Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1C6

Protein Details
Accession C4R1C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34DTTGKPKYGRNKQLGAKLKRHydrophilic
457-486VPDKKGKQTALQRHMRKKTQNDLEERRLRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-40GRNKQLGAKLKRYGRERK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0655  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSVEGTRNVGSSSLDTTGKPKYGRNKQLGAKLKRYGRERKEALEAARRTDILLQEEPGFLEPENEMEKTYEITQKDLRENVDIGTAAKGFELKLKDYGPYSIDYSRNGRELLIVGKKGHVASIDWKKGQLNTELHLNETCHAIKALHNDQFFAVAQKKYTFIYDKLGTEIHRMKQHIEATSLEFLPYHFLLVTAGQTGVIKYQDVSTGTLVAELKTKMGPTLSMTQNPWNAVINCGHSNGAVTLWSPSMPTPLVKIQASIAPVRALAVNREGNYMAVASSDRTVKIWDIRTYKEVDTYITPIPATSLDISDTGLLSVGWGPHTTVWKDIFKKRQDHPYMTHQIRGSRVQSTKFVPFEDILGVGHASGFSSLIIPGAGEANFDAWEINPYESAQQRQQNEVRALINKLQPEMITLDPNVIGTVDTAVKQKSMLPDDDEEKDAEDKEPGDEEPKLDRYVPDKKGKQTALQRHMRKKTQNDLEERRLRTERNLKREQELNGRQDHGEELQNPALDRFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.21
4 0.26
5 0.3
6 0.3
7 0.34
8 0.41
9 0.51
10 0.61
11 0.65
12 0.69
13 0.7
14 0.78
15 0.82
16 0.79
17 0.77
18 0.75
19 0.74
20 0.73
21 0.74
22 0.75
23 0.73
24 0.75
25 0.71
26 0.68
27 0.7
28 0.67
29 0.65
30 0.64
31 0.57
32 0.51
33 0.5
34 0.45
35 0.38
36 0.37
37 0.34
38 0.29
39 0.29
40 0.26
41 0.25
42 0.25
43 0.25
44 0.22
45 0.19
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.13
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.19
57 0.22
58 0.2
59 0.24
60 0.28
61 0.32
62 0.37
63 0.38
64 0.36
65 0.34
66 0.34
67 0.3
68 0.28
69 0.23
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.19
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.25
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.29
92 0.3
93 0.31
94 0.29
95 0.25
96 0.21
97 0.21
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.23
102 0.24
103 0.26
104 0.25
105 0.24
106 0.18
107 0.14
108 0.21
109 0.3
110 0.35
111 0.33
112 0.35
113 0.36
114 0.38
115 0.39
116 0.38
117 0.3
118 0.26
119 0.33
120 0.32
121 0.32
122 0.31
123 0.28
124 0.21
125 0.22
126 0.21
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.2
132 0.26
133 0.28
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.29
138 0.26
139 0.23
140 0.21
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.21
147 0.21
148 0.18
149 0.24
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.26
154 0.24
155 0.26
156 0.3
157 0.28
158 0.29
159 0.3
160 0.3
161 0.34
162 0.37
163 0.32
164 0.3
165 0.27
166 0.25
167 0.26
168 0.25
169 0.19
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.16
209 0.17
210 0.2
211 0.21
212 0.24
213 0.26
214 0.26
215 0.24
216 0.2
217 0.18
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.14
273 0.17
274 0.22
275 0.24
276 0.26
277 0.28
278 0.31
279 0.3
280 0.28
281 0.24
282 0.2
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.15
287 0.14
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.08
309 0.11
310 0.12
311 0.14
312 0.18
313 0.23
314 0.28
315 0.35
316 0.42
317 0.46
318 0.52
319 0.54
320 0.61
321 0.62
322 0.62
323 0.6
324 0.61
325 0.64
326 0.58
327 0.58
328 0.49
329 0.45
330 0.43
331 0.43
332 0.35
333 0.32
334 0.34
335 0.32
336 0.34
337 0.35
338 0.37
339 0.34
340 0.32
341 0.27
342 0.24
343 0.23
344 0.2
345 0.17
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.14
377 0.17
378 0.2
379 0.25
380 0.29
381 0.31
382 0.38
383 0.41
384 0.44
385 0.44
386 0.43
387 0.4
388 0.37
389 0.38
390 0.36
391 0.36
392 0.3
393 0.29
394 0.26
395 0.23
396 0.22
397 0.22
398 0.18
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.13
405 0.1
406 0.08
407 0.06
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.16
416 0.2
417 0.24
418 0.25
419 0.26
420 0.3
421 0.34
422 0.36
423 0.34
424 0.28
425 0.26
426 0.25
427 0.22
428 0.19
429 0.17
430 0.15
431 0.15
432 0.16
433 0.15
434 0.17
435 0.17
436 0.18
437 0.22
438 0.25
439 0.25
440 0.25
441 0.27
442 0.3
443 0.39
444 0.45
445 0.49
446 0.53
447 0.58
448 0.66
449 0.66
450 0.69
451 0.69
452 0.72
453 0.72
454 0.75
455 0.78
456 0.79
457 0.85
458 0.85
459 0.84
460 0.82
461 0.83
462 0.83
463 0.82
464 0.82
465 0.82
466 0.83
467 0.83
468 0.77
469 0.74
470 0.68
471 0.62
472 0.62
473 0.63
474 0.62
475 0.64
476 0.7
477 0.67
478 0.69
479 0.72
480 0.69
481 0.69
482 0.68
483 0.65
484 0.6
485 0.59
486 0.53
487 0.48
488 0.44
489 0.36
490 0.33
491 0.28
492 0.29
493 0.29
494 0.31
495 0.3