Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4Y5D3

Protein Details
Accession I4Y5D3    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-128IVLPNRPGRKPSRHNQQKKELKQKSPVSSHydrophilic
316-341DERERAPSRGYKKRRRETDESNNEESBasic
356-385ATSSRKDKNLQSPHKRKTVAREKDKKNSYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-132RPGRKPSRHNQQKKELKQKSPVSSSRRR
255-290KPRSRSDPRAAAPRGRGGKRKDNGRNSAAVKARNKE
320-331RAPSRGYKKRRR
360-379RKDKNLQSPHKRKTVAREKD
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG wse:WALSEDRAFT_61610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15550  PHD_MLL5  
Amino Acid Sequences MDQDVDLNSDNAPIEPDEEQKPKEEHEEEEEEEEEEEEGEGGSGETRCVCGSTDEESYGFMIQCETCGCWQHGVCVGLVDEKYAPDTYYCEQCRPELHPIVLPNRPGRKPSRHNQQKKELKQKSPVSSSRRRSSSSNDAQERVRSPKRRSTLNSRDAAYDDAIAASLLSVQNDNLRAQIAEREKQRWVQYGGQVTPSQNDDENGNIEQIEEQTVAEDHDGDKVPENEREREREHEHEQEREPSREKHIDGEADYKPRSRSDPRAAAPRGRGGKRKDNGRNSAAVKARNKEKSVVNDDEEKTDSNRRSGSPNSAPADERERAPSRGYKKRRRETDESNNEESGFTPPTTANGPRRAATSSRKDKNLQSPHKRKTVAREKDKKNSYDDESSLTWGLPDHLQHLSHMLPSETPEMLALRIPHGDTIDIVREMPTRVKFPTKRMPIGEMKRRVRSVLEYTESPAESIQMLDNITRELIRFNERFSTNAKRREEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.19
4 0.23
5 0.28
6 0.3
7 0.33
8 0.35
9 0.35
10 0.41
11 0.4
12 0.37
13 0.39
14 0.43
15 0.4
16 0.41
17 0.38
18 0.31
19 0.28
20 0.25
21 0.18
22 0.12
23 0.1
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.17
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.19
46 0.17
47 0.12
48 0.12
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.24
59 0.28
60 0.27
61 0.24
62 0.22
63 0.21
64 0.19
65 0.19
66 0.17
67 0.12
68 0.12
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.1
73 0.15
74 0.16
75 0.25
76 0.27
77 0.28
78 0.29
79 0.31
80 0.34
81 0.36
82 0.41
83 0.37
84 0.36
85 0.36
86 0.4
87 0.43
88 0.43
89 0.42
90 0.41
91 0.44
92 0.45
93 0.47
94 0.51
95 0.56
96 0.61
97 0.67
98 0.71
99 0.74
100 0.82
101 0.85
102 0.88
103 0.88
104 0.89
105 0.91
106 0.88
107 0.84
108 0.84
109 0.83
110 0.8
111 0.78
112 0.76
113 0.73
114 0.74
115 0.76
116 0.74
117 0.7
118 0.65
119 0.6
120 0.6
121 0.62
122 0.61
123 0.62
124 0.57
125 0.55
126 0.54
127 0.55
128 0.51
129 0.49
130 0.48
131 0.47
132 0.49
133 0.55
134 0.58
135 0.62
136 0.65
137 0.67
138 0.69
139 0.7
140 0.68
141 0.61
142 0.57
143 0.5
144 0.45
145 0.35
146 0.24
147 0.15
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.06
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.16
166 0.18
167 0.22
168 0.25
169 0.27
170 0.29
171 0.34
172 0.36
173 0.34
174 0.35
175 0.34
176 0.36
177 0.39
178 0.37
179 0.35
180 0.34
181 0.29
182 0.26
183 0.23
184 0.19
185 0.14
186 0.14
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.12
210 0.14
211 0.18
212 0.21
213 0.24
214 0.26
215 0.3
216 0.3
217 0.33
218 0.36
219 0.37
220 0.38
221 0.41
222 0.41
223 0.41
224 0.4
225 0.43
226 0.41
227 0.39
228 0.38
229 0.31
230 0.35
231 0.34
232 0.33
233 0.28
234 0.27
235 0.26
236 0.24
237 0.27
238 0.23
239 0.23
240 0.23
241 0.22
242 0.21
243 0.21
244 0.25
245 0.25
246 0.31
247 0.36
248 0.43
249 0.44
250 0.52
251 0.53
252 0.52
253 0.48
254 0.47
255 0.45
256 0.41
257 0.45
258 0.42
259 0.5
260 0.51
261 0.59
262 0.62
263 0.63
264 0.66
265 0.62
266 0.62
267 0.54
268 0.56
269 0.5
270 0.47
271 0.42
272 0.41
273 0.46
274 0.45
275 0.44
276 0.42
277 0.42
278 0.44
279 0.47
280 0.45
281 0.4
282 0.42
283 0.41
284 0.39
285 0.35
286 0.29
287 0.24
288 0.27
289 0.26
290 0.22
291 0.23
292 0.23
293 0.26
294 0.28
295 0.33
296 0.32
297 0.37
298 0.37
299 0.37
300 0.36
301 0.34
302 0.37
303 0.3
304 0.27
305 0.27
306 0.27
307 0.27
308 0.29
309 0.34
310 0.36
311 0.45
312 0.55
313 0.58
314 0.66
315 0.75
316 0.82
317 0.84
318 0.83
319 0.83
320 0.84
321 0.84
322 0.8
323 0.74
324 0.65
325 0.57
326 0.48
327 0.39
328 0.3
329 0.22
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.16
335 0.21
336 0.24
337 0.3
338 0.32
339 0.31
340 0.33
341 0.35
342 0.36
343 0.39
344 0.44
345 0.47
346 0.51
347 0.56
348 0.58
349 0.62
350 0.67
351 0.7
352 0.7
353 0.71
354 0.75
355 0.77
356 0.82
357 0.79
358 0.72
359 0.72
360 0.72
361 0.72
362 0.72
363 0.76
364 0.76
365 0.82
366 0.86
367 0.78
368 0.73
369 0.68
370 0.64
371 0.59
372 0.52
373 0.46
374 0.39
375 0.38
376 0.32
377 0.26
378 0.2
379 0.14
380 0.15
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.14
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.16
389 0.16
390 0.17
391 0.14
392 0.12
393 0.15
394 0.17
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.12
409 0.15
410 0.17
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.17
415 0.18
416 0.24
417 0.23
418 0.23
419 0.27
420 0.37
421 0.4
422 0.47
423 0.55
424 0.58
425 0.62
426 0.63
427 0.66
428 0.66
429 0.72
430 0.73
431 0.73
432 0.72
433 0.72
434 0.71
435 0.66
436 0.59
437 0.56
438 0.53
439 0.52
440 0.49
441 0.42
442 0.44
443 0.46
444 0.43
445 0.36
446 0.28
447 0.21
448 0.16
449 0.16
450 0.13
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.13
460 0.16
461 0.23
462 0.24
463 0.26
464 0.33
465 0.34
466 0.36
467 0.39
468 0.46
469 0.46
470 0.54
471 0.57
472 0.53