTTQITKTAQKTQKNHKNLKTKTPLKQLCSSDGEGEGDDDDYDYKCSQRAERQLRRNVKVRGERRKRCKQEEEVRTVDIMRKSHHHKGSDDRYIRPGSPLLSLPDPTFTLPMEVENDMTNISTNLVHDSDLGIYDSNALVNQSDNRISFDDFAYDPEVMFAPETATNLANEWANNNYVLGTDVGVDNVIGVDNYHYINDIFGNIPTTNDIAPLPPPPSAFKYMNDMMDISSVDLGTIYQDDRVGISSSCSSSSTVSTTSTTHSLDSYDNCLPDFLNVDITEGLNDTHIGERARSLIADYYLYEEREEQQQQLQFQQEHQDIPTQQDIFKTFQRQLAETRTRVSQNMT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.2
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.17
8 0.21
9 0.2
10 0.24
11 0.3
12 0.34
13 0.38
14 0.46
15 0.5
16 0.56
17 0.64
18 0.68
19 0.72
20 0.76
21 0.8
22 0.82
23 0.83
24 0.84
25 0.85
26 0.87
27 0.84
28 0.84
29 0.84
30 0.8
31 0.75
32 0.69
33 0.65
34 0.62
35 0.56
36 0.49
37 0.42
38 0.36
39 0.3
40 0.25
41 0.19
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.16
46 0.2
47 0.2
48 0.21
49 0.24
50 0.25
51 0.25
52 0.23
53 0.25
54 0.22
55 0.22
56 0.24
57 0.27
58 0.28
59 0.3
60 0.34
61 0.34
62 0.35
63 0.44
64 0.48
65 0.44
66 0.51
67 0.48
68 0.45
69 0.49
70 0.52
71 0.45
72 0.39
73 0.41
74 0.4
75 0.47
76 0.52
77 0.49
78 0.45
79 0.47
80 0.51
81 0.49
82 0.44
83 0.43
84 0.46
85 0.47
86 0.55
87 0.61
88 0.63
89 0.66
90 0.75
91 0.78
92 0.8
93 0.85
94 0.84
95 0.86
96 0.86
97 0.9
98 0.89
99 0.87
100 0.84
101 0.81
102 0.78
103 0.72
104 0.67
105 0.58
106 0.52
107 0.46
108 0.41
109 0.37
110 0.34
111 0.34
112 0.38
113 0.41
114 0.48
115 0.52
116 0.57
117 0.61
118 0.68
119 0.73
120 0.75
121 0.8
122 0.78
123 0.81
124 0.78
125 0.81
126 0.8
127 0.79
128 0.77
129 0.78
130 0.76
131 0.7
132 0.73
133 0.65
134 0.6
135 0.56
136 0.49
137 0.39
138 0.34
139 0.29
140 0.21
141 0.19
142 0.14
143 0.09
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.22
155 0.32
156 0.41
157 0.5
158 0.59
159 0.67
160 0.74
161 0.76
162 0.77
163 0.72
164 0.7
165 0.7
166 0.7
167 0.72
168 0.74
169 0.78
170 0.8
171 0.85
172 0.85
173 0.84
174 0.84
175 0.83
176 0.82
177 0.82
178 0.79
179 0.7
180 0.62
181 0.53
182 0.45
183 0.39
184 0.32
185 0.24
186 0.18
187 0.21
188 0.27
189 0.35
190 0.4
191 0.38
192 0.38
193 0.46
194 0.52
195 0.56
196 0.53
197 0.46
198 0.45
199 0.44
200 0.41
201 0.34
202 0.27
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.15
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.08
317 0.1
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.16
323 0.2
324 0.25
325 0.26
326 0.25
327 0.3
328 0.32
329 0.32
330 0.3
331 0.26
332 0.2
333 0.19
334 0.18
335 0.11
336 0.09
337 0.08
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.17
365 0.19
366 0.19
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.18
371 0.19
372 0.22
373 0.21
374 0.21
375 0.2
376 0.21
377 0.19
378 0.17
379 0.18
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.16
398 0.16
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.15
405 0.18
406 0.2
407 0.2
408 0.19
409 0.18
410 0.19
411 0.25
412 0.27
413 0.24
414 0.28
415 0.31
416 0.33
417 0.36
418 0.41
419 0.34
420 0.35
421 0.41
422 0.37
423 0.35
424 0.34
425 0.36
426 0.3
427 0.34
428 0.38
429 0.31
430 0.3
431 0.32
432 0.34
433 0.32
434 0.37
435 0.39
436 0.36
437 0.39
438 0.42
439 0.4
440 0.43
441 0.49
442 0.52
443 0.48
444 0.47
445 0.49
446 0.48