Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4Y6C9

Protein Details
Accession I4Y6C9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-210LEEDDQKKKKRKKDLSTAKNMSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-200KKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG wse:WALSEDRAFT_12543  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences TSRMSNNPAESQKGTDVRSLIDAVGNAGVDIEAEHEAILQSNDILQSRYANSIRQQRAHTQDFLNNAILRDKIRAAAAPHQLQRVDEDCLQFLALATQARLRHLVELMIQANYHRCSSSHIVEPTTLPNGTPLYSQEIRTDVDKQLQALEKIEREQETKARRQRVERITQEREQMHLIQSQQQQQQFLEEDDQKKKKRKKDLSTAKNMSDDVQKKLSDQTALRSAGLAPKYSWLTGTSASSTPKGSSNLPKPKFQPQQSNLSIKSSQQKILGPPPHDAHLGHGNININDALFALEREKGMGAGRGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.35
4 0.31
5 0.31
6 0.28
7 0.21
8 0.18
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.14
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.28
39 0.38
40 0.43
41 0.46
42 0.48
43 0.5
44 0.57
45 0.58
46 0.55
47 0.48
48 0.46
49 0.44
50 0.42
51 0.38
52 0.31
53 0.27
54 0.25
55 0.23
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.18
63 0.24
64 0.31
65 0.34
66 0.36
67 0.37
68 0.37
69 0.34
70 0.35
71 0.29
72 0.26
73 0.23
74 0.21
75 0.19
76 0.19
77 0.18
78 0.15
79 0.12
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.11
102 0.11
103 0.16
104 0.2
105 0.23
106 0.26
107 0.26
108 0.26
109 0.26
110 0.27
111 0.24
112 0.21
113 0.18
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.14
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.15
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.19
144 0.23
145 0.3
146 0.35
147 0.41
148 0.43
149 0.47
150 0.55
151 0.57
152 0.61
153 0.62
154 0.64
155 0.62
156 0.62
157 0.62
158 0.53
159 0.47
160 0.39
161 0.32
162 0.25
163 0.22
164 0.2
165 0.21
166 0.24
167 0.29
168 0.31
169 0.31
170 0.31
171 0.28
172 0.3
173 0.24
174 0.21
175 0.2
176 0.21
177 0.24
178 0.31
179 0.38
180 0.42
181 0.51
182 0.57
183 0.61
184 0.67
185 0.73
186 0.75
187 0.79
188 0.84
189 0.84
190 0.88
191 0.85
192 0.76
193 0.67
194 0.58
195 0.48
196 0.46
197 0.38
198 0.31
199 0.3
200 0.28
201 0.27
202 0.3
203 0.3
204 0.26
205 0.24
206 0.25
207 0.28
208 0.29
209 0.28
210 0.25
211 0.23
212 0.24
213 0.25
214 0.21
215 0.15
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.19
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.23
233 0.3
234 0.39
235 0.48
236 0.5
237 0.55
238 0.56
239 0.64
240 0.69
241 0.67
242 0.68
243 0.62
244 0.69
245 0.69
246 0.73
247 0.64
248 0.59
249 0.53
250 0.46
251 0.5
252 0.44
253 0.41
254 0.37
255 0.4
256 0.4
257 0.49
258 0.52
259 0.45
260 0.47
261 0.46
262 0.45
263 0.43
264 0.38
265 0.33
266 0.34
267 0.33
268 0.29
269 0.29
270 0.3
271 0.28
272 0.3
273 0.25
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.13