Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6Y2I7

Protein Details
Accession A0A1V6Y2I7    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48DSDISRTQKKTKANQDPWTTSWHydrophilic
493-514LDTSQKSYHHPHHHHHHHHAEGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008397  Alginate_lyase_dom  
IPR008929  Chondroitin_lyas  
Gene Ontology GO:0042597  C:periplasmic space  
GO:0016829  F:lyase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05426  Alginate_lyase  
Amino Acid Sequences MLIFLSFVISLLPLVASFLHPGLLVSDSDISRTQKKTKANQDPWTTSWNTLTSLPFSDPSYTPSPVSVVYRGTWEDHTANAQLLWHDVAAAFNLGLRWKISRNTSCADAASNILHAWATTLISIDGGDDKYLTAGLQGYELANAAELLRDYQPFVDNVLPAVVEMANNIFIPMHYRWLNHEEPSGHNVLHFFANWELCNVASAMAMAVITDNQTVWDFAVNYFKTGDGAGAINNAITNIIEEPGTGALLGQGQESGRDQGHSALDMQLFGVIGQQAWNQGEDLFAYNDSRILRGMEYFARYNLGNDVPFIPYTNGIVSYTEVSSASRGAIRPTWELLYNHYVMMKRMDAPWTTLYLNNTLDYYDGAEGGAGSWGEGSGHYDGLGWGSLLYRMDESDVIAPFPSKSASPTVNPTPRASTTLNLAPSAMTTTPGTSGQSAPISHSTTTNFAAVSATSGTQTFVSWTIADDSRTPPFSMSSTASAITSTTLPTAPLDTSQKSYHHPHHHHHHHHAEGQAHVCHIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.07
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.14
14 0.13
15 0.16
16 0.2
17 0.23
18 0.28
19 0.34
20 0.39
21 0.42
22 0.51
23 0.59
24 0.66
25 0.73
26 0.76
27 0.8
28 0.82
29 0.82
30 0.75
31 0.71
32 0.63
33 0.53
34 0.47
35 0.39
36 0.32
37 0.29
38 0.28
39 0.24
40 0.25
41 0.24
42 0.22
43 0.23
44 0.25
45 0.22
46 0.25
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.25
51 0.24
52 0.22
53 0.25
54 0.22
55 0.19
56 0.18
57 0.21
58 0.22
59 0.23
60 0.22
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.23
65 0.21
66 0.2
67 0.17
68 0.16
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.11
85 0.14
86 0.19
87 0.28
88 0.32
89 0.36
90 0.38
91 0.41
92 0.4
93 0.37
94 0.34
95 0.26
96 0.22
97 0.18
98 0.16
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.1
159 0.1
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.2
164 0.26
165 0.28
166 0.25
167 0.28
168 0.25
169 0.26
170 0.29
171 0.27
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.12
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.11
282 0.1
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.12
317 0.15
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.22
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.18
330 0.2
331 0.17
332 0.14
333 0.15
334 0.18
335 0.16
336 0.19
337 0.19
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.08
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.08
391 0.1
392 0.14
393 0.17
394 0.19
395 0.26
396 0.34
397 0.4
398 0.42
399 0.42
400 0.43
401 0.41
402 0.43
403 0.39
404 0.31
405 0.29
406 0.32
407 0.31
408 0.26
409 0.24
410 0.19
411 0.18
412 0.2
413 0.15
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.18
424 0.17
425 0.19
426 0.22
427 0.24
428 0.23
429 0.24
430 0.23
431 0.23
432 0.25
433 0.22
434 0.18
435 0.15
436 0.15
437 0.13
438 0.13
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.15
452 0.17
453 0.18
454 0.19
455 0.21
456 0.25
457 0.27
458 0.27
459 0.23
460 0.23
461 0.24
462 0.25
463 0.25
464 0.23
465 0.22
466 0.22
467 0.22
468 0.2
469 0.18
470 0.16
471 0.13
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.11
476 0.12
477 0.14
478 0.13
479 0.17
480 0.22
481 0.23
482 0.27
483 0.3
484 0.32
485 0.36
486 0.43
487 0.48
488 0.54
489 0.58
490 0.63
491 0.71
492 0.79
493 0.82
494 0.84
495 0.83
496 0.78
497 0.76
498 0.71
499 0.64
500 0.57
501 0.53
502 0.44